18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0260 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0260  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  550  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000397247  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0396  hypothetical protein  55.35 
 
 		 273 aa  199  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.967914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0306  hypothetical protein  45.7 
 
 		 280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129036  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3843  hypothetical protein  38.36 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00510604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3647  hypothetical protein  38.99 
 
 		 305 aa  165  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000449942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4040  hypothetical protein  39.27 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.747352  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0297  hypothetical protein  38.14 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4158  hypothetical protein  39.53 
 
 		 278 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00164338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3963  hypothetical protein  39.19 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4065  hypothetical protein  38.85 
 
 		 278 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0398586  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0326  hypothetical protein  35.65 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0405  hypothetical protein  34.49 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0143721  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3661  hypothetical protein  37.15 
 
 		 293 aa  136  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00533969  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3325  hypothetical protein  50.74 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000609082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0281  hypothetical protein  50 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4197  hypothetical protein  48.94 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.495069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  26.87 
 
 		 938 aa  47.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  28.68 
 
 		 3242 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>