More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0077 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0077  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 317 aa  644    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4413  GCN5-related N-acetyltransferase  59.66 
 
 		 185 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.275989 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1047  GCN5-related N-acetyltransferase  63.79 
 
 		 194 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000813755  hitchhiker  0.000000247911 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4801  GCN5-related N-acetyltransferase  57.3 
 
 		 182 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0368594 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3530  GCN5-related N-acetyltransferase  63.79 
 
 		 194 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  63.79 
 
 		 194 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083248  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3405  GCN5-related N-acetyltransferase  63.79 
 
 		 194 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000780456  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0961  GCN5-related N-acetyltransferase  61.49 
 
 		 197 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0164195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0999  GCN5-related N-acetyltransferase  61.49 
 
 		 197 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303176  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  61.76 
 
 		 197 aa  212  7e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00275714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3517  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  57.3 
 
 		 186 aa  202  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  58.08 
 
 		 198 aa  193  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2004  acetyltransferase  53.01 
 
 		 210 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.930496  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2024  acetyltransferase  54.07 
 
 		 210 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2160  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  54.07 
 
 		 209 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3354  GCN5-related N-acetyltransferase  63.85 
 
 		 131 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1021  GCN5-related N-acetyltransferase  63.85 
 
 		 131 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.457059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3270  GCN5-related N-acetyltransferase  62.99 
 
 		 131 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1009  GCN5-related N-acetyltransferase  63.08 
 
 		 131 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0987  GCN5-related N-acetyltransferase  62.31 
 
 		 131 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4800  GCN5-related N-acetyltransferase  65.12 
 
 		 133 aa  162  9e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0178768 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0320  GCN5-related N-acetyltransferase  44.26 
 
 		 199 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.810608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3204  GCN5-related N-acetyltransferase  40.45 
 
 		 183 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.925603  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0023  GCN5-related N-acetyltransferase  42.46 
 
 		 187 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2973  GCN5-related N-acetyltransferase  36.21 
 
 		 176 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0472391 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03206  hypothetical protein  46.88 
 
 		 136 aa  125  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2395  GCN5-related N-acetyltransferase  46.88 
 
 		 133 aa  119  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.935665  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2441  GCN5-related N-acetyltransferase  46.88 
 
 		 133 aa  119  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1963  acetyltransferase  48.31 
 
 		 133 aa  112  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010494  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4586  GCN5-related N-acetyltransferase  38.55 
 
 		 184 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1374  GCN5-related N-acetyltransferase  38.15 
 
 		 187 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  37.7 
 
 		 204 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1192  GCN5-related N-acetyltransferase  41.34 
 
 		 181 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0681319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4461  GCN5-related N-acetyltransferase  38.07 
 
 		 186 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0216912  normal  0.010687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5000  GCN5-related N-acetyltransferase  37.21 
 
 		 185 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696627  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3234  GCN5-related N-acetyltransferase  36.26 
 
 		 185 aa  105  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.812854  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1976  GCN5-related N-acetyltransferase  44.54 
 
 		 146 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0638  GCN5-related N-acetyltransferase  44.7 
 
 		 139 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2400  GCN5-related N-acetyltransferase  42.74 
 
 		 138 aa  103  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380726  normal  0.576848 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3043  GCN5-related N-acetyltransferase  34.86 
 
 		 196 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1072  GCN5-related N-acetyltransferase  42.64 
 
 		 132 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3298  GCN5-related N-acetyltransferase  43.51 
 
 		 137 aa  99  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5169  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  32.37 
 
 		 173 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5179  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  31.4 
 
 		 173 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4749  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  32.16 
 
 		 179 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5164  acetyltransferase, putative  30.23 
 
 		 181 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4024  GCN5-related N-acetyltransferase  40.46 
 
 		 136 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0079  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  30.59 
 
 		 173 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4734  acetytransferase  30.81 
 
 		 173 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002775  hypothetical protein  53.25 
 
 		 83 aa  91.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.888524  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  34.43 
 
 		 198 aa  90.9  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  34.24 
 
 		 193 aa  90.9  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12990  acetyltransferase (GNAT) family protein  39.53 
 
 		 139 aa  89  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1567  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 		 193 aa  89  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 		 180 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19970  acetyltransferase  43.08 
 
 		 151 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.310299  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23000  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  34.64 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.713177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4783  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.85 
 
 		 139 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000302728  hitchhiker  0.00000145166 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2132  GCN5-related protein N-acetyltransferase  37.21 
 
 		 138 aa  84  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.56873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  28.32 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2631  GCN5-related protein N-acetyltransferase  32.81 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.985562 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  34.48 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3402  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.774509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0543  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.33 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2474  acetyltransferase, GNAT family  29.31 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4885  acetyltransferase  38.52 
 
 		 141 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  32.77 
 
 		 186 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  34.86 
 
 		 183 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1649  GCN5-related N-acetyltransferase  31.46 
 
 		 178 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2859  acetyltransferase, GNAT family  28.74 
 
 		 168 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464219 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1509  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 		 185 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3116  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3284  acetyltransferase, GNAT family  28.16 
 
 		 168 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5251  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0850928  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2752  acetyltransferase  27.95 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5249  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  30.9 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135635  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1794  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000157192  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2358  acetyltransferase  28.16 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.503993  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2534  acetyltransferase  28.16 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.178562  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1634  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 		 178 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2709  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 		 178 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000725277 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2974  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 		 183 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  30.06 
 
 		 196 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5022  GCN5-related N-acetyltransferase  29.76 
 
 		 178 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  34.27 
 
 		 205 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  46.51 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1189  GCN5-related N-acetyltransferase  40.34 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0597607  normal  0.666757 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3916  GCN5-related N-acetyltransferase  29.31 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.229048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1906  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.537884  hitchhiker  0.0000285957 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3462  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5139  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 		 178 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.124755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  34.71 
 
 		 179 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2798  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 		 176 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2636  GCN5-related N-acetyltransferase  35.77 
 
 		 137 aa  75.5  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  29.44 
 
 		 178 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.121319  unclonable  0.0000303298 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1445  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 		 192 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0179041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1580  GCN5-related N-acetyltransferase  28.49 
 
 		 178 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125256  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3179  GCN5-related N-acetyltransferase  31.61 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  28.22 
 
 		 175 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>