31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0062 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0062  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  133  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4418  hypothetical protein  81.54 
 
 		 65 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4130  formate dehydrogenase region TAT target  81.25 
 
 		 65 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4810  formate dehydrogenase region TAT target  80 
 
 		 65 aa  107  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.202852 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4134  formate dehydrogenase region TAT target  79.69 
 
 		 65 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0230  formate dehydrogenase region TAT target  69.7 
 
 		 66 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.202106 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4227  formate dehydrogenase region TAT target  69.7 
 
 		 66 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4139  hypothetical protein  69.7 
 
 		 66 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4109  formate dehydrogenase region TAT target  68.18 
 
 		 66 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3723  twin-arginine translocation pathway signal  66.67 
 
 		 66 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3794  twin-arginine translocation pathway signal  66.67 
 
 		 66 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3919  hypothetical protein  66.67 
 
 		 66 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768927 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0334  twin-arginine translocation pathway signal  63.64 
 
 		 66 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4512  hypothetical protein  66.67 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0058  twin-arginine translocation pathway signal  52.31 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4422  twin-arginine translocation pathway signal  47.69 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3610  hypothetical protein  43.75 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4814  formate dehydrogenase region TAT target  46.88 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.668008 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1452  hypothetical protein  46.15 
 
 		 65 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4138  formate dehydrogenase region TAT target  52.31 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0338  hypothetical protein  46.15 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1121  hypothetical protein  44.62 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4223  formate dehydrogenase region TAT target  42.86 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235438 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0056  twin-arginine translocation pathway signal  44.44 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0234  formate dehydrogenase region TAT target  42.86 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376075 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4105  formate dehydrogenase region TAT target  42.86 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4508  hypothetical protein  46.03 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4135  hypothetical protein  42.86 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.964966  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3915  hypothetical protein  46.03 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3719  twin-arginine translocation pathway signal  46.03 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3790  twin-arginine translocation pathway signal  44.44 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.973838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>