More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0047 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0047  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  100 
 
 
255 aa  525  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4770  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  81.05 
 
 
256 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0127  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  79.44 
 
 
256 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  78 
 
 
252 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0134  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  78.09 
 
 
255 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4224  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  77.29 
 
 
255 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0135  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  76.89 
 
 
255 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4378  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  77.42 
 
 
261 aa  412  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  77.29 
 
 
255 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0131  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  79.68 
 
 
253 aa  407  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000839209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0125  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  80.08 
 
 
253 aa  407  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0188818 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0096  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  74.3 
 
 
256 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  79.28 
 
 
253 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378887 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0137  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  78.49 
 
 
253 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0113  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  68.27 
 
 
255 aa  371  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0137  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  72.58 
 
 
254 aa  363  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2816  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  63.67 
 
 
249 aa  347  9e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2522  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  63.67 
 
 
249 aa  347  9e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2548  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  60.41 
 
 
252 aa  331  6e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00793  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  64.08 
 
 
249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0884  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  64.08 
 
 
249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00810  hypothetical protein  64.08 
 
 
249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0897  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  64.08 
 
 
249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2818  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  64.08 
 
 
249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0560  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  63.16 
 
 
254 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2453  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  58.78 
 
 
253 aa  325  6e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0913  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  63.67 
 
 
249 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0975  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  63.67 
 
 
249 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0996  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  63.67 
 
 
249 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0851  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  62.45 
 
 
249 aa  322  5e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0946  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  63.67 
 
 
249 aa  322  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0976  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  62.86 
 
 
249 aa  321  6e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0886  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  63.27 
 
 
249 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1546  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  60 
 
 
251 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1931  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  58.78 
 
 
249 aa  316  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3001  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  62.3 
 
 
256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.271778  hitchhiker  0.00000961274 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2481  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  62.3 
 
 
256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2579  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  62.3 
 
 
256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000483  molybdopterin biosynthesis protein B  58.06 
 
 
249 aa  310  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.937598  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1320  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  60.82 
 
 
250 aa  298  8e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.253397  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2977  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  59.18 
 
 
250 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1488  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  59.18 
 
 
250 aa  288  6e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0912  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  55.04 
 
 
242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06237  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  54.84 
 
 
236 aa  281  5.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2536  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  49.4 
 
 
256 aa  270  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424886  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50.4 
 
 
254 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61670  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.42 
 
 
252 aa  263  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1111  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50.2 
 
 
259 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1062  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  49.6 
 
 
253 aa  260  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2358  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.63 
 
 
248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03864  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50.63 
 
 
244 aa  257  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.39 
 
 
253 aa  255  4e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0387  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold protein  49.8 
 
 
257 aa  254  6e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0763  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  49.39 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0660  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  45.75 
 
 
252 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0183  HesA/MoeB/ThiF family protein  45.75 
 
 
252 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3210  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  45.75 
 
 
252 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0476  HesA/MoeB/ThiF family protein  45.75 
 
 
252 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1409  HesA/MoeB/ThiF family protein  45.75 
 
 
252 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0495  HesA/MoeB/ThiF family protein  45.75 
 
 
252 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2836  HesA/MoeB/ThiF family protein  45.75 
 
 
252 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0414  HesA/MoeB/ThiF family protein  45.34 
 
 
274 aa  245  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665894  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6188  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  45.38 
 
 
271 aa  244  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46 
 
 
250 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.318137 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2245  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  46 
 
 
250 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2859  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46 
 
 
250 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.34 
 
 
252 aa  241  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2776  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.16 
 
 
250 aa  241  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4183  putative molybdopterin biosynthesis protein  44.53 
 
 
252 aa  241  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.8 
 
 
252 aa  240  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.853411  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4454  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50.61 
 
 
251 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0444  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.2 
 
 
250 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441495  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.76 
 
 
250 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0519  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding fold protein  48.78 
 
 
245 aa  239  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.19 
 
 
249 aa  239  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41450  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50.2 
 
 
252 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0735  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  49.8 
 
 
251 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4746  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.18 
 
 
251 aa  238  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159527  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0951  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50.2 
 
 
259 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1083  putative molybdopterin biosynthesis protein  46.15 
 
 
254 aa  237  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.365488  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1118  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  44.94 
 
 
250 aa  236  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3507  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.34 
 
 
254 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0606  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  44.13 
 
 
253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3860  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.15 
 
 
251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  47.15 
 
 
257 aa  234  7e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0776  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.58 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0085  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  48.78 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.58 
 
 
260 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296557  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  45.67 
 
 
392 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2830  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.94 
 
 
254 aa  231  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0884  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  46.59 
 
 
259 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0951  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.59 
 
 
272 aa  229  4e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00521597  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0302  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.15 
 
 
249 aa  228  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1970  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  46.15 
 
 
269 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014844  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.2 
 
 
266 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2100  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.5 
 
 
251 aa  226  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0652  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  44.35 
 
 
251 aa  225  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.522282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.35 
 
 
251 aa  225  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1945  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.92 
 
 
350 aa  224  9e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0410103  decreased coverage  0.00836902 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1000  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.49 
 
 
247 aa  224  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>