More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0037 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
272 aa  546  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4761  phosphoesterase PA-phosphatase related  50 
 
 
280 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000159664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  52.3 
 
 
279 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  49.21 
 
 
273 aa  210  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0148  hypothetical protein  43.48 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2515  hypothetical protein  40.88 
 
 
296 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00069207  normal  0.734956 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  32.71 
 
 
812 aa  94.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1412  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.73 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98368  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0547  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.99 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0347407  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4447  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.13 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.626562  hitchhiker  0.00229166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3550  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.46 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1131  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.31 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1037  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.71 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000361007  hitchhiker  0.00000179156 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.78 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0918  PAP2 family protein  42.71 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.791764  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.78 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.64 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.22 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.03 
 
 
169 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3620  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.77 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000326063 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1504  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.28 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1042  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.26 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.81 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.21 
 
 
194 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  36.7 
 
 
357 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3097  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.34 
 
 
222 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.56 
 
 
178 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.56 
 
 
178 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  37 
 
 
364 aa  62.4  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4001  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.78 
 
 
200 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.794332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 
359 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  38.89 
 
 
359 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  33.6 
 
 
358 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.35 
 
 
179 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.9 
 
 
199 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.24 
 
 
227 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0979  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.75 
 
 
194 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000896993 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.63 
 
 
182 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1103  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.66 
 
 
175 aa  59.7  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4469  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.45 
 
 
251 aa  58.9  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  35.63 
 
 
185 aa  58.9  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.98 
 
 
176 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1778  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.01 
 
 
182 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
176 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1246  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.24 
 
 
331 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.656269 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  35.29 
 
 
358 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.14 
 
 
157 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  31.43 
 
 
182 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0992  PAP2 family protein  28.31 
 
 
204 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3046  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.64 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.560501  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0994  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.52 
 
 
198 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485972  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1039  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.27 
 
 
183 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  28.89 
 
 
185 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3685  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.58 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000286465  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1506  hypothetical protein  37.14 
 
 
204 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.52 
 
 
198 aa  57  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.52 
 
 
198 aa  57  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8629  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1477  hypothetical protein  37.14 
 
 
204 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769795  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2504  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.87 
 
 
331 aa  57  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.104215  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.99 
 
 
305 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0868  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.52 
 
 
198 aa  57  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1897  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.85 
 
 
176 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1644  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.5 
 
 
201 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126989  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.58 
 
 
174 aa  57  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.58 
 
 
199 aa  56.6  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.59 
 
 
170 aa  56.6  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5285  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.5 
 
 
201 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.965621  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03667  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.94 
 
 
230 aa  56.2  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.84 
 
 
171 aa  56.6  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00808  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.52 
 
 
198 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2801  Undecaprenyl-diphosphatase  29.52 
 
 
198 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185163  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00825  hypothetical protein  29.52 
 
 
198 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2801  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.52 
 
 
198 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.907509 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  35.16 
 
 
178 aa  55.8  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0902  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.52 
 
 
198 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0843231  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.56 
 
 
241 aa  55.5  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3095  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.43 
 
 
255 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1672  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.44 
 
 
244 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2676  bacitracin transport permease protein bcrc  23.78 
 
 
199 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.34 
 
 
205 aa  55.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.39 
 
 
360 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2990  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.43 
 
 
255 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2317  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.57 
 
 
187 aa  53.9  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2814  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000029245  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5970  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.64 
 
 
212 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3219  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.29 
 
 
230 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1773  PAP2 superfamily protein  48.44 
 
 
445 aa  53.9  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.51 
 
 
201 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0167377 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001653  membrane-associated phospholipid phosphatase  34.58 
 
 
182 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2128  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.38 
 
 
199 aa  53.5  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.167938  normal  0.900368 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1888  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.57 
 
 
192 aa  53.5  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.871384  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2147  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.23 
 
 
178 aa  53.5  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.913624  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2555  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.71 
 
 
271 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.729938  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  33.63 
 
 
439 aa  53.1  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0079  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.23 
 
 
234 aa  52.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0964156  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1565  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.29 
 
 
225 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2905  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.1 
 
 
255 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0219  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.79 
 
 
219 aa  52.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237278 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2733  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.99 
 
 
172 aa  52  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2329  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.19 
 
 
182 aa  52.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>