220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0034 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  100 
 
 
267 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  60.46 
 
 
264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0136  methyltransferase type 12  56.67 
 
 
267 aa  322  4e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  58.02 
 
 
255 aa  318  6e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  58.4 
 
 
255 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  58.02 
 
 
255 aa  317  9e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  58.02 
 
 
255 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  58.02 
 
 
255 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  57.63 
 
 
255 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  57.25 
 
 
255 aa  315  5e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  55.26 
 
 
264 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  57.25 
 
 
255 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  56.87 
 
 
255 aa  310  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  52.99 
 
 
263 aa  292  3e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  51.71 
 
 
261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  53.23 
 
 
257 aa  277  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  48.53 
 
 
266 aa  263  2e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  46.86 
 
 
269 aa  226  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  43.57 
 
 
268 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7730  Methyltransferase type 12  38.32 
 
 
276 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2116  Methyltransferase type 12  37.18 
 
 
279 aa  171  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  33.92 
 
 
283 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  34.43 
 
 
280 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  37.09 
 
 
276 aa  159  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  38.81 
 
 
283 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  39.16 
 
 
283 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  37.09 
 
 
273 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  37.09 
 
 
273 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  35.27 
 
 
272 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  36.13 
 
 
273 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  36.82 
 
 
292 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  35.97 
 
 
277 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  32.73 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  33.22 
 
 
294 aa  145  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2574  methyltransferase type 12  34.03 
 
 
281 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  36.14 
 
 
285 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  32.53 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  35.79 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  35.79 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  35.09 
 
 
285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0427  Methyltransferase type 12  35.09 
 
 
283 aa  135  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.919654 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1928  Methyltransferase type 12  37.66 
 
 
294 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0327812  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  31.8 
 
 
309 aa  112  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  29.75 
 
 
268 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3834  methyltransferase type 11  29.18 
 
 
269 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0830  hypothetical protein  47.76 
 
 
159 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0563869  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  29.93 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  27.17 
 
 
270 aa  89.4  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  27.17 
 
 
270 aa  89  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  28.83 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  28.94 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  29 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  28.83 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  28.83 
 
 
251 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  30.73 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  28.47 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  28.47 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  29.11 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  31.32 
 
 
272 aa  72  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  30.77 
 
 
272 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  29.67 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  30.22 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  30.22 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  29.67 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  27.17 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  30.77 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  30.77 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  29.67 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
249 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  29.12 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  26.16 
 
 
262 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1864  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  30.97 
 
 
153 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.804482  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  26.03 
 
 
244 aa  58.9  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.23 
 
 
243 aa  56.2  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  37.96 
 
 
222 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.14 
 
 
265 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.23 
 
 
234 aa  55.8  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 
266 aa  55.5  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  37.04 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  37.04 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  37.96 
 
 
236 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  37.04 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  37.04 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  32.76 
 
 
229 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  36.11 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3665  Methyltransferase type 11  26.6 
 
 
223 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  28.77 
 
 
276 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  28.48 
 
 
274 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  27.78 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  36.11 
 
 
236 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  29.08 
 
 
244 aa  53.9  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  26.63 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  26.63 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  26.98 
 
 
257 aa  52.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3179  methyltransferase type 11  23.72 
 
 
250 aa  52.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0194529  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003268  methyltransferase  32.14 
 
 
210 aa  52.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  23.72 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  26.4 
 
 
251 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  26.09 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  31.03 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>