More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0027 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0027  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 215 aa  441  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0450096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4390  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.6 
 
 		 215 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4254  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.14 
 
 		 215 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4215  Glutathione S-transferase domain protein  58.6 
 
 		 215 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0126  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.14 
 
 		 215 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0148  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.72 
 
 		 216 aa  259  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.959935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0089  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.74 
 
 		 215 aa  257  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0127  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.91 
 
 		 217 aa  254  7e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4049  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.28 
 
 		 215 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.88 
 
 		 215 aa  248  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.88 
 
 		 215 aa  248  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4697  glutathione S-transferase  56.28 
 
 		 215 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3548  glutathione S-transferase  53 
 
 		 217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4063  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.27 
 
 		 233 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  33.66 
 
 		 391 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3436  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.68 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2062  Glutathione S-transferase domain  37.79 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2295  Glutathione S-transferase domain protein  36.84 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5077  Glutathione S-transferase domain protein  31.34 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1953  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.24 
 
 		 224 aa  96.7  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  0.0851297 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3477  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.95 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3446  putative glutathione S-transferase  32.94 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1033  Glutathione S-transferase domain  31.18 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.372971 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1768  glutathione S-transferase, putative  32.16 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00268696  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3314  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.14 
 
 		 248 aa  92.8  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.443514  normal  0.158342 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3110  putative glutathione S-transferase  31.76 
 
 		 218 aa  92  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000803235  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0183  glutathione S-transferase-like protein  33.33 
 
 		 219 aa  91.7  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.220885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1312  putative glutathione S-transferase  32.35 
 
 		 246 aa  91.3  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.503911  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2930  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.29 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195248  hitchhiker  0.000964394 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3839  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.76 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2204  glutathione S-transferase-like protein  31.58 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000939621  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2570  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.95 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00976958 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4798  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.74 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5390  glutathione S-transferase-like  32.14 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.602647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5471  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.14 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5354  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.14 
 
 		 219 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4813  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.14 
 
 		 219 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3491  glutathione S-transferase  30.59 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0827  putative glutathione S-transferase  30 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000433785  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0044  putative glutathione S-transferase  30 
 
 		 303 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123051  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0951  putative glutathione S-transferase  30.99 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550052  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0858  putative glutathione S-transferase  30 
 
 		 303 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211682  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1576  putative glutathione S-transferase  30 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00035479  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5453  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.41 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0448477 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0009  glutathione S-transferase-like protein  33.15 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607663  normal  0.0509198 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2818  Glutathione S-transferase domain protein  26.01 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2116  glutathione S-transferase-like protein  27.22 
 
 		 203 aa  72  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5294  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.88 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.95189  normal  0.556954 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1132  glutathione S-transferase family protein  30.99 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0885  glutathione S-transferase  30.99 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0233753  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2887  glutathione S-transferase-like  27.27 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.862789  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2385  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.66 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.25 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  27.78 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2123  glutathione S-transferase-like protein  29.95 
 
 		 270 aa  65.1  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_004310  BR0839  glutathione S-transferase family protein  28.05 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0319  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.14 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  32.12 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0831  glutathione S-transferase family protein  27.44 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0851  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.41 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2778  Glutathione S-transferase domain protein  28.35 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.77 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  29.32 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  27.75 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1512  Glutathione S-transferase domain  27.65 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.22 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  26.22 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.22 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  27.75 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  25.61 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2242  glutathione S-transferase-like protein  25.77 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.025244  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.02 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  27.45 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  27.45 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1564  glutathionine S-transferase  27.98 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0409  Glutathione S-transferase domain protein  26.67 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.41 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.6 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  27.54 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  25.45 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  26.83 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  26.73 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  26.27 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  26.73 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.61 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.61 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.64 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0291  glutathione S-transferase family protein  26.84 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  27.45 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  27.45 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1795  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.88 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  25.15 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2957  glutathione S-transferase-like protein  28.07 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0467  Glutathione S-transferase domain  26.84 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.336613  hitchhiker  0.000569408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2347  Glutathione S-transferase domain protein  26.06 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  26.6 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.24 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0852  putative transcription modulator protein  28.64 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.24 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>