42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0014 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  298  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  65.97 
 
 
145 aa  201  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.03173e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  65.28 
 
 
145 aa  200  7e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0020  MOSC domain-containing protein  65.28 
 
 
145 aa  199  8e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.606276  hitchhiker  1.72861e-08 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0018  hypothetical protein  65.49 
 
 
145 aa  197  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0016  hypothetical protein  63.01 
 
 
148 aa  197  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0012  hypothetical protein  63.01 
 
 
148 aa  197  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0016  hypothetical protein  62.33 
 
 
148 aa  196  8e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.49396e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0017  hypothetical protein  62.33 
 
 
148 aa  196  9e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0010  hypothetical protein  62.76 
 
 
150 aa  193  7e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.276585  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0019  hypothetical protein  63.89 
 
 
146 aa  192  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110253 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0011  hypothetical protein  60.42 
 
 
145 aa  188  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0016  hypothetical protein  61.64 
 
 
155 aa  187  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000226962 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0010  hypothetical protein  58.74 
 
 
147 aa  174  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0012  MOSC domain-containing protein  56.03 
 
 
149 aa  164  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  7.70125e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  41.22 
 
 
151 aa  109  2e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  46.97 
 
 
156 aa  100  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  32.19 
 
 
181 aa  70.1  9e-12  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  38.93 
 
 
151 aa  68.2  4e-11  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  39.34 
 
 
206 aa  63.5  8e-10  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  35.61 
 
 
184 aa  61.2  4e-09  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  35.61 
 
 
144 aa  60.1  1e-08  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  37.84 
 
 
178 aa  53.1  1e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  28.8 
 
 
167 aa  51.2  4e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  35.51 
 
 
167 aa  51.6  4e-06  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  34.26 
 
 
165 aa  50.1  1e-05  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  34.42 
 
 
175 aa  49.3  2e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  33.09 
 
 
182 aa  48.5  3e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1759  MOSC domain-containing protein  24.31 
 
 
142 aa  47.8  5e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188575  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  31.91 
 
 
165 aa  47.4  6e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2044  MOSC domain-containing protein  24.31 
 
 
142 aa  47.4  6e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  31.16 
 
 
174 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3596  MOSC domain containing protein  28.74 
 
 
211 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.564722  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  30.66 
 
 
177 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  32.14 
 
 
245 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  31.82 
 
 
155 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0491  MOSC domain containing protein  27.27 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0514141  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  27.61 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  23.49 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1758  MOSC domain containing protein  27.52 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.175574  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  29.52 
 
 
162 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1690  MOSC domain containing protein  23.97 
 
 
143 aa  40  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>