243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4456 on replicon NC_009661
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0424  type I restriction enzyme, R subunit  39.77 
 
 		 1102 aa  759    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4456  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 1079 aa  2243    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0077  type I restriction-modification system subunit R  41.67 
 
 		 1067 aa  779    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2689  hypothetical protein  41.28 
 
 		 1063 aa  777    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11077  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1497  protein of unknown function DUF450  38.66 
 
 		 1051 aa  637    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0324371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2870  DEAD/DEAH box helicase-like  86.45 
 
 		 1085 aa  1937    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.737132  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1515  protein of unknown function DUF450  40.98 
 
 		 1142 aa  769    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.695629 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1065  DEAD/DEAH box helicase-like  37.97 
 
 		 1039 aa  664    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00124695  normal  0.0212089 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0194  hypothetical protein  38.98 
 
 		 1041 aa  675    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394359 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1325  type III restriction enzyme, res subunit  38.71 
 
 		 1112 aa  759    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0598  type I site-specific restriction-modification system, R subunit  43.77 
 
 		 1052 aa  839    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2605  type III restriction enzyme, res subunit  40.22 
 
 		 1087 aa  760    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0189627  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1482  hypothetical protein  40.02 
 
 		 1081 aa  768    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0230  hypothetical protein  43.7 
 
 		 1060 aa  812    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0415  hypothetical protein  43.66 
 
 		 1069 aa  818    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.484825  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0485  hypothetical protein  39.66 
 
 		 1039 aa  711    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646894  decreased coverage  0.000377567 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4924  hypothetical protein  37.49 
 
 		 1035 aa  673    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1151  hypothetical protein  41.56 
 
 		 1059 aa  790    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.255903  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2221  type III restriction enzyme, res subunit  40 
 
 		 905 aa  641    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432598  normal  0.944916 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4762  type I restriction-modification system endonuclease  55.47 
 
 		 1078 aa  1196    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1859  hypothetical protein  37.86 
 
 		 1033 aa  635  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4250  protein of unknown function DUF450  37 
 
 		 1027 aa  599  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13690  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  38.08 
 
 		 1073 aa  601  1e-170  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.161894 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0797  protein of unknown function DUF450  37.31 
 
 		 1000 aa  597  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985204 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2685  DEAD/DEAH box helicase  37.81 
 
 		 1009 aa  593  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3355  hypothetical protein  36.52 
 
 		 1007 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2607  hypothetical protein  35.67 
 
 		 1022 aa  559  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1789  type III restriction enzyme, res subunit  34.91 
 
 		 1029 aa  560  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2695  hypothetical protein  39.37 
 
 		 1008 aa  553  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285383  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3992  type III restriction protein res subunit  34.03 
 
 		 984 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.208178 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1553  protein of unknown function DUF450  36.65 
 
 		 985 aa  527  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3444  type III restriction protein res subunit  32.36 
 
 		 1012 aa  528  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0639  type III restriction enzyme, res subunit  32.69 
 
 		 1009 aa  515  1e-144  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28859  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0278  hypothetical protein  33.86 
 
 		 989 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19090  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  33.3 
 
 		 1004 aa  506  9.999999999999999e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.210967 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0265  type III restriction protein res subunit  37.1 
 
 		 1010 aa  504  1e-141  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0160  type I site-specific restriction-modification system, R subunit (helicase)  31.1 
 
 		 1035 aa  497  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0749  type III restriction protein res subunit  33.75 
 
 		 992 aa  496  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22820  type I restriction enzyme R protein  33.56 
 
 		 1006 aa  472  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0780  type I site-specific deoxyribonuclease chain R  31.96 
 
 		 971 aa  468  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0180253  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1014  type I restriction-modification system restriction subunit  34.9 
 
 		 965 aa  466  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4471  hypothetical protein  32.61 
 
 		 991 aa  464  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.756132  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0958  protein of unknown function DUF450  32.99 
 
 		 1067 aa  466  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1218  hypothetical protein  32.61 
 
 		 990 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0843  hypothetical protein  31.45 
 
 		 983 aa  444  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.10122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1859  DEAD/DEAH box helicase-like  32.56 
 
 		 997 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.397249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2197  protein of unknown function DUF450  30.7 
 
 		 999 aa  429  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1787  type III restriction enzyme, res subunit  32.76 
 
 		 1011 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.990163  normal  0.226288 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0659  protein of unknown function DUF450  31.66 
 
 		 969 aa  414  1e-114  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6264  type III restriction protein res subunit  31.23 
 
 		 1016 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3575  protein of unknown function DUF450  35.31 
 
 		 976 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1363  putative type I restriction enzyme HsdR  30.42 
 
 		 1022 aa  405  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003238  type I restriction-modification system restriction subunit R  30.88 
 
 		 1023 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2936  restriction enzyme type I helicase subunit; type I restriction enzyme HsdR  33.17 
 
 		 1034 aa  392  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0274  type I restriction-modification system, R subunit, putative  30.33 
 
 		 1002 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.273589  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2267  type I restriction-modification system endonuclease  31.04 
 
 		 1023 aa  376  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2175  hypothetical protein  30.27 
 
 		 1031 aa  371  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0881  putative type I site specific deoxyribonuclease HsdR  26.5 
 
 		 1060 aa  138  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0350782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1362  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.74 
 
 		 1060 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1534  type I restriction-modification enzyme, R subunit  25 
 
 		 1031 aa  119  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0146067  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0985  type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  23.44 
 
 		 1023 aa  110  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271239  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1807  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.83 
 
 		 982 aa  107  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.71292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3142  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.89 
 
 		 1053 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.311039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1642  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.44 
 
 		 1003 aa  105  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1092  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  26.53 
 
 		 965 aa  104  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.20335  normal  0.270177 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0504  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.82 
 
 		 1067 aa  104  8e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0948  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  22.99 
 
 		 1054 aa  103  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000568458 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0874  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.04 
 
 		 1041 aa  103  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2283  Type I site-specific deoxyribonuclease  24.14 
 
 		 1044 aa  102  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2740  type I restriction-modification system endonuclease  24.62 
 
 		 1051 aa  102  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17680  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.5 
 
 		 1035 aa  101  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3131  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.39 
 
 		 1060 aa  101  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.789076  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0288  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.25 
 
 		 1003 aa  101  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0616  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.76 
 
 		 1024 aa  101  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.945786  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2239  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.82 
 
 		 1046 aa  99.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0948  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  22.71 
 
 		 1030 aa  99.8  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000221808  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4929  hypothetical protein  23.76 
 
 		 1088 aa  99.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.806169 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1670  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.88 
 
 		 965 aa  99.4  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000414451 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4244  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.84 
 
 		 1084 aa  98.2  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104553 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0157  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.3 
 
 		 1096 aa  97.8  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2256  type I restriction-modification system, R subunit  22.9 
 
 		 1061 aa  97.8  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0040  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.96 
 
 		 1032 aa  97.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1175  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.05 
 
 		 980 aa  97.4  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.770188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0334  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.43 
 
 		 1075 aa  97.1  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2923  R (restriction) subunit/helicase  25.79 
 
 		 984 aa  96.3  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3110  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.13 
 
 		 980 aa  95.9  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0024  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.6 
 
 		 1108 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.955051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0032  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.6 
 
 		 1108 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0395746 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0986  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.33 
 
 		 1040 aa  95.5  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0017  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.65 
 
 		 1032 aa  95.1  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.13213  hitchhiker  0.00259353 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1367  type III restriction enzyme, res subunit  23.56 
 
 		 1289 aa  95.1  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1898  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.15 
 
 		 981 aa  94.7  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2281  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.02 
 
 		 986 aa  94.7  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000865916 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2251  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.86 
 
 		 1044 aa  94.7  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2218  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.02 
 
 		 975 aa  94.7  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2327  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.25 
 
 		 1046 aa  94  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.279582  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2781  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.18 
 
 		 1042 aa  92.8  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.759966 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2674  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  22.78 
 
 		 1027 aa  93.2  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1213  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  21.84 
 
 		 1074 aa  92.8  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0011  type I site-specific deoxyribonuclease  24.45 
 
 		 1061 aa  92.8  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.386666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>