112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4134 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  100 
 
 
213 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  94.01 
 
 
217 aa  427  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  92.59 
 
 
216 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  92.89 
 
 
223 aa  416  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  74.53 
 
 
212 aa  346  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  75.24 
 
 
212 aa  344  7e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  76.89 
 
 
212 aa  342  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  75 
 
 
212 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  75 
 
 
212 aa  333  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  58.57 
 
 
211 aa  278  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  56.19 
 
 
211 aa  263  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  56.19 
 
 
211 aa  260  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  55.98 
 
 
214 aa  247  8e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  50.48 
 
 
211 aa  241  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  54.55 
 
 
213 aa  230  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  48.31 
 
 
215 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  48.11 
 
 
222 aa  211  9e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  47.62 
 
 
212 aa  209  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  45.33 
 
 
214 aa  202  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  45.71 
 
 
215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  47.37 
 
 
223 aa  198  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  45.5 
 
 
212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  46.23 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  42.58 
 
 
257 aa  195  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  44.76 
 
 
212 aa  193  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  44.44 
 
 
225 aa  187  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  42.51 
 
 
215 aa  177  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  39.61 
 
 
230 aa  176  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  38.86 
 
 
222 aa  169  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  39.44 
 
 
217 aa  168  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  36.1 
 
 
214 aa  144  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  34.74 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  35.07 
 
 
214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  34.74 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  33.49 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  34.29 
 
 
212 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  0.00000000000496851 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  31.9 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  34.27 
 
 
212 aa  125  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  33.8 
 
 
212 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  33.81 
 
 
212 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  33.81 
 
 
212 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000231362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  33.81 
 
 
212 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  33.33 
 
 
232 aa  121  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  33.65 
 
 
222 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  117  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  31.75 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  34.12 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  30.54 
 
 
214 aa  107  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  31.13 
 
 
223 aa  101  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  27 
 
 
300 aa  65.1  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  23.48 
 
 
286 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  20.27 
 
 
291 aa  53.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  27.49 
 
 
305 aa  52.8  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  24.35 
 
 
306 aa  52  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  24.6 
 
 
672 aa  51.6  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  29.03 
 
 
310 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.45 
 
 
345 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  22.5 
 
 
332 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.47 
 
 
244 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  24.22 
 
 
306 aa  48.5  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  22.55 
 
 
274 aa  48.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  31.21 
 
 
1046 aa  47.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  25.46 
 
 
323 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  26.96 
 
 
333 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  25.46 
 
 
323 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  26.89 
 
 
284 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  20.17 
 
 
303 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  25.56 
 
 
336 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  23.12 
 
 
242 aa  47  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  23.44 
 
 
287 aa  46.6  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  29.6 
 
 
222 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2841  methyltransferase type 11  26.42 
 
 
263 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  25.36 
 
 
324 aa  45.4  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  30.84 
 
 
323 aa  45.1  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25 
 
 
273 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  22.47 
 
 
574 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  29.03 
 
 
285 aa  44.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12801  hypothetical protein  24.62 
 
 
275 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.838428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  19.28 
 
 
332 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  23.66 
 
 
1177 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  28.95 
 
 
249 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.14 
 
 
277 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  22.14 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3431  methyltransferase type 11  26.03 
 
 
271 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.53 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  23.93 
 
 
342 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1007  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.43 
 
 
249 aa  43.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
293 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 
1177 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  24.12 
 
 
249 aa  43.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  21.43 
 
 
415 aa  43.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2893  methyltransferase type 11  23.61 
 
 
317 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  24.73 
 
 
346 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  21.68 
 
 
334 aa  42.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  22.54 
 
 
305 aa  42.4  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  22.37 
 
 
240 aa  42.4  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0840  histidine triad (HIT) protein  30.84 
 
 
266 aa  42.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  hitchhiker  0.000000646753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  29.76 
 
 
239 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5454  methyltransferase type 11  24.29 
 
 
317 aa  42.4  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.80361 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>