More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4063 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 
234 aa  483  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  99.57 
 
 
234 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  97.01 
 
 
239 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  46.57 
 
 
228 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  46.57 
 
 
228 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  45.71 
 
 
229 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  42.11 
 
 
231 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  42.31 
 
 
233 aa  184  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  43.19 
 
 
234 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  43.9 
 
 
242 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  40.67 
 
 
691 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  40.67 
 
 
232 aa  175  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  40.67 
 
 
232 aa  175  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  41.15 
 
 
238 aa  174  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  40.67 
 
 
242 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  40.67 
 
 
242 aa  174  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  40 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  40.19 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  40.19 
 
 
242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.07 
 
 
276 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  40.34 
 
 
285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  40.29 
 
 
233 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0050  ThiJ/PfpI domain protein  37.84 
 
 
279 aa  167  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  40.49 
 
 
228 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  39.52 
 
 
232 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  42.86 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4315  ThiJ/PfpI domain protein  41.18 
 
 
232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.1 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2847  ThiJ/PfpI family protein  37.44 
 
 
276 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00201065  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.49 
 
 
224 aa  162  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  40.29 
 
 
225 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.41 
 
 
225 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.71 
 
 
231 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.24 
 
 
262 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  41.45 
 
 
226 aa  156  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4131  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.13 
 
 
277 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2705  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.49 
 
 
227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4332  ThiJ/PfpI  42.36 
 
 
239 aa  154  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2579  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40 
 
 
227 aa  154  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.1 
 
 
227 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  37.91 
 
 
241 aa  151  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  39.41 
 
 
232 aa  149  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  36.32 
 
 
243 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  35.9 
 
 
220 aa  144  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.65 
 
 
249 aa  144  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.7 
 
 
246 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.28 
 
 
242 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.62 
 
 
245 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  38.62 
 
 
245 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5986  ThiJ/PfpI family protein  41.26 
 
 
227 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0549226 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.1 
 
 
245 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  34.58 
 
 
234 aa  141  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.58 
 
 
234 aa  141  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5977  ThiJ/PfpI  36.73 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  36.84 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2005  isonitrile hydratase, putative  40.41 
 
 
228 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1672  ThiJ/PfpI domain protein  40.41 
 
 
228 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.875327 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  37.04 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4536  DJ-1/PfpI family protein  39.64 
 
 
261 aa  138  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  36.28 
 
 
212 aa  138  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  35.14 
 
 
228 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  35.14 
 
 
228 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.18 
 
 
230 aa  135  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0965747 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.69 
 
 
232 aa  134  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.54 
 
 
231 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2391  ThiJ/PfpI domain protein  42.07 
 
 
201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7236  ThiJ/PfpI family protein  35.05 
 
 
326 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0671264 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.58 
 
 
284 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.492617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4724  twin-arginine translocation pathway signal  34.58 
 
 
284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.58 
 
 
284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043204  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  34.76 
 
 
241 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.8 
 
 
231 aa  126  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6260  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.79 
 
 
284 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5955  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.78 
 
 
284 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  34.38 
 
 
198 aa  125  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  34.76 
 
 
241 aa  124  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  33.17 
 
 
238 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  38.42 
 
 
233 aa  123  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.6 
 
 
251 aa  122  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.84 
 
 
233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.85 
 
 
198 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.05 
 
 
199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  34.8 
 
 
214 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  35.23 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.68 
 
 
232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.85 
 
 
207 aa  112  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.02 
 
 
199 aa  112  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1802  putative transcription regulator protein  37.25 
 
 
224 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0437387 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  33.16 
 
 
199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2879  ThiJ/PfpI  39.07 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  33.17 
 
 
222 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1653  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.98 
 
 
240 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.13 
 
 
210 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  28.43 
 
 
218 aa  105  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  32 
 
 
349 aa  105  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  30.85 
 
 
198 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>