More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3769 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3027  DNA mismatch repair protein  59.66 
 
 		 650 aa  748    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0173835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3282  DNA mismatch repair protein  79.19 
 
 		 641 aa  1026    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.645074  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0601  DNA mismatch repair protein  78.58 
 
 		 631 aa  1010    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3542  DNA mismatch repair protein  60.12 
 
 		 628 aa  741    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3712  DNA mismatch repair protein  95.45 
 
 		 637 aa  1237    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3207  DNA mismatch repair protein  58.98 
 
 		 665 aa  741    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000351816  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4172  DNA mismatch repair protein  64.52 
 
 		 614 aa  762    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0564  DNA mismatch repair protein  60.96 
 
 		 631 aa  761    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.273606 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0795  DNA mismatch repair protein  63.78 
 
 		 624 aa  769    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.741444  hitchhiker  0.00456525 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3769  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 630 aa  1288    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00256823  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0596  DNA mismatch repair protein  78.02 
 
 		 644 aa  1004    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0279132  decreased coverage  0.0000000183924 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3434  DNA mismatch repair protein  78.02 
 
 		 644 aa  1002    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0482547  normal  0.130022 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3313  DNA mismatch repair protein  62.26 
 
 		 619 aa  764    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3895  DNA mismatch repair protein  95.93 
 
 		 638 aa  1246    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.329435  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0556  DNA mismatch repair protein  95.77 
 
 		 638 aa  1244    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000137773  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0595  DNA mismatch repair protein  77.69 
 
 		 648 aa  1001    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232497 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4756  DNA mismatch repair protein  47.93 
 
 		 618 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0429  DNA mismatch repair protein  47.56 
 
 		 624 aa  498  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000237281  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4720  DNA mismatch repair protein  47.76 
 
 		 618 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4777  DNA mismatch repair protein  47.6 
 
 		 618 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00171491  normal  0.0289843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3655  DNA mismatch repair protein  46.08 
 
 		 635 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128216  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4637  DNA mismatch repair protein  48.58 
 
 		 618 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000512951  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4627  DNA mismatch repair protein  47.43 
 
 		 618 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3921  DNA mismatch repair protein  47.41 
 
 		 661 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0286731  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0701  DNA mismatch repair protein  46.34 
 
 		 635 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2779  DNA mismatch repair protein  44.53 
 
 		 652 aa  494  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0353  DNA mismatch repair protein  46.04 
 
 		 613 aa  493  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.114284  hitchhiker  0.00160708 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4412  DNA mismatch repair protein  47.33 
 
 		 615 aa  489  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0194282  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4728  DNA mismatch repair protein  47.33 
 
 		 615 aa  489  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0929403  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04037  DNA mismatch repair protein  47.33 
 
 		 615 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0484513  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3823  DNA mismatch repair protein MutL  47.33 
 
 		 615 aa  488  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000414583  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3723  DNA mismatch repair protein  43.98 
 
 		 669 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0150049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3843  DNA mismatch repair protein  47 
 
 		 615 aa  486  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000795964  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4641  DNA mismatch repair protein  47.2 
 
 		 615 aa  487  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.231193  normal  0.0766044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5686  DNA mismatch repair protein  46.88 
 
 		 615 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000161678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4701  DNA mismatch repair protein  46.68 
 
 		 615 aa  483  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915673  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2756  DNA mismatch repair protein  48.17 
 
 		 653 aa  479  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002257  DNA mismatch repair protein MutL  43.35 
 
 		 670 aa  474  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.558957  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00096  DNA mismatch repair protein  44.55 
 
 		 681 aa  472  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3801  DNA mismatch repair protein  64.74 
 
 		 635 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0490  DNA mismatch repair protein  45.84 
 
 		 649 aa  468  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00424491  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  66.87 
 
 		 629 aa  458  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3240  DNA mismatch repair protein MutL  43.12 
 
 		 628 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3976  DNA mismatch repair protein MutL  41.95 
 
 		 639 aa  439  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  60.79 
 
 		 615 aa  437  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0323  DNA mismatch repair protein MutL  62.05 
 
 		 652 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  42.86 
 
 		 623 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  43.58 
 
 		 633 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0584  DNA mismatch repair protein MutL  38.09 
 
 		 602 aa  403  1e-111  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.969564  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  41.15 
 
 		 633 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  43.75 
 
 		 633 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00647  DNA mismatch repair protein  45.74 
 
 		 608 aa  399  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.893353  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  41.15 
 
 		 632 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  41.32 
 
 		 635 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  41.65 
 
 		 633 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  40.3 
 
 		 632 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  41.91 
 
 		 645 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  42.88 
 
 		 629 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  41.28 
 
 		 648 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  41.35 
 
 		 641 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  41.64 
 
 		 630 aa  388  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  56.67 
 
 		 641 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  56.31 
 
 		 611 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  40.28 
 
 		 625 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  53.52 
 
 		 636 aa  356  5.999999999999999e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  53.8 
 
 		 611 aa  355  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  54.88 
 
 		 644 aa  354  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  51.36 
 
 		 630 aa  345  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  51.66 
 
 		 619 aa  334  3e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  51.65 
 
 		 621 aa  334  3e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  50.46 
 
 		 626 aa  322  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  37.67 
 
 		 616 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  38.62 
 
 		 652 aa  318  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  45.56 
 
 		 617 aa  317  3e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0336  DNA mismatch repair protein  49.54 
 
 		 583 aa  316  7e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00211885  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  51.83 
 
 		 667 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  51.83 
 
 		 667 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  51.83 
 
 		 667 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  52.13 
 
 		 661 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  37.84 
 
 		 655 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  37.01 
 
 		 691 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  51.83 
 
 		 661 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  51.22 
 
 		 661 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  51.05 
 
 		 636 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  48.81 
 
 		 575 aa  308  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  36.97 
 
 		 705 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  37.42 
 
 		 684 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  37.42 
 
 		 684 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  37.42 
 
 		 684 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  50.91 
 
 		 662 aa  307  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  37.42 
 
 		 684 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  37.42 
 
 		 684 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  37.54 
 
 		 681 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  37.35 
 
 		 681 aa  306  6e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  50.45 
 
 		 647 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  48.85 
 
 		 635 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  51.06 
 
 		 688 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  48.96 
 
 		 574 aa  306  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  48.18 
 
 		 613 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  37.03 
 
 		 628 aa  303  5.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>