More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3590 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3713  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
190 aa  360  5e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0721  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
176 aa  358  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.59238  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3590  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
176 aa  358  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0169693  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3521  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
176 aa  358  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241179  hitchhiker  0.00357405 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  97.73 
 
 
176 aa  352  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3145  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  97.73 
 
 
176 aa  350  4e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0822  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  97.73 
 
 
176 aa  350  4e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0793  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  97.73 
 
 
176 aa  350  4e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3803  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  96.59 
 
 
176 aa  346  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3142  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  93.18 
 
 
176 aa  334  3e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0688  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  90.91 
 
 
177 aa  328  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3233  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  91.48 
 
 
176 aa  328  3e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3818  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  89.2 
 
 
176 aa  325  3e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0654  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  89.2 
 
 
176 aa  322  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306745  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3910  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  87.93 
 
 
176 aa  320  6e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.835811  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0771  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  87.36 
 
 
176 aa  315  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1154  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  65.71 
 
 
178 aa  245  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3124  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  65.71 
 
 
178 aa  245  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0117  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.43 
 
 
177 aa  244  4e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2618  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.79 
 
 
176 aa  243  8e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03458  hypothetical protein  63.79 
 
 
176 aa  241  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3351  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  64.41 
 
 
181 aa  241  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00328622  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3479  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  64.41 
 
 
181 aa  241  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1019  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  64.41 
 
 
181 aa  241  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.43 
 
 
177 aa  240  6e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472087  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0202  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.84 
 
 
178 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0189  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.84 
 
 
178 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0185  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.84 
 
 
178 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0734521  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0194  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.84 
 
 
178 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99214  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.84 
 
 
178 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.186171  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00124  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  63.84 
 
 
178 aa  238  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3477  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.84 
 
 
182 aa  238  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0129  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.84 
 
 
178 aa  238  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00123  hypothetical protein  63.84 
 
 
178 aa  238  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0133  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.84 
 
 
178 aa  238  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0127  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.84 
 
 
178 aa  238  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3534  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.84 
 
 
182 aa  238  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0118  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.84 
 
 
178 aa  238  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0673  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.84 
 
 
178 aa  238  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.959091  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0135  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.28 
 
 
178 aa  236  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3998  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  62.71 
 
 
178 aa  234  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002554  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  62.28 
 
 
169 aa  227  6e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1752  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  62.07 
 
 
176 aa  226  9e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00124544  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1022  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.64 
 
 
177 aa  224  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0463  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.96 
 
 
179 aa  215  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  1.43113e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2148  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.98 
 
 
176 aa  213  2e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0329  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.06 
 
 
178 aa  210  7e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1428  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.97 
 
 
181 aa  207  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0375844 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2786  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.97 
 
 
181 aa  207  7e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0223963  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1044  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.58 
 
 
186 aa  206  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.684921  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1581  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.93 
 
 
178 aa  197  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.435118  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0140  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.81 
 
 
174 aa  192  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  5.69861e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.17 
 
 
189 aa  191  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.341617  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2230  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 
179 aa  190  7e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1543  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.65 
 
 
176 aa  189  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1368  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 
180 aa  189  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282504  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3479  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
176 aa  187  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4651  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
175 aa  187  6e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4975  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 
175 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4569  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 
175 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4958  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
175 aa  185  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0626  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.57 
 
 
184 aa  185  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4551  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
175 aa  184  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4937  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
175 aa  184  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5074  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
183 aa  183  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4712  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
183 aa  183  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4942  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
175 aa  182  2e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0297  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
175 aa  182  2e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
180 aa  182  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0059  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
180 aa  181  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0071  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
180 aa  182  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5245  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
180 aa  181  4e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0072  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
180 aa  181  5e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
179 aa  181  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
180 aa  181  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
180 aa  181  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0062  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
180 aa  181  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0075  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
180 aa  181  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0888602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
180 aa  181  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2663  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 
180 aa  180  8e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0107677 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0623  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
189 aa  180  9e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4506  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.59 
 
 
189 aa  177  5e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00570  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 
186 aa  176  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00463004  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0792  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.25 
 
 
181 aa  176  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  7.42772e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3448  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 
182 aa  176  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0015  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.12 
 
 
180 aa  174  4e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2835  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.41 
 
 
175 aa  175  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4969  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
179 aa  174  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.187483 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2988  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 
183 aa  174  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32100  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.48 
 
 
184 aa  173  1e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.918593  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2376  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.51 
 
 
179 aa  173  1e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118053  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2896  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
184 aa  172  2e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0512  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.73 
 
 
187 aa  172  2e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0701  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
179 aa  172  3e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.482713 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2046  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
184 aa  172  3e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9176  Hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
180 aa  172  3e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577662  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01220  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 
183 aa  171  4e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0080  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
181 aa  170  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.297539  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3028  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
180 aa  169  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133397  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2787  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.52 
 
 
183 aa  170  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>