216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3577 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3791  renal dipeptidase family protein  81.82 
 
 
396 aa  677    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3700  peptidase M19 renal dipeptidase  98.45 
 
 
388 aa  791    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3577  peptidase M19 renal dipeptidase  100 
 
 
388 aa  802    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3133  twin-arginine translocation pathway signal  86.3 
 
 
387 aa  702    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0834  twin-arginine translocation pathway signal  86.56 
 
 
387 aa  703    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3509  peptidase M19 renal dipeptidase  98.71 
 
 
388 aa  794    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0806  peptidase M19, renal dipeptidase  86.56 
 
 
387 aa  704    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0741  peptidase M19 renal dipeptidase  99.23 
 
 
388 aa  799    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0838  peptidase M19, renal dipeptidase  89.18 
 
 
388 aa  731    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3756  peptidase M19, renal dipeptidase  73.64 
 
 
388 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3183  twin-arginine translocation pathway signal  71.65 
 
 
388 aa  599  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0751  twin-arginine translocation pathway signal  74.68 
 
 
391 aa  593  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  67.36 
 
 
379 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0845  peptidase M19 renal dipeptidase  65.01 
 
 
390 aa  519  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.773406  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3107  peptidase M19, renal dipeptidase  66.48 
 
 
385 aa  498  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  28.29 
 
 
368 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  29.07 
 
 
323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  27.27 
 
 
323 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  30.67 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  30.67 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  30.67 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  30.67 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  27 
 
 
386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  26.42 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  26.14 
 
 
323 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  29.33 
 
 
325 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  27.81 
 
 
323 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  29.33 
 
 
320 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  27.81 
 
 
323 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  25.99 
 
 
325 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  27.81 
 
 
323 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  27.81 
 
 
323 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  27.81 
 
 
323 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  26.69 
 
 
323 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  26.69 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  27.53 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  27.81 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  27.81 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  26.4 
 
 
323 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  28.57 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  27.06 
 
 
323 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  26.52 
 
 
325 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  28.44 
 
 
325 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  26.69 
 
 
325 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  28.51 
 
 
325 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  26.63 
 
 
323 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  24.72 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  25.93 
 
 
315 aa  111  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  28.46 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  28.46 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  28.46 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  26.87 
 
 
329 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  25.24 
 
 
311 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  27.63 
 
 
320 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  25.56 
 
 
323 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  25.56 
 
 
323 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  26.32 
 
 
324 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  28.38 
 
 
336 aa  106  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  25.08 
 
 
326 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  25.19 
 
 
320 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  29.47 
 
 
311 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  25.95 
 
 
377 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  22.96 
 
 
346 aa  103  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  26.37 
 
 
313 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  25.16 
 
 
323 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  29.33 
 
 
332 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  32.26 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  31.75 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  23.23 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  23.86 
 
 
327 aa  97.8  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  25 
 
 
357 aa  97.4  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  22.66 
 
 
329 aa  97.4  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  29.09 
 
 
438 aa  97.4  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  22.66 
 
 
329 aa  96.3  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  26.46 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  24.32 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  24.32 
 
 
328 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  27.31 
 
 
327 aa  93.6  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  22.54 
 
 
329 aa  93.2  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  23.08 
 
 
332 aa  92  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  31.02 
 
 
333 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  25.11 
 
 
307 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  29.06 
 
 
337 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  24.84 
 
 
328 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  25.18 
 
 
315 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  34.23 
 
 
307 aa  90.5  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  23.99 
 
 
332 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  31.46 
 
 
307 aa  89  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  28.96 
 
 
433 aa  89  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4040  peptidase M19, renal dipeptidase  30.94 
 
 
223 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  28.8 
 
 
397 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  24.77 
 
 
307 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  31.75 
 
 
394 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  26.01 
 
 
307 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  31.87 
 
 
350 aa  88.6  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  29.03 
 
 
307 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  25 
 
 
326 aa  87.8  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  22.92 
 
 
329 aa  87.8  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1664  peptidase M19 renal dipeptidase  35.17 
 
 
312 aa  87.8  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  hitchhiker  0.00631997 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0032  peptidase M19, renal dipeptidase  27.43 
 
 
307 aa  87.8  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>