More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3509 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  98.34 
 
 		 904 aa  1846    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  46.76 
 
 		 901 aa  771    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 904 aa  1875    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  97.12 
 
 		 904 aa  1829    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  45.96 
 
 		 897 aa  788    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  97.35 
 
 		 904 aa  1838    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  36.11 
 
 		 869 aa  525  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  36.11 
 
 		 873 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  35.64 
 
 		 873 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  34.35 
 
 		 907 aa  464  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 907 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  33.16 
 
 		 953 aa  437  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  33.16 
 
 		 981 aa  432  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  33.22 
 
 		 843 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  33.37 
 
 		 853 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  33.26 
 
 		 853 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  33.56 
 
 		 853 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  33.26 
 
 		 853 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  33.56 
 
 		 853 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  33.16 
 
 		 935 aa  400  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 		 842 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 924 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 841 aa  396  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 838 aa  393  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  32.46 
 
 		 839 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 836 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 855 aa  389  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 855 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 		 817 aa  385  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 965 aa  379  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 930 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 933 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 930 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 930 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 935 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 935 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 937 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 935 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 912 aa  365  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  29.57 
 
 		 966 aa  355  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 966 aa  353  7e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  31.45 
 
 		 936 aa  353  8e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  35.33 
 
 		 709 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 952 aa  332  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 1088 aa  330  5.0000000000000004e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 981 aa  324  4e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 938 aa  323  7e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 987 aa  321  5e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 975 aa  313  6.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 985 aa  313  7.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 976 aa  312  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 944 aa  311  2.9999999999999997e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 946 aa  308  4.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 957 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 974 aa  301  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 951 aa  296  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 951 aa  295  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 944 aa  295  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  27.47 
 
 		 929 aa  290  6e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 976 aa  289  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 982 aa  286  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 935 aa  282  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 910 aa  282  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 947 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 966 aa  271  5.9999999999999995e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 940 aa  269  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 914 aa  269  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 966 aa  268  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 852 aa  267  5e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 857 aa  267  5e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 969 aa  264  6.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 855 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 861 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 849 aa  263  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 861 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  28.36 
 
 		 961 aa  263  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 861 aa  263  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 861 aa  262  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 964 aa  263  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 847 aa  261  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 861 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 861 aa  260  9e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 948 aa  257  7e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 867 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2508  TonB-dependent receptor, plug  26.12 
 
 		 1015 aa  252  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.636231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  26.48 
 
 		 914 aa  249  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 875 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 1015 aa  249  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 886 aa  249  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 871 aa  249  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 867 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 886 aa  248  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 1020 aa  248  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 867 aa  247  9e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 1007 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 867 aa  245  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 892 aa  243  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 882 aa  241  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2379  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 1034 aa  240  8e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0591037  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.02 
 
 		 969 aa  239  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>