More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3454 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3454  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  577  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407979  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3381  protein of unknown function DUF6 transmembrane  97.3 
 
 		 296 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0909  hypothetical protein  95.95 
 
 		 296 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3578  hypothetical protein  97.64 
 
 		 296 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0917112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0960  hypothetical protein  82.77 
 
 		 296 aa  472  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.734629  normal  0.602427 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0925  hypothetical protein  82.43 
 
 		 296 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0924  hypothetical protein  83.78 
 
 		 296 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1091  hypothetical protein  81.42 
 
 		 296 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0926  hypothetical protein  88.28 
 
 		 295 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0798  integral membrane protein  53.71 
 
 		 298 aa  288  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.252294  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  52.78 
 
 		 305 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  52.78 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  49.31 
 
 		 341 aa  271  8.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  50.18 
 
 		 298 aa  269  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  46.28 
 
 		 296 aa  258  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  45.64 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  45.3 
 
 		 293 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  45.99 
 
 		 290 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  42.81 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  44.93 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  46.13 
 
 		 297 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.15 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.15 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  43.73 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4444  hypothetical protein  46.69 
 
 		 293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0572  hypothetical protein  47.19 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.927387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4901  hypothetical protein  46.69 
 
 		 293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  41.16 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6885  hypothetical protein  43.71 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6774  hypothetical protein  44.06 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2803  hypothetical protein  40.83 
 
 		 297 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1547  hypothetical protein  44.06 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251436  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6282  hypothetical protein  44.06 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0693319  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1462  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.29 
 
 		 333 aa  202  7e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0367  hypothetical protein  42.76 
 
 		 305 aa  199  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1524  hypothetical protein  42.76 
 
 		 305 aa  199  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1415  integral membrane protein  42.29 
 
 		 305 aa  195  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.123619  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.41 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  33.9 
 
 		 303 aa  145  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  32.35 
 
 		 331 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  30.72 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.01 
 
 		 301 aa  122  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  29.66 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  29.78 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  29.9 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  31.41 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  29.83 
 
 		 322 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  28.18 
 
 		 301 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 		 309 aa  112  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  30.28 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.59 
 
 		 305 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  29.37 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  29.45 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  28.42 
 
 		 300 aa  105  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  27.7 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  29.21 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  27.7 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  28.38 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3545  hypothetical protein  28.33 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  28.04 
 
 		 310 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  28.24 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  28.37 
 
 		 329 aa  97.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  29.15 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  29.47 
 
 		 324 aa  96.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  29.35 
 
 		 303 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  29.35 
 
 		 303 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 291 aa  95.5  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  26.33 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  25.51 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  28.06 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.12 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  28.62 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.49 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  28.62 
 
 		 303 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  28.26 
 
 		 303 aa  92  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  28.26 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  27.9 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  28.26 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  28.26 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2701  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.42 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.03 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  28.91 
 
 		 294 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  27.08 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  27.66 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3401  hypothetical protein  26.07 
 
 		 322 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0214667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  26.8 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8133  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  28.06 
 
 		 303 aa  89.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  26.1 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1370  hypothetical protein  29.02 
 
 		 296 aa  87.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3611  hypothetical protein  25.34 
 
 		 312 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0603638  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4181  hypothetical protein  27.8 
 
 		 310 aa  87  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4552  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.91 
 
 		 333 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  27.89 
 
 		 314 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>