118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3384 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  100 
 
 		 338 aa  707    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  98.82 
 
 		 338 aa  702    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  68.05 
 
 		 338 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  48.08 
 
 		 338 aa  315  7e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  47.6 
 
 		 359 aa  298  9e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  47.45 
 
 		 341 aa  292  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  43.75 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  44.91 
 
 		 329 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  45.51 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  42.39 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  47.15 
 
 		 200 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  32.25 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0995  integrase protein  49.62 
 
 		 147 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000161367  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  27.41 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  28.42 
 
 		 368 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  26.95 
 
 		 325 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01326  site-specific recombinase, phage integrase family  24.84 
 
 		 342 aa  92.8  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0890687  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  30.84 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  28.85 
 
 		 344 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  26.88 
 
 		 339 aa  89  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  28.46 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0555  hypothetical protein  28.61 
 
 		 371 aa  86.7  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178247  normal  0.46728 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  26.52 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  29.01 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3110  putative phage integrase  29.49 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000337156  decreased coverage  0.0000174724 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  25.31 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  28.63 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  29.11 
 
 		 339 aa  82.4  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1927  integrase family protein  28.57 
 
 		 350 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  28.89 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  29.06 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  27.35 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2415  phage integrase family site specific recombinase  30.48 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  27.18 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0631  phage-related integrase  28.69 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000108359  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  28.24 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1139  phage-related integrase  28.69 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  28.24 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  23.65 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  25.87 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  28.86 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1490  phage integrase family site specific recombinase  30.48 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1686  phage integrase family site specific recombinase  30.48 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0310  phage integrase family site specific recombinase  30.14 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0342  phage integrase family site specific recombinase  30.14 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6332  integrase family protein  26.64 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  23.57 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04071  site-specific recombinase, phage integrase family  23.94 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0594853  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  22.54 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  23.65 
 
 		 360 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  27.32 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1931  hypothetical protein  27.2 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00772625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  23.36 
 
 		 345 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  25 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  22.22 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  29.31 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1734  phage integrase family protein  23.47 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155047 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  27.85 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3805  integrase  30.38 
 
 		 332 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  26.91 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  29.79 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  23.62 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  25.37 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1721  phage integrase family protein  32.35 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  23.96 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  23.96 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  23.96 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  23.33 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2648  phage integrase family protein  27.68 
 
 		 182 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  27.8 
 
 		 222 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25.09 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1655  phage integrase family protein  21.24 
 
 		 366 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000880499  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  24.35 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  26.48 
 
 		 374 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  24.89 
 
 		 411 aa  49.3  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  22.04 
 
 		 346 aa  49.7  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1571  site-specific integrase/recombinase  23.14 
 
 		 381 aa  49.3  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  28.65 
 
 		 393 aa  49.3  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  22.13 
 
 		 284 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  26.21 
 
 		 328 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  22.61 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  22.61 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  27.62 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  22.13 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2023  phage integrase  22.55 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280518  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  24.36 
 
 		 334 aa  46.6  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  24.79 
 
 		 251 aa  46.6  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  23.53 
 
 		 387 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  21.07 
 
 		 367 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  23.64 
 
 		 402 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  26 
 
 		 376 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  25.59 
 
 		 351 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  26 
 
 		 376 aa  46.2  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  26 
 
 		 376 aa  46.2  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  26 
 
 		 376 aa  46.2  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  29.45 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  23.51 
 
 		 344 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  24.42 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1076  integrase  25.86 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>