40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3366 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3366  putative replication protein  100 
 
 
278 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263749  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3257  putative replication protein  98.2 
 
 
278 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.699419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3490  hypothetical protein  98.56 
 
 
278 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314566  unclonable  0.00000747295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1975  hypothetical protein  98.2 
 
 
278 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00555051  normal  0.0479802 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2025  hypothetical protein  97.48 
 
 
278 aa  563  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0214118  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2558  putative replication protein  92.81 
 
 
263 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1858  putative replication protein  67.01 
 
 
285 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0634038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3394  putative replication protein  65.98 
 
 
285 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000899226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1970  putative replication protein  65.64 
 
 
285 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068192  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0743  putative replication protein  66.67 
 
 
249 aa  346  3e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0773  hypothetical protein  66.31 
 
 
249 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3612  putative replication protein  65.95 
 
 
249 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000425732  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0770  hypothetical protein  65.33 
 
 
244 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  normal  0.283783 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1653  hypothetical protein  49.82 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000671597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2159  replication protein  40.79 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000201859  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3439  putative transcriptional regulator  59.82 
 
 
249 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119584  unclonable  9.09525e-17 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1139  replication protein  43.66 
 
 
326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00398063  hitchhiker  2.1893400000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3117  hypothetical protein  31.19 
 
 
197 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1691  hypothetical protein  50 
 
 
411 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.073088 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3263  hypothetical protein  26.03 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.102407  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1318  hypothetical protein  35.48 
 
 
255 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4446  phage O protein family  27.2 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  unclonable  0.00000000141211 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1032  gp69  41.89 
 
 
86 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1441  hypothetical protein  29.35 
 
 
269 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1423  hypothetical protein  29.35 
 
 
269 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3327  hypothetical protein  26.92 
 
 
344 aa  49.7  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6178  hypothetical protein  30 
 
 
431 aa  49.3  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0794  hypothetical protein  28.36 
 
 
243 aa  49.7  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436094 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0691  hypothetical protein  85.19 
 
 
57 aa  49.3  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000499925  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6266  hypothetical protein  28.74 
 
 
330 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0383  hypothetical protein  25.74 
 
 
333 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.455969  normal  0.476132 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  37.93 
 
 
455 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3853  hypothetical protein  24.85 
 
 
268 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878224  hitchhiker  0.000000470201 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01960  hypothetical protein  33.8 
 
 
318 aa  45.8  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0244  hypothetical protein  38.6 
 
 
80 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.201216  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1433  phage O protein family  23.29 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000630558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1259  phage O family protein  32.88 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000280847  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3746  hypothetical protein  27.63 
 
 
269 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06400  hypothetical protein  30.85 
 
 
352 aa  44.3  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1425  hypothetical protein  32.65 
 
 
328 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>