More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3315 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  100 
 
 
114 aa  232  1e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.32969e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  100 
 
 
114 aa  232  1e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  3.16802e-08  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  99.08 
 
 
109 aa  220  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.43508e-10  hitchhiker  4.78913e-10 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  99.08 
 
 
109 aa  220  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.12761e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  92.04 
 
 
114 aa  218  2e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  9.71305e-10  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  92.04 
 
 
114 aa  218  2e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.29081e-07  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  92.04 
 
 
114 aa  218  2e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.84153e-09  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  94.44 
 
 
109 aa  212  1e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  8.6194e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  91.67 
 
 
109 aa  209  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  83.02 
 
 
109 aa  188  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.12346e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  79.44 
 
 
109 aa  186  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  8.80611e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  79.63 
 
 
115 aa  182  9e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  4.5875e-09  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  81.9 
 
 
109 aa  182  1e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.76434e-08  unclonable  3.77675e-11 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  80.19 
 
 
108 aa  179  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  6.97602e-10  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  76.64 
 
 
109 aa  177  3e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  7.43073e-09  decreased coverage  2.04323e-07 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0701  iojap-like protein  69.81 
 
 
109 aa  167  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.19797e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  72.38 
 
 
105 aa  159  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  5.04193e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1562  iojap-like protein  68.32 
 
 
105 aa  151  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.985002  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1137  iojap-like protein  56.6 
 
 
108 aa  141  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000812131  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  58.42 
 
 
105 aa  138  2e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  58.42 
 
 
105 aa  139  2e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0689  hypothetical protein  56.19 
 
 
105 aa  135  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.12038e-15  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2989  iojap-like protein  56.19 
 
 
105 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.79848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0657  hypothetical protein  56.19 
 
 
105 aa  135  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  7.77395e-11  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0614  hypothetical protein  56.19 
 
 
105 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.11441e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00606  hypothetical protein  56.19 
 
 
105 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  6.79952e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00595  hypothetical protein  56.19 
 
 
105 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  4.76829e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0726  hypothetical protein  56.19 
 
 
105 aa  135  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  5.27237e-08  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3008  hypothetical protein  56.19 
 
 
105 aa  135  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.22967e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0663  hypothetical protein  56.19 
 
 
105 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  9.19857e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1172  hypothetical protein  56.19 
 
 
105 aa  135  3e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149943  normal  0.124229 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3019  hypothetical protein  54.29 
 
 
105 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.13985e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  55.24 
 
 
105 aa  134  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2947  hypothetical protein  54.29 
 
 
105 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0112244  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  55.24 
 
 
105 aa  134  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1846  hypothetical protein  54.29 
 
 
105 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0698  hypothetical protein  54.29 
 
 
105 aa  132  1e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  1.07419e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0684  hypothetical protein  54.29 
 
 
105 aa  132  1e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  1.84258e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0758  hypothetical protein  54.29 
 
 
105 aa  132  1e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000297026  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0802  hypothetical protein  54.29 
 
 
105 aa  132  1e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  2.95107e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0475  hypothetical protein  55.24 
 
 
105 aa  132  1e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0369848  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1094  hypothetical protein  56.19 
 
 
105 aa  132  2e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0744  hypothetical protein  53.33 
 
 
105 aa  131  4e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000588326  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  55.24 
 
 
105 aa  130  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  55.77 
 
 
130 aa  128  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1203  hypothetical protein  52.38 
 
 
105 aa  127  5e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718805  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1717  iojap-related protein  47.17 
 
 
106 aa  125  2e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  51.43 
 
 
114 aa  125  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.74363e-11  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0987  hypothetical protein  49.52 
 
 
105 aa  124  4e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  50.96 
 
 
118 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  50.96 
 
 
118 aa  121  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  50.94 
 
 
123 aa  121  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2140  iojap-like protein  52.48 
 
 
117 aa  121  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.705991  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  50 
 
 
117 aa  120  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  45.87 
 
 
116 aa  118  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  5.27491e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  53.4 
 
 
115 aa  116  1e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1511  iojap protein family  46.67 
 
 
116 aa  113  8e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  2.52813e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0666  iojap family protein  46.67 
 
 
116 aa  113  9e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  2.49784e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  52 
 
 
148 aa  113  9e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0323  hypothetical protein  45.63 
 
 
106 aa  113  1e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0834924  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  53.92 
 
 
137 aa  112  1e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  52.13 
 
 
148 aa  110  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  43.64 
 
 
123 aa  110  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0485  Iojap-related protein  49.52 
 
 
120 aa  110  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.40385e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0343  iojap-like protein  49.02 
 
 
134 aa  110  8e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  1.85203e-12  unclonable  1.86984e-10 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  52 
 
 
150 aa  107  4e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  6.75973e-07  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  43.12 
 
 
122 aa  107  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2274  iojap-like protein  53.85 
 
 
125 aa  106  9e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.547969  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  46.15 
 
 
143 aa  105  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  47.42 
 
 
112 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  47.42 
 
 
112 aa  103  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0194  hypothetical protein  43.27 
 
 
137 aa  103  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0193009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  44.12 
 
 
141 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  45.63 
 
 
168 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  43.43 
 
 
150 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  49.51 
 
 
158 aa  101  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1739  iojap-like protein  49.51 
 
 
173 aa  101  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  45.54 
 
 
142 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  44.23 
 
 
119 aa  101  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  41.28 
 
 
140 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  40.19 
 
 
135 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0214  Iojap-related protein  42.31 
 
 
137 aa  100  9e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  48.04 
 
 
164 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  41.35 
 
 
123 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  42.86 
 
 
166 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  42.16 
 
 
210 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  46.15 
 
 
115 aa  98.2  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.23789e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  42 
 
 
120 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  42.72 
 
 
137 aa  97.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  41.41 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  44.44 
 
 
110 aa  97.1  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  46.15 
 
 
158 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  39.62 
 
 
113 aa  97.1  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  46.15 
 
 
139 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  39.81 
 
 
147 aa  97.1  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  46.15 
 
 
139 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  39.45 
 
 
128 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  39.81 
 
 
149 aa  96.7  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  43.96 
 
 
117 aa  95.9  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  43.96 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>