56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3309 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  100 
 
 
219 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  100 
 
 
219 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  100 
 
 
219 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  100 
 
 
219 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  87.67 
 
 
219 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  65.28 
 
 
221 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  59.63 
 
 
221 aa  278  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  62.04 
 
 
217 aa  278  5e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3014  hypothetical protein  58.22 
 
 
230 aa  262  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  44.65 
 
 
240 aa  195  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0513  hypothetical protein  44.39 
 
 
220 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2435  hypothetical protein  42.6 
 
 
237 aa  159  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.77423 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01421  hypothetical protein  52.17 
 
 
129 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232872  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0824  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  26.74 
 
 
210 aa  72  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  27.75 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  29.01 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  28.67 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  27.92 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  24.73 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0609  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  27.94 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  23.75 
 
 
260 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  26 
 
 
237 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  28.37 
 
 
233 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  27.33 
 
 
244 aa  61.6  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  22.86 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0211  Methyltransferase type 12  24.55 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1002  methyltransferase small  31.2 
 
 
240 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  27.86 
 
 
264 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  28.48 
 
 
249 aa  51.6  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  28.48 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  26.5 
 
 
218 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1052  Methyltransferase type 12  25.71 
 
 
265 aa  48.9  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  26.04 
 
 
223 aa  48.5  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  25.17 
 
 
246 aa  48.1  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  25.34 
 
 
215 aa  48.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  25.69 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  27.03 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_41615  predicted protein  29.13 
 
 
386 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  26.5 
 
 
217 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  28.17 
 
 
240 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  26.56 
 
 
215 aa  45.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  22.63 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92828  predicted protein  25.56 
 
 
566 aa  44.3  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3352  methyltransferase small  27.61 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.054842  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  24.65 
 
 
216 aa  43.5  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01424  hypothetical protein  50 
 
 
52 aa  42.4  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  27.59 
 
 
219 aa  42.4  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  27.18 
 
 
414 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1889  O-methyltransferase  32.61 
 
 
227 aa  42  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  23.13 
 
 
218 aa  42  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35002  predicted protein  32.29 
 
 
302 aa  42  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353104  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  22.86 
 
 
223 aa  42  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04590  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.06 
 
 
210 aa  41.6  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.886413  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>