166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3202 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3202  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  206  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  72.55 
 
 		 184 aa  161  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0682  hypothetical protein  69.61 
 
 		 184 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.634771  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3939  hypothetical protein  69.61 
 
 		 204 aa  149  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143914  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3880  hypothetical protein  69.61 
 
 		 188 aa  149  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000226161  hitchhiker  0.000000250469 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0895  hypothetical protein  70.3 
 
 		 184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.363973  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3467  hypothetical protein  70.3 
 
 		 184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950509  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0909  hypothetical protein  69.31 
 
 		 197 aa  144  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3590  hypothetical protein  69.31 
 
 		 184 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.976053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3391  protein of unknown function UPF0016  69.31 
 
 		 184 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  68.32 
 
 		 184 aa  142  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3028  hypothetical protein  69.31 
 
 		 198 aa  142  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.521433 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1071  hypothetical protein  66.67 
 
 		 197 aa  142  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0946  hypothetical protein  68.32 
 
 		 198 aa  141  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3189  hypothetical protein  68.63 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372005  normal  0.740442 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0914  hypothetical protein  68.32 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2940  hypothetical protein  62.75 
 
 		 186 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.835594  normal  0.0290979 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  63.92 
 
 		 194 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0788  hypothetical protein  63.92 
 
 		 194 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  62.89 
 
 		 194 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  62.89 
 
 		 194 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  59 
 
 		 203 aa  121  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  55.88 
 
 		 189 aa  121  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  60.2 
 
 		 194 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61260  hypothetical protein  65.88 
 
 		 192 aa  116  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  59.18 
 
 		 194 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  58.16 
 
 		 194 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  57.43 
 
 		 204 aa  111  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  57.43 
 
 		 192 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  56.57 
 
 		 191 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1080  membrane protein  55 
 
 		 189 aa  111  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2409  hypothetical protein  52.58 
 
 		 183 aa  110  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936736  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  54.9 
 
 		 190 aa  110  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  56.44 
 
 		 192 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  57.43 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41250  hypothetical protein  63.95 
 
 		 193 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396742  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3666  hypothetical protein  63.95 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  54.37 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  55.34 
 
 		 190 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5275  hypothetical protein  64.56 
 
 		 192 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.932867  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001996  hypothetical protein  51.02 
 
 		 184 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  107  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  54.37 
 
 		 234 aa  105  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  55 
 
 		 190 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  55 
 
 		 190 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  53.85 
 
 		 218 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  55 
 
 		 190 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  55 
 
 		 190 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  55 
 
 		 190 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  55 
 
 		 190 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  55 
 
 		 190 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  53 
 
 		 194 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00451  hypothetical protein  50 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  53.4 
 
 		 218 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  54.37 
 
 		 187 aa  104  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  53.4 
 
 		 218 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  55.88 
 
 		 191 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  51.46 
 
 		 190 aa  103  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2497  hypothetical protein  50 
 
 		 200 aa  103  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  54.9 
 
 		 190 aa  102  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  54.37 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  52.94 
 
 		 196 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  54.37 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  54.37 
 
 		 218 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  50.96 
 
 		 204 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  52.63 
 
 		 190 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  43.14 
 
 		 185 aa  97.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  46.67 
 
 		 191 aa  97.1  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  50.53 
 
 		 190 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  54.84 
 
 		 187 aa  94.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  51.02 
 
 		 196 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  49.52 
 
 		 206 aa  94  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0447  hypothetical protein  48.98 
 
 		 191 aa  94  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  42.16 
 
 		 185 aa  94  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  49.5 
 
 		 188 aa  92.8  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0887  hypothetical protein  49.04 
 
 		 241 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  45 
 
 		 201 aa  90.1  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  48.48 
 
 		 195 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  46.39 
 
 		 191 aa  89  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3626  hypothetical protein  47.42 
 
 		 185 aa  88.2  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1560  membrane protein-like protein  48.96 
 
 		 190 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00722707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  45.1 
 
 		 193 aa  83.6  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  47 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  46.94 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  46.94 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1189  protein of unknown function UPF0016  45.07 
 
 		 72 aa  71.2  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.123696 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  38.3 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  36.73 
 
 		 213 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  40.21 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  45.92 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  32.32 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  38.3 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04814  UPF0016 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07080)  38.55 
 
 		 516 aa  60.1  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0310386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  38.3 
 
 		 216 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  38.38 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  40.45 
 
 		 238 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  34.38 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  35.71 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  37.14 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440587 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>