More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3170 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  45.83 
 
 		 1034 aa  915    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3080  acriflavin resistance protein  40.19 
 
 		 1045 aa  724    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.907454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  47.09 
 
 		 1030 aa  936    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  38.3 
 
 		 1024 aa  687    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  42.8 
 
 		 1038 aa  767    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.77 
 
 		 1024 aa  743    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  46.59 
 
 		 1031 aa  923    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3926  AcrB/AcrD/AcrF family protein  45.48 
 
 		 1029 aa  872    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3314  acriflavin resistance protein  99.52 
 
 		 1047 aa  2106    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.378933 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.2 
 
 		 1031 aa  908    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3484  AcrB/AcrD/AcrF family protein  94.17 
 
 		 1046 aa  1942    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  46.59 
 
 		 1031 aa  924    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  47.22 
 
 		 1031 aa  932    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  38.12 
 
 		 1025 aa  680    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  76.8 
 
 		 1037 aa  1611    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  37.14 
 
 		 1037 aa  660    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  39.57 
 
 		 1022 aa  740    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  41.22 
 
 		 1048 aa  800    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  80.29 
 
 		 1042 aa  1655    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  40.61 
 
 		 1023 aa  717    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01921  acriflavin resistance protein  44.13 
 
 		 1041 aa  822    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413816  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2321  acriflavin resistance protein  47.84 
 
 		 1052 aa  862    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0273304 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0473  acriflavin resistance protein  74.17 
 
 		 1033 aa  1553    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.239628  normal  0.228728 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1200  acriflavin resistance protein  99.9 
 
 		 1047 aa  2111    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.994972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0439  putative multidrug resistance protein  76.14 
 
 		 1036 aa  1582    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00223634  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004021  RND multidrug efflux transporter  76.12 
 
 		 1037 aa  1583    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0276647  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  45.78 
 
 		 1035 aa  917    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  82.21 
 
 		 1036 aa  1752    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  36.79 
 
 		 1064 aa  677    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2000  acriflavin resistance protein  42.43 
 
 		 1028 aa  808    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3170  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1047 aa  2113    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130532  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2787  acriflavin resistance protein  94.36 
 
 		 1046 aa  1951    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000304862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  41.46 
 
 		 1037 aa  786    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0365  acriflavin resistance protein  37.93 
 
 		 1037 aa  671    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  38.57 
 
 		 1029 aa  709    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  83.57 
 
 		 1035 aa  1766    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  47.09 
 
 		 1034 aa  937    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  38 
 
 		 1037 aa  692    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  46.2 
 
 		 1031 aa  913    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  46.59 
 
 		 1031 aa  923    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  44.42 
 
 		 1046 aa  848    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  37.46 
 
 		 1051 aa  681    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  47.53 
 
 		 1042 aa  940    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  47.08 
 
 		 1031 aa  907    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  43.97 
 
 		 1035 aa  839    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0704  acriflavin resistance protein  47.42 
 
 		 1038 aa  896    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  36.21 
 
 		 1044 aa  640    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  46.54 
 
 		 1036 aa  880    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  36.48 
 
 		 1026 aa  657    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  36.69 
 
 		 1030 aa  636    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.55 
 
 		 1068 aa  686    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1083  acriflavin resistance protein  93.72 
 
 		 1051 aa  1939    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126768  normal  0.966269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  46.3 
 
 		 1031 aa  920    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1149  acriflavin resistance protein  94.01 
 
 		 1051 aa  1946    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460529  normal  0.362909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  46.3 
 
 		 1031 aa  920    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  41.6 
 
 		 1036 aa  776    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  80.29 
 
 		 1034 aa  1735    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  42.9 
 
 		 1040 aa  815    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  46.3 
 
 		 1031 aa  920    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1267  acriflavin resistance protein  83.24 
 
 		 1035 aa  1763    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368024  hitchhiker  0.0000615461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3203  acriflavin resistance protein  42.22 
 
 		 1041 aa  778    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3171  acriflavin resistance protein  99.9 
 
 		 1047 aa  2112    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0148776  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  46.59 
 
 		 1031 aa  923    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1083  acriflavin resistance protein  93.82 
 
 		 1051 aa  1941    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2940  acriflavin resistance protein  36.22 
 
 		 1032 aa  634  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00284054  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3736  acriflavin resistance protein  36.45 
 
 		 1036 aa  631  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2815  acriflavin resistance protein  35.28 
 
 		 1051 aa  622  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874616  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5136  acriflavin resistance protein  37.61 
 
 		 1029 aa  619  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  36.35 
 
 		 1048 aa  618  1e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2556  acriflavin resistance protein  35.38 
 
 		 1051 aa  618  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  36.59 
 
 		 1040 aa  612  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56890  multidrug efflux protein  35.6 
 
 		 1018 aa  609  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4944  multidrug efflux protein  35.5 
 
 		 1018 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.978867  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1234  RND efflux transporter  34.87 
 
 		 1019 aa  603  1.0000000000000001e-171  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0277  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  35.93 
 
 		 1043 aa  600  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517386  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1193  acriflavin resistance plasma membrane protein  34.77 
 
 		 1019 aa  602  1e-170  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0291  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  35.83 
 
 		 1043 aa  598  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.601595  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0767  acriflavin resistance plasma membrane protein  33.76 
 
 		 1022 aa  595  1e-168  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.450822  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0906  multidrug efflux protein  35.2 
 
 		 1014 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1208  multidrug efflux protein  34.76 
 
 		 1017 aa  593  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584016  normal  0.669413 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0945  multidrug efflux protein  35.4 
 
 		 1014 aa  595  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2796  acriflavin resistance protein  34.54 
 
 		 1040 aa  595  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4481  multidrug efflux protein  35.36 
 
 		 1014 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750514  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0306  RND efflux transporter  34.24 
 
 		 1044 aa  590  1e-167  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2270  acriflavin resistance protein  34.44 
 
 		 1049 aa  591  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446759  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5577  acriflavin resistance protein  36.43 
 
 		 1037 aa  590  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.500475 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0342  acriflavin resistance protein  35.72 
 
 		 1050 aa  590  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.467499  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0945  acriflavin resistance protein  34.37 
 
 		 1040 aa  592  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000402917 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3496  acriflavin resistance protein  35.15 
 
 		 1026 aa  587  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2552  putative multidrug resistance protein  34.6 
 
 		 1036 aa  588  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000475921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1088  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  35.23 
 
 		 1029 aa  585  1.0000000000000001e-165  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4493  multidrug efflux protein  34.25 
 
 		 1009 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361963 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1198  RND efflux transporter  33.56 
 
 		 1022 aa  585  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2173  acriflavin resistance protein  34.66 
 
 		 1029 aa  579  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310659  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1581  acriflavin resistance protein  35.24 
 
 		 1026 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0974  multidrug efflux protein  34.82 
 
 		 1014 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543426  normal  0.0386559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2847  RND family multidrug efflux protein  34.16 
 
 		 1032 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2065  acriflavin resistance protein  35.14 
 
 		 1027 aa  579  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.824615  normal  0.45428 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3476  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 		 1028 aa  573  1.0000000000000001e-162  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1496  acriflavin resistance protein  35.76 
 
 		 1025 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.431205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>