78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3091 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3234  short chain fatty acid transporter  98.23 
 
 
451 aa  872    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3088  short chain fatty acid transporter  81.82 
 
 
436 aa  712    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3081  short chain fatty acid transporter  98.89 
 
 
451 aa  876    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.45839  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1201  short chain fatty acid transporter  92.9 
 
 
447 aa  786    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2982  short chain fatty acid transporter  91.57 
 
 
442 aa  769    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2886  short chain fatty acid transporter  92.02 
 
 
442 aa  773    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2803  short chain fatty acid transporter  91.8 
 
 
442 aa  769    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3091  short chain fatty acid transporter  100 
 
 
451 aa  891    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2938  short chain fatty acid transporter  70.44 
 
 
436 aa  642    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1286  short chain fatty acid transporter  99.11 
 
 
451 aa  879    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.567744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1391  Short-chain fatty acid transporter  90.24 
 
 
443 aa  780    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1445  short chain fatty acid transporter  71.11 
 
 
435 aa  615  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01176  hypothetical Short chain fatty acid transporter  70.89 
 
 
435 aa  610  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.680659  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0888  short chain fatty acid transporter  58.77 
 
 
439 aa  523  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2249  short chain fatty acid transporter  52.75 
 
 
440 aa  488  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3052  short chain fatty acid transporter  53.61 
 
 
457 aa  482  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3308  hypothetical protein  47.52 
 
 
448 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3097  short-chain fatty acids transporter  47.52 
 
 
448 aa  423  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3000  short-chain fatty acids transporter  47.52 
 
 
448 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3110  hypothetical protein  47.08 
 
 
448 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3328  hypothetical protein  47.3 
 
 
448 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3356  hypothetical protein  47.08 
 
 
448 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3315  hypothetical protein  47.52 
 
 
448 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3329  hypothetical protein  47.08 
 
 
448 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3033  short chain fatty acid transporter  47.3 
 
 
448 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.625274  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1137  short chain fatty acid transporter  48.25 
 
 
462 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.534367 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2364  putative short chain fatty acid transporter  43.71 
 
 
440 aa  404  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02109  hypothetical protein  43.71 
 
 
440 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1435  short chain fatty acid transporter  43.71 
 
 
440 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.203536  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02150  short chain fatty acid transporter  43.71 
 
 
440 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.795271  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1427  short chain fatty acid transporter  43.71 
 
 
440 aa  404  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2372  putative short chain fatty acid transporter  43.71 
 
 
440 aa  404  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.608941  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1677  hypothetical protein  46.62 
 
 
440 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121429  normal  0.563194 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4279  short chain fatty acid transporter  46.85 
 
 
440 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0354483  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2108  short chain fatty acid transporter  44.06 
 
 
448 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.289141  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4221  short chain fatty acid transporter  46.4 
 
 
440 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545369  normal  0.396779 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1708  short chain fatty acid transporter  47.48 
 
 
446 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0831  hypothetical protein  45.64 
 
 
456 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627864  normal  0.0867852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3747  hypothetical protein  46.17 
 
 
450 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243526  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4680  short chain fatty acid transporter  43.9 
 
 
445 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556803  normal  0.668538 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3761  short chain fatty acid transporter  43.21 
 
 
442 aa  351  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0115875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3939  short chain fatty acid transporter  42.09 
 
 
445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.506022  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1419  short chain fatty acid transporter  42.89 
 
 
434 aa  333  3e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.989346 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1923  short-chain fatty acids transporter  41.61 
 
 
455 aa  326  5e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15960  short chain fatty acids transporter  41.16 
 
 
441 aa  290  4e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287757  normal  0.0635103 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2419  short chain fatty acid transporter  36.1 
 
 
464 aa  278  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3807  short chain fatty acid transporter  33.85 
 
 
474 aa  225  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.164784  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1689  short chain fatty acid transporter  32.12 
 
 
471 aa  223  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.316692 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4768  Short chain fatty acid transporter  33.94 
 
 
472 aa  217  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0243  short chain fatty acid transporter  33.71 
 
 
478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254017 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1381  Short chain fatty acid transporter  34.18 
 
 
482 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.789846  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3646  short chain fatty acid transporter  32.6 
 
 
478 aa  207  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.030585  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0648  short chain fatty acid transporter  32.18 
 
 
479 aa  205  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3457  short-chain fatty acid transporter  33.04 
 
 
472 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3147  short chain fatty acid transporter  33.63 
 
 
489 aa  203  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4199  short chain fatty acid transporter  31.98 
 
 
492 aa  202  8e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0850906  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6880  Short chain fatty acid transporter  32.82 
 
 
483 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0265966  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5759  Short chain fatty acid transporter  32.16 
 
 
482 aa  201  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0613926  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2433  short chain fatty acid transporter  32.87 
 
 
472 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3124  short-chain fatty acid transporter family protein  32.26 
 
 
472 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.04212  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2733  short chain fatty acid transporter  32.26 
 
 
472 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2592  short chain fatty acid transporter  32.26 
 
 
509 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3239  Short chain fatty acid transporter  34.54 
 
 
472 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.243579  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2232  short chain fatty acid transporter  30.82 
 
 
474 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.606878  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38610  hypothetical protein  34.31 
 
 
474 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.457227  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4736  short chain fatty acid transporter  33.33 
 
 
491 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2627  short chain fatty acid transporter  34.23 
 
 
479 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.764911  normal  0.061315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2348  short chain fatty acid transporter  34.23 
 
 
479 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.294076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3291  hypothetical protein  33.48 
 
 
474 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2304  short chain fatty acid transporter  33.99 
 
 
479 aa  187  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856531  normal  0.0189751 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33780  Short chain fatty acid transporter family protein  32.07 
 
 
494 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368969  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01760  hypothetical protein  24.61 
 
 
500 aa  51.2  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1853  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  24.54 
 
 
461 aa  48.5  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000744962  normal  0.0199441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1143  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  45.1 
 
 
484 aa  47.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.171784  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2668  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  43.86 
 
 
460 aa  47.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0018  AbgT putative transporter  37.1 
 
 
511 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1145  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  30.61 
 
 
464 aa  44.3  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.400945  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0064  AbgT putative transporter  38.1 
 
 
518 aa  43.1  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000877421  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>