66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3076 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  273  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  98.53 
 
 
136 aa  269  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  97.79 
 
 
136 aa  269  9e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  97.79 
 
 
136 aa  236  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  72.06 
 
 
135 aa  203  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  64.71 
 
 
136 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  56.35 
 
 
141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  52.24 
 
 
138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  53.03 
 
 
137 aa  140  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  50.38 
 
 
141 aa  138  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  50 
 
 
145 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  50 
 
 
145 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  50 
 
 
145 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  50 
 
 
145 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  47.79 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  46.21 
 
 
139 aa  127  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  47.01 
 
 
137 aa  114  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  40.74 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  40.46 
 
 
143 aa  108  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  46.27 
 
 
131 aa  107  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  36.13 
 
 
145 aa  90.1  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1598  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  42.61 
 
 
132 aa  89.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000483764  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2821  hypothetical protein  41.18 
 
 
134 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0483  hypothetical protein  30.51 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0582  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00151271  hitchhiker  0.00238722 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3366  hypothetical protein  33.98 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4113  hypothetical protein  32.31 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  28.79 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3761  hypothetical protein  25.87 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  31.43 
 
 
142 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  32.46 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  33.88 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1107  hypothetical protein  30.43 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.977512  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  30.36 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2582  hypothetical protein  29.59 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3456  hypothetical protein  31.86 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02670  hypothetical protein  26.5 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  31.9 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  26.61 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3097  hypothetical protein  30.19 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0287  hypothetical protein  37.36 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4107  hypothetical protein  28.79 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  30.22 
 
 
149 aa  60.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4111  hypothetical protein  29.46 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4505  hypothetical protein  34.38 
 
 
136 aa  60.1  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646006  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01494  hypothetical protein  29.06 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4109  hypothetical protein  26.98 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1149  hypothetical protein  28.47 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2033  hypothetical protein  29.31 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3229  hypothetical protein  28.89 
 
 
146 aa  50.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0058  hypothetical protein  30.1 
 
 
139 aa  50.4  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4139  hypothetical protein  29.6 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.384863 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1335  hypothetical protein  31.3 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0885608  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0317  hypothetical protein  29.47 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00063  hypothetical protein  25.2 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2997  hypothetical protein  32.54 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.469628  normal  0.623946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0613  hypothetical protein  28.93 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.764284  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0615  hypothetical protein  26.42 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0610  hypothetical protein  31.03 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3977  hypothetical protein  27.2 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  29.01 
 
 
278 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02210  hypothetical protein  27.97 
 
 
159 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003638  hypothetical protein  24.24 
 
 
158 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0807  hypothetical protein  26.76 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  30.71 
 
 
292 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  27.35 
 
 
286 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>