78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3031 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  99.46 
 
 
186 aa  383  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  99.46 
 
 
186 aa  383  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  99.46 
 
 
186 aa  383  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  89.78 
 
 
186 aa  325  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  89.78 
 
 
186 aa  325  3e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  88.71 
 
 
186 aa  324  5e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  89.25 
 
 
186 aa  323  6e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  88.17 
 
 
186 aa  317  6e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  70.97 
 
 
186 aa  290  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  67.93 
 
 
185 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  68.82 
 
 
189 aa  285  4e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  72.58 
 
 
186 aa  267  5.9999999999999995e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  69.89 
 
 
185 aa  262  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  61.54 
 
 
185 aa  257  7e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1147  hypothetical protein  64.71 
 
 
187 aa  224  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00658881  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  35.2 
 
 
174 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  33.91 
 
 
181 aa  98.2  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  30.32 
 
 
188 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  35.14 
 
 
176 aa  91.7  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1006  hypothetical protein  30.94 
 
 
196 aa  88.6  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.230842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  32.12 
 
 
187 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1947  putative lipoprotein  33.33 
 
 
188 aa  86.3  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779715 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1660  hypothetical protein  27.22 
 
 
195 aa  85.9  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.715972  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4076  hypothetical protein  36.97 
 
 
186 aa  85.1  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1605  hypothetical protein  32.28 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  31.32 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1528  hypothetical protein  29.63 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1907  hypothetical protein  35.29 
 
 
178 aa  80.9  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905779  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00590  putative lipoprotein  30.68 
 
 
183 aa  80.9  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63340  putative lipoprotein  34.04 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0331775  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0738  hypothetical protein  31.98 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  31.38 
 
 
189 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6525  hypothetical protein  27.07 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5515  putative lipoprotein  32.98 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2866  hypothetical protein  27.07 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1146  hypothetical protein  28.8 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  31.98 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  32.95 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  32.37 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0406  putative lipoprotein  26.42 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0635  putative lipoprotein  31.14 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000348  hypothetical protein  24.44 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3290  hypothetical protein  31.28 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000451719  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06158  hypothetical protein  25 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  27.03 
 
 
194 aa  62.8  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1068  hypothetical protein  31.84 
 
 
178 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000510345  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0999  hypothetical protein  31.67 
 
 
178 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1101  hypothetical protein  31.84 
 
 
178 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  normal  0.0488625 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1444  putative lipoprotein  28.4 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0676228  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1107  hypothetical protein  24.46 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3161  hypothetical protein  22.47 
 
 
191 aa  59.7  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3234  putative lipoprotein  29.51 
 
 
192 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4152  putative lipoprotein  26.49 
 
 
183 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1735  hypothetical protein  24.58 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.428969  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2803  hypothetical protein  25.71 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.316903  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3009  hypothetical protein  30.32 
 
 
178 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  normal  0.0687233 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3187  hypothetical protein  30.69 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00707615  normal  0.59429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6323  putative lipoprotein  30.81 
 
 
189 aa  52.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4587  lipoprotein  24.24 
 
 
211 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3090  hypothetical protein  31.18 
 
 
175 aa  52  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00239332  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3597  hypothetical protein  28.11 
 
 
178 aa  51.6  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1765  hypothetical protein  25 
 
 
230 aa  49.7  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0125909  normal  0.0261997 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4738  hypothetical protein  25 
 
 
185 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0498  putative lipoprotein  26.98 
 
 
187 aa  48.5  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05585  hypothetical protein  26.26 
 
 
173 aa  48.1  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3639  lipoprotein  25.62 
 
 
191 aa  45.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.171802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3472  hypothetical protein  22.7 
 
 
177 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000238843  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1007  hypothetical protein  28.07 
 
 
178 aa  45.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613639  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3371  hypothetical protein  28.12 
 
 
179 aa  44.7  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0622  hypothetical protein  35.59 
 
 
211 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0113849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5514  hypothetical protein  24.69 
 
 
206 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0893  hypothetical protein  27.57 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000267629  normal  0.854423 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00940  hypothetical protein  24.19 
 
 
200 aa  42.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.292932  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0616  hypothetical protein  35.59 
 
 
211 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145127  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0577  hypothetical protein  35.59 
 
 
231 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.603488 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0934  hypothetical protein  24.86 
 
 
192 aa  42  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0978  hypothetical protein  25.71 
 
 
196 aa  42  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133342  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>