56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2971 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  892    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  892    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  46.61 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  44.34 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  44.34 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  44.6 
 
 		 431 aa  361  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  43.09 
 
 		 429 aa  353  4e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  42.08 
 
 		 430 aa  333  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  41.84 
 
 		 430 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  41.67 
 
 		 431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  40.7 
 
 		 433 aa  308  9e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  33.73 
 
 		 446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001173  hypothetical protein  28.19 
 
 		 440 aa  190  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  26.92 
 
 		 629 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  24.19 
 
 		 470 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  27.98 
 
 		 616 aa  84.3  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  30.3 
 
 		 618 aa  79  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  28.93 
 
 		 648 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 826 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  27.71 
 
 		 841 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  28.23 
 
 		 891 aa  67  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  24.84 
 
 		 833 aa  64.7  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  24.89 
 
 		 821 aa  64.7  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 		 822 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  24.11 
 
 		 820 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  25.42 
 
 		 823 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  26.71 
 
 		 570 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  26.64 
 
 		 812 aa  60.1  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  24.24 
 
 		 822 aa  60.1  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1044  protein of unknown function DUF115  25.77 
 
 		 560 aa  59.3  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  27.43 
 
 		 826 aa  58.9  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  26.74 
 
 		 841 aa  57.4  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1571  hypothetical protein  31.85 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  26.27 
 
 		 671 aa  56.6  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  30.57 
 
 		 626 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  25.86 
 
 		 825 aa  53.9  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  25.62 
 
 		 578 aa  54.3  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 826 aa  53.9  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 826 aa  53.9  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  22.71 
 
 		 638 aa  53.1  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  22.36 
 
 		 578 aa  49.7  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  26.18 
 
 		 833 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  24.46 
 
 		 607 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  24.85 
 
 		 632 aa  48.9  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  22.31 
 
 		 629 aa  47  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0449  hypothetical protein  25 
 
 		 509 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2415  hypothetical protein  24.67 
 
 		 656 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.174354  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0629  protein of unknown function DUF115  25.31 
 
 		 645 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822878  hitchhiker  0.000000292404 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  27.22 
 
 		 507 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  27.66 
 
 		 700 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0458  hypothetical protein  28.83 
 
 		 242 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  21.81 
 
 		 617 aa  43.9  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  27.27 
 
 		 661 aa  44.3  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  22.67 
 
 		 649 aa  43.9  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1028  hypothetical protein  36.36 
 
 		 238 aa  43.5  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.273367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0615  hypothetical protein  28.3 
 
 		 206 aa  43.1  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.835351  normal  0.116488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>