84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2862 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  55.57 
 
 
657 aa  721    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  57.4 
 
 
680 aa  699    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  98.86 
 
 
701 aa  1290    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  85.53 
 
 
696 aa  1257    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  82.67 
 
 
700 aa  1172    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  99 
 
 
701 aa  1292    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  84.96 
 
 
696 aa  1251    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1515  hypothetical protein  98.72 
 
 
701 aa  1289    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  51.11 
 
 
677 aa  675    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  100 
 
 
698 aa  1437    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  43.46 
 
 
642 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140.2  hypothetical protein  79.53 
 
 
310 aa  504  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  42.5 
 
 
655 aa  475  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  38.71 
 
 
687 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  38.54 
 
 
612 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140.3  hypothetical protein  83.13 
 
 
122 aa  155  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140.1  hypothetical protein  75 
 
 
135 aa  99  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  24.38 
 
 
778 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  21.79 
 
 
729 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  23.66 
 
 
789 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  31.11 
 
 
843 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  24.06 
 
 
639 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  21.05 
 
 
650 aa  65.1  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  23.82 
 
 
788 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  28.06 
 
 
640 aa  63.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  30.73 
 
 
639 aa  62.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  30.48 
 
 
762 aa  62  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  27.04 
 
 
639 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  25.82 
 
 
650 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  27.04 
 
 
639 aa  61.2  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  27.23 
 
 
639 aa  61.2  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  28.27 
 
 
639 aa  60.8  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  31.38 
 
 
762 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  26.32 
 
 
639 aa  60.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  30.77 
 
 
822 aa  59.7  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  31.38 
 
 
762 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  23.77 
 
 
639 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  25.99 
 
 
650 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  22.97 
 
 
639 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  29.17 
 
 
646 aa  57.4  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  29.79 
 
 
758 aa  57.4  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  26.23 
 
 
650 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  27.13 
 
 
833 aa  57.4  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  26.23 
 
 
885 aa  57  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  30.77 
 
 
789 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  29.61 
 
 
724 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  25.33 
 
 
663 aa  55.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  22.27 
 
 
731 aa  55.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  30.32 
 
 
788 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  24.15 
 
 
936 aa  55.1  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  25.57 
 
 
650 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  24.59 
 
 
639 aa  54.7  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  25.57 
 
 
650 aa  54.7  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  27.32 
 
 
731 aa  54.3  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  28.02 
 
 
754 aa  53.9  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  34.29 
 
 
764 aa  53.5  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  24.43 
 
 
730 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  24.43 
 
 
730 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  24.43 
 
 
730 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  25.23 
 
 
714 aa  52  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  26.49 
 
 
660 aa  51.6  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  28.19 
 
 
761 aa  51.6  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  28.19 
 
 
764 aa  51.6  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  28.19 
 
 
764 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  28.19 
 
 
761 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  33.91 
 
 
945 aa  51.2  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  34.34 
 
 
770 aa  51.2  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  23.85 
 
 
745 aa  50.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  31.01 
 
 
765 aa  50.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  28.11 
 
 
735 aa  49.3  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  25.99 
 
 
741 aa  48.9  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  28.99 
 
 
716 aa  48.1  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  24.48 
 
 
820 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  25.2 
 
 
757 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  23.95 
 
 
857 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  23.23 
 
 
745 aa  46.6  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  33.33 
 
 
766 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  26.19 
 
 
653 aa  45.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  28.65 
 
 
738 aa  45.8  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  24.73 
 
 
727 aa  44.7  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  20.87 
 
 
895 aa  44.3  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  24.07 
 
 
826 aa  44.3  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  28.18 
 
 
667 aa  44.3  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  26.4 
 
 
719 aa  43.9  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>