59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2760 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1490  hypothetical protein  58.36 
 
 
1124 aa  991  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00398816  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1425  hypothetical protein  59.87 
 
 
1129 aa  1041  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000113276  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2837  hypothetical protein  98.43 
 
 
1149 aa  1935  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00137938  hitchhiker  0.00529506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1478  hypothetical protein  59.69 
 
 
1115 aa  1056  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000313073  normal  0.981736 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2743  hypothetical protein  98.61 
 
 
1147 aa  1955  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  7.11361e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2442  hypothetical protein  60.64 
 
 
1097 aa  1079  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39531  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2760  hypothetical protein  100 
 
 
1143 aa  2204  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.20005e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1616  hypothetical protein  98.43 
 
 
1148 aa  1946  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000783547  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3069  hypothetical protein  57.14 
 
 
1110 aa  677  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2985  hypothetical protein  42.13 
 
 
1135 aa  633  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00018881  normal  0.421866 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1651  hypothetical protein  43.56 
 
 
945 aa  439  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000121455  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1394  ATPase  41.08 
 
 
1408 aa  416  1e-115  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2151  hypothetical protein  42.42 
 
 
937 aa  364  5e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00179894  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1616  hypothetical protein  38.57 
 
 
957 aa  340  7e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0172271  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1485  ATPase  39.46 
 
 
1761 aa  335  4e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130947  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  40.41 
 
 
895 aa  317  1e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  28.43 
 
 
1359 aa  105  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  30.25 
 
 
1482 aa  97.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002873  AAA ATPase  28.24 
 
 
1454 aa  93.2  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1074  hypothetical protein  27.02 
 
 
1273 aa  87.8  1e-15  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  34.35 
 
 
1057 aa  83.6  2e-14  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3362  ATPase  32.81 
 
 
1247 aa  77.8  1e-12  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.592552  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0519  hypothetical protein  31.25 
 
 
1621 aa  75.9  4e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  24.48 
 
 
897 aa  70.9  1e-10  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1992  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  25.1 
 
 
336 aa  69.3  4e-10  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274788  normal  0.303251 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  26.02 
 
 
888 aa  69.3  4e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  28.89 
 
 
924 aa  62.8  3e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  28.63 
 
 
806 aa  62.8  4e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  27.85 
 
 
883 aa  61.6  8e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  50 
 
 
914 aa  59.7  3e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3671  response regulator receiver protein  37.84 
 
 
391 aa  58.5  7e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0458  hypothetical protein  37.84 
 
 
384 aa  58.2  8e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3494  hypothetical protein  37.84 
 
 
386 aa  58.5  8e-07  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  31.28 
 
 
828 aa  55.8  4e-06  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  34.44 
 
 
948 aa  56.2  4e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1988  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  41.82 
 
 
323 aa  55.1  7e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.686168  normal  0.436452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  35.37 
 
 
947 aa  55.1  8e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  38.82 
 
 
931 aa  54.3  1e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  40.74 
 
 
946 aa  53.1  3e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4121  hypothetical protein  36.49 
 
 
345 aa  52.4  5e-05  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0661  hypothetical protein  44.44 
 
 
392 aa  51.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0500  hypothetical protein  41.82 
 
 
364 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  32.22 
 
 
819 aa  50.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0497  hypothetical protein  41.82 
 
 
349 aa  49.7  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3843  hypothetical protein  41.82 
 
 
364 aa  49.7  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0476  hypothetical protein  41.82 
 
 
349 aa  49.7  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  40.38 
 
 
744 aa  49.3  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1056  hypothetical protein  44.44 
 
 
312 aa  48.5  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.802166  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0955  hypothetical exported membrane associated protein  44.44 
 
 
312 aa  48.5  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0306729  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  36.44 
 
 
722 aa  47.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 
896 aa  47.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  36.44 
 
 
731 aa  47.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  36.73 
 
 
822 aa  46.2  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  44.19 
 
 
1245 aa  46.2  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  30.24 
 
 
2353 aa  45.8  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0552  hypothetical protein  33.77 
 
 
300 aa  45.4  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0446  hypothetical protein  34.43 
 
 
241 aa  45.1  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  52.27 
 
 
927 aa  45.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3759  hypothetical protein  31.68 
 
 
411 aa  44.7  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.57165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>