29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2714 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2395  hypothetical protein  89.24 
 
 
824 aa  1449  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.2798e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1693  hypothetical protein  72.54 
 
 
828 aa  1197  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  3.31771e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2408  hypothetical protein  74.73 
 
 
828 aa  1235  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0178589  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2693  hypothetical protein  99.52 
 
 
827 aa  1658  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  3.15404e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1650  hypothetical protein  63.9 
 
 
832 aa  1024  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  3.05835e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2120  hypothetical protein  70.58 
 
 
826 aa  1128  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000487086  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1529  hypothetical protein  90.34 
 
 
828 aa  1481  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00333125  hitchhiker  5.14631e-09 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2571  hypothetical protein  76.24 
 
 
829 aa  1162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1535  hypothetical protein  89.86 
 
 
828 aa  1476  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000356269  hitchhiker  0.00903713 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1469  hypothetical protein  90.93 
 
 
827 aa  1499  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  8.92624e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2791  hypothetical protein  100 
 
 
827 aa  1666  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  7.77581e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2472  hypothetical protein  65.99 
 
 
839 aa  1085  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00113127  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2904  hypothetical protein  71.82 
 
 
823 aa  1159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000289565  normal  0.061749 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1673  hypothetical protein  99.15 
 
 
827 aa  1652  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  7.08466e-06  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2934  hypothetical protein  90.08 
 
 
827 aa  1520  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2714  hypothetical protein  100 
 
 
827 aa  1666  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.60154e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1192  hypothetical protein  42.71 
 
 
866 aa  575  1e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01894  hypothetical protein  33.78 
 
 
856 aa  319  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.128925  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2182  hypothetical protein  30.91 
 
 
872 aa  310  1e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000870738  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0373  putative lipase  28.68 
 
 
796 aa  220  7e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05818  extracellular lipase  27.8 
 
 
826 aa  199  2e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000184  putative lipase  26.86 
 
 
802 aa  180  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00112998  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1215  MECDP-synthase  28.09 
 
 
993 aa  112  2e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000222829  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2036  hypothetical protein  29.96 
 
 
939 aa  72  4e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0034  hypothetical protein  28.06 
 
 
975 aa  62.8  3e-08  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.272533  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0890  hypothetical protein  28.38 
 
 
832 aa  53.1  2e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0004283  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0048  hypothetical protein  29.48 
 
 
982 aa  51.2  8e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0036  hypothetical protein  25.69 
 
 
982 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0033  hypothetical protein  28.32 
 
 
982 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>