77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2659 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 		 548 aa  1136    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  42.95 
 
 		 566 aa  347  4e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1872  hypothetical protein  31.67 
 
 		 585 aa  128  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0681  hypothetical protein  32.19 
 
 		 619 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0932  hypothetical protein  30.45 
 
 		 638 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05008  hypothetical protein  28.62 
 
 		 658 aa  99  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  30.31 
 
 		 529 aa  93.2  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  31.25 
 
 		 584 aa  83.2  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 666 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.49 
 
 		 613 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  39.05 
 
 		 574 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.22 
 
 		 708 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.45 
 
 		 652 aa  62.4  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  28.68 
 
 		 495 aa  57.4  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  30.83 
 
 		 428 aa  57  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.35 
 
 		 642 aa  57  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  26.71 
 
 		 583 aa  53.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.03 
 
 		 616 aa  52.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  30.77 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  22.35 
 
 		 572 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  38.83 
 
 		 623 aa  52  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  28.93 
 
 		 457 aa  51.2  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  31.03 
 
 		 598 aa  51.2  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  31.62 
 
 		 440 aa  51.2  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  33.33 
 
 		 680 aa  50.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  29.08 
 
 		 688 aa  50.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  25.65 
 
 		 610 aa  50.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.39 
 
 		 634 aa  50.4  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  25.58 
 
 		 497 aa  50.4  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  25 
 
 		 483 aa  50.4  0.00009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  25.42 
 
 		 429 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1481  hypothetical protein  27.43 
 
 		 140 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  26.6 
 
 		 773 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  32.91 
 
 		 378 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  33.8 
 
 		 349 aa  48.9  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0143  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.17 
 
 		 681 aa  48.5  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128728  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  24.84 
 
 		 580 aa  48.5  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  28.06 
 
 		 642 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  25.98 
 
 		 691 aa  48.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  27.2 
 
 		 596 aa  47.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  29.46 
 
 		 593 aa  47.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  24.71 
 
 		 628 aa  47.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  26.67 
 
 		 594 aa  47  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.31 
 
 		 608 aa  46.6  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  42.37 
 
 		 449 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  31.36 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5923  hypothetical protein  30.53 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3360  hypothetical protein  26.18 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1472  ATPase-like protein  31.82 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0862565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  32.97 
 
 		 600 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  32.54 
 
 		 591 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  31.86 
 
 		 650 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  27.48 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.79 
 
 		 640 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  29.47 
 
 		 439 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  40.74 
 
 		 352 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.09 
 
 		 429 aa  45.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1130  hypothetical protein  41.03 
 
 		 340 aa  45.4  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.123574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1994  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.33 
 
 		 590 aa  45.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  33 
 
 		 386 aa  45.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  27.86 
 
 		 661 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  23.78 
 
 		 773 aa  45.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  26.37 
 
 		 527 aa  44.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  46.67 
 
 		 353 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  31.82 
 
 		 553 aa  45.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  30.68 
 
 		 346 aa  45.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  35.9 
 
 		 564 aa  44.7  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1393  hypothetical protein  30.3 
 
 		 213 aa  44.3  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.197951 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1748  hypothetical protein  30.85 
 
 		 222 aa  44.7  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000301419  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  34.85 
 
 		 565 aa  44.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4992  hypothetical protein  23.4 
 
 		 380 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  25.15 
 
 		 564 aa  44.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  28.89 
 
 		 467 aa  44.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1107  hypothetical protein  23.01 
 
 		 591 aa  44.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000952777  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.21 
 
 		 603 aa  44.3  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  24.61 
 
 		 336 aa  44.3  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  33.33 
 
 		 457 aa  43.5  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>