53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2631 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2706  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  240  6e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000140382  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2631  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  240  6e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000548567  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2592  hypothetical protein  99.16 
 
 
119 aa  238  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000971711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1754  hypothetical protein  99.16 
 
 
119 aa  238  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000786654  hitchhiker  0.00155716 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2317  hypothetical protein  94.07 
 
 
119 aa  226  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000394227  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2270  hypothetical protein  92.44 
 
 
119 aa  223  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2342  hypothetical protein  92.44 
 
 
119 aa  223  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2460  hypothetical protein  91.6 
 
 
119 aa  222  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000033516  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1991  hypothetical protein  91.6 
 
 
119 aa  222  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2314  hypothetical protein  78.81 
 
 
135 aa  197  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2142  hypothetical protein  77.12 
 
 
123 aa  194  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913053  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2676  hypothetical protein  73.73 
 
 
119 aa  187  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0208691  normal  0.147736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1946  hypothetical protein  72.88 
 
 
119 aa  186  8e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000181986  normal  0.0225511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1903  hypothetical protein  74.58 
 
 
119 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000176347  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2142  hypothetical protein  66.95 
 
 
124 aa  175  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000300583  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2030  hypothetical protein  69.23 
 
 
119 aa  173  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000942918  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2265  hypothetical protein  48.31 
 
 
119 aa  117  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1415  hypothetical protein  43.59 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.130351  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2718  hypothetical protein  46.15 
 
 
123 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.145637 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0867  hypothetical protein  44.44 
 
 
131 aa  98.6  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000349479  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02381  hypothetical protein  42.73 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003401  hypothetical protein  41.82 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000284049  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0395  hypothetical protein  43.69 
 
 
127 aa  92.8  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1711  hypothetical protein  38.18 
 
 
116 aa  82  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0859  hypothetical protein  33.96 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2974  hypothetical protein  38.55 
 
 
132 aa  62  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1243  hypothetical protein  37.35 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.442213  normal  0.338722 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1166  hypothetical protein  37.35 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.599086  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3147  hypothetical protein  37.35 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00243141  normal  0.887855 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1210  hypothetical protein  37.35 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0987  hypothetical protein  37.35 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.411283  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1205  hypothetical protein  36.14 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.069384  hitchhiker  0.000375223 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3876  hypothetical protein  28.45 
 
 
119 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1097  hypothetical protein  37.35 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458042  hitchhiker  0.00682906 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2969  hypothetical protein  33.65 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  unclonable  0.0000376275 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3065  hypothetical protein  33.65 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  decreased coverage  0.0000000160498 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0614  hypothetical protein  35.85 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1019  hypothetical protein  37.35 
 
 
128 aa  57.4  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00054643  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2813  hypothetical protein  34.94 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.215215  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1306  hypothetical protein  33.71 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1125  hypothetical protein  36.14 
 
 
126 aa  57  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0604212  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0845  hypothetical protein  34.94 
 
 
150 aa  57  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0390  hypothetical protein  28.7 
 
 
127 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00395  hypothetical protein  31.53 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243677  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0369  hypothetical protein  33.73 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0352181  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2887  hypothetical protein  31.73 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.884859  hitchhiker  0.00000327359 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01861  hypothetical protein  31.31 
 
 
129 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0293  hypothetical protein  31.31 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000415499  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003821  hypothetical protein  32 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0228492  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1422  hypothetical protein  30.23 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.6699 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2943  hypothetical protein  31.13 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869989  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1738  hypothetical protein  22.45 
 
 
221 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3246  hypothetical protein  31.33 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>