40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2558 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2558  putative replication protein  100 
 
 		 263 aa  547  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3490  hypothetical protein  93.53 
 
 		 278 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314566  unclonable  0.00000747295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1975  hypothetical protein  93.17 
 
 		 278 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00555051  normal  0.0479802 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2025  hypothetical protein  91.73 
 
 		 278 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0214118  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3366  putative replication protein  92.81 
 
 		 278 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263749  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3257  putative replication protein  91.01 
 
 		 278 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.699419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3394  putative replication protein  65.29 
 
 		 285 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000899226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1858  putative replication protein  64.95 
 
 		 285 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0634038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1970  putative replication protein  64.95 
 
 		 285 aa  352  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068192  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0743  putative replication protein  68.3 
 
 		 249 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3612  putative replication protein  68.3 
 
 		 249 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000425732  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0773  hypothetical protein  67.92 
 
 		 249 aa  345  5e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0770  hypothetical protein  67.69 
 
 		 244 aa  337  9e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  normal  0.283783 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1653  hypothetical protein  51.49 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000671597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2159  replication protein  41.54 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000201859  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3439  putative transcriptional regulator  59.82 
 
 		 249 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119584  unclonable  9.09525e-17 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1139  replication protein  54.64 
 
 		 326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00398063  hitchhiker  2.1893400000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3117  hypothetical protein  31.19 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1691  hypothetical protein  50 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1318  hypothetical protein  35.48 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3327  hypothetical protein  28.89 
 
 		 344 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4446  phage O protein family  28.93 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  unclonable  0.00000000141211 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3263  hypothetical protein  25 
 
 		 294 aa  52.8  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.102407  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1032  gp69  41.89 
 
 		 86 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110113  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6178  hypothetical protein  25.78 
 
 		 431 aa  49.7  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0794  hypothetical protein  28.36 
 
 		 243 aa  49.3  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436094 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1423  hypothetical protein  29.35 
 
 		 269 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1441  hypothetical protein  29.35 
 
 		 269 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0691  hypothetical protein  85.19 
 
 		 57 aa  48.9  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000499925  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1433  phage O protein family  25.35 
 
 		 320 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000630558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  37.93 
 
 		 455 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6266  hypothetical protein  28.74 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1259  phage O family protein  27.48 
 
 		 315 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000280847  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0383  hypothetical protein  25.76 
 
 		 333 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.455969  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01960  hypothetical protein  33.8 
 
 		 318 aa  45.8  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0244  hypothetical protein  38.46 
 
 		 80 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.201216  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06400  hypothetical protein  31.91 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2276  phage O protein  25.15 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000295472  hitchhiker  0.000000000000106842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3746  hypothetical protein  27.63 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1425  hypothetical protein  36.92 
 
 		 328 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>