31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2396 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2407  hypothetical protein  98.8 
 
 		 333 aa  682    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000906332  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1951  hypothetical protein  98.5 
 
 		 333 aa  682    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000771271  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2512  hypothetical protein  99.7 
 
 		 333 aa  687    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00018403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2396  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  688    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000113685  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2159  hypothetical protein  74.78 
 
 		 336 aa  528  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.133255  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1729  hypothetical protein  68.22 
 
 		 343 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.414715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2290  hypothetical protein  68.33 
 
 		 341 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000825064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1809  hypothetical protein  66.96 
 
 		 342 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.688217  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2254  hypothetical protein  66.97 
 
 		 332 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2400  hypothetical protein  45.03 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000014454  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1673  hypothetical protein  42.11 
 
 		 382 aa  251  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000117038  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2834  hypothetical protein  43.26 
 
 		 315 aa  249  6e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000562067  hitchhiker  0.000583548 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1810  hypothetical protein  40.74 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000100473  normal  0.0432271 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1542  hypothetical protein  40.07 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000050026  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1629  hypothetical protein  38.44 
 
 		 312 aa  222  9e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000041783  normal  0.218366 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1329  hypothetical protein  33.94 
 
 		 394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.50236  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003995  hypothetical protein  33.64 
 
 		 243 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.910417  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01527  hypothetical protein  32.05 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1477  hypothetical protein  35.75 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.235152  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0697  hypothetical protein  27.76 
 
 		 296 aa  100  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147007  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2205  hypothetical protein  23.93 
 
 		 254 aa  94  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0128362  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1724  hypothetical protein  27.09 
 
 		 475 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0634806  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2138  putative lipoprotein  38.54 
 
 		 565 aa  74.3  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129956  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02438  hypothetical protein  34.65 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.477602  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1357  hypothetical protein  28.76 
 
 		 246 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1258  hypothetical protein  23.1 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1801  hypothetical protein  28.48 
 
 		 222 aa  53.5  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1795  hypothetical protein  25.37 
 
 		 344 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00014706  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1778  hypothetical protein  25.57 
 
 		 184 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1777  hypothetical protein  25.57 
 
 		 184 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1167  hypothetical protein  29.76 
 
 		 208 aa  45.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000681695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>