More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2278 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2395  integration host factor subunit beta  100 
 
 
95 aa  194  2e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  3.43473e-08  unclonable  7.62549e-06 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2067  integration host factor subunit beta  100 
 
 
95 aa  194  2e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  4.78736e-09  unclonable  1.2991e-12 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2071  integration host factor subunit beta  100 
 
 
95 aa  194  2e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  3.4854e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2278  integration host factor subunit beta  100 
 
 
95 aa  194  2e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  8.37765e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2401  integration host factor subunit beta  98.95 
 
 
95 aa  192  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2053  integration host factor subunit beta  98.95 
 
 
95 aa  192  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.59286e-07  unclonable  2.44011e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1978  integration host factor subunit beta  98.95 
 
 
95 aa  192  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.61968e-09  unclonable  4.7672e-11 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1925  integration host factor subunit beta  98.95 
 
 
95 aa  192  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  5.15528e-10  unclonable  2.66845e-11 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2041  integration host factor subunit beta  97.89 
 
 
95 aa  191  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  7.05182e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2122  integration host factor subunit beta  96.81 
 
 
95 aa  188  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  5.93472e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1737  integration host factor subunit beta  94.74 
 
 
95 aa  187  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.22677e-08  hitchhiker  0.00231326 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1754  integration host factor subunit beta  94.74 
 
 
95 aa  186  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.4676e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1955  integration host factor subunit beta  94.68 
 
 
95 aa  185  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  4.68135e-09  unclonable  3.20833e-06 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2074  integration host factor subunit beta  92.63 
 
 
95 aa  184  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  5.49511e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2297  integration host factor subunit beta  90.53 
 
 
95 aa  182  2e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.02507e-08  unclonable  6.97895e-11 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2312  integration host factor subunit beta  90.53 
 
 
95 aa  179  8e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.59711e-07  hitchhiker  3.00932e-07 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2236  integration host factor subunit beta  82.42 
 
 
95 aa  156  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00572513  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02859  integration host factor subunit beta  80.22 
 
 
94 aa  155  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003021  integration host factor beta subunit  80.22 
 
 
93 aa  155  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  9.32268e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1431  integration host factor subunit beta  79.12 
 
 
95 aa  154  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0064808  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1047  integration host factor subunit beta  79.12 
 
 
94 aa  154  5e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.788464 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1095  integration host factor subunit beta  79.12 
 
 
94 aa  154  5e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.939272  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0988  integration host factor subunit beta  79.12 
 
 
94 aa  154  5e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.165109  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1015  integration host factor subunit beta  79.12 
 
 
94 aa  154  5e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.613855  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1080  integration host factor subunit beta  79.12 
 
 
94 aa  154  5e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0899853 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1018  integration host factor subunit beta  79.12 
 
 
94 aa  153  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.22422e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1009  integration host factor subunit beta  79.12 
 
 
94 aa  153  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.70398e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00916  integration host factor subunit beta  79.12 
 
 
94 aa  153  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1073  integration host factor subunit beta  79.12 
 
 
94 aa  153  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0306564  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2684  integration host factor subunit beta  79.12 
 
 
94 aa  153  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193078  normal  0.358809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2208  integration host factor subunit beta  79.12 
 
 
94 aa  153  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  1.05854e-05  normal  0.266842 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2731  integration host factor, beta subunit  79.12 
 
 
94 aa  153  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00160452  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2416  integration host factor subunit beta  79.12 
 
 
94 aa  153  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000431379  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00923  hypothetical protein  79.12 
 
 
94 aa  153  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.294308  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2338  integration host factor subunit beta  80.22 
 
 
94 aa  153  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2004  integration host factor subunit beta  79.12 
 
 
94 aa  152  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.143906  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2222  integration host factor subunit beta  78.02 
 
 
93 aa  152  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  1.09165e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1736  integration host factor subunit beta  79.12 
 
 
94 aa  152  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.060047  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1504  integration host factor subunit beta  76.92 
 
 
92 aa  152  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.78051e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2336  integration host factor, beta subunit  80.22 
 
 
95 aa  151  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00131749  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15880  integration host factor subunit beta  76.92 
 
 
92 aa  150  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1968  integration host factor subunit beta  78.02 
 
 
94 aa  150  6e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.943011  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23340  integration host factor subunit beta  78.02 
 
 
94 aa  150  6e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.16436e-08  hitchhiker  0.00519002 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1855  integration host factor subunit beta  76.92 
 
 
95 aa  149  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1773  integration host factor subunit beta  76.92 
 
 
100 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976325  normal  0.0185498 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3941  integration host factor subunit beta  76.92 
 
 
98 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.21925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1380  integration host factor subunit beta  76.92 
 
 
98 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1365  integration host factor subunit beta  76.92 
 
 
98 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.361598  normal  0.0158973 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1710  integration host factor subunit beta  75.82 
 
 
94 aa  147  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000353276  normal  0.984922 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3641  integration host factor subunit beta  75.82 
 
 
98 aa  147  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222556  normal  0.634422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1751  integration host factor, beta subunit  75.82 
 
 
98 aa  147  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162553  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4060  integration host factor subunit beta  75.82 
 
 
98 aa  147  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.343947 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2579  integration host factor subunit beta  76.92 
 
 
94 aa  147  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.35913e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2667  integration host factor subunit beta  76.92 
 
 
94 aa  147  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00090839  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1956  integration host factor subunit beta  76.92 
 
 
94 aa  147  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.4151e-06  normal  0.296627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2152  integration host factor, beta subunit  73.91 
 
 
98 aa  145  1e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0462696  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2465  integration host factor subunit beta  74.73 
 
 
96 aa  146  1e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  8.04162e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3012  integration host factor, beta subunit  70.21 
 
 
95 aa  144  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000121818  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2135  hypothetical protein  73.63 
 
 
98 aa  144  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00481013  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1544  integration host factor, beta subunit  71.28 
 
 
96 aa  143  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3223  integration host factor, beta subunit  73.63 
 
 
102 aa  140  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00795206  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1647  integration host factor subunit beta  72.04 
 
 
101 aa  139  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0979657  normal  0.0681876 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0181  integration host factor, beta subunit  72.53 
 
 
113 aa  139  1e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000858176  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0932  integration host factor subunit beta  71.74 
 
 
100 aa  139  2e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.802461  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1596  integration host factor subunit beta  70.97 
 
 
111 aa  138  3e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.878202  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00892  integration host factor subunit beta  70.97 
 
 
103 aa  138  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1539  integration host factor subunit beta  70.97 
 
 
104 aa  137  4e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.874704  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  68.48 
 
 
102 aa  134  3e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  67.03 
 
 
98 aa  134  3e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1329  integration host factor, beta subunit  65.93 
 
 
101 aa  133  6e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0690057  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1213  integration host factor, beta subunit  64.21 
 
 
98 aa  130  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0453781  normal  0.184792 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0975  integration host factor subunit beta  64.84 
 
 
94 aa  130  7e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  5.16669e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1199  integration host factor, beta subunit  67.39 
 
 
108 aa  129  1e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1411  integration host factor, beta subunit  64.52 
 
 
95 aa  127  5e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00234399  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2068  integration host factor, beta subunit  62.77 
 
 
94 aa  123  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00010112  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3034  integration host factor subunit beta  65.93 
 
 
95 aa  122  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0949718  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1281  integration host factor subunit beta  63.74 
 
 
94 aa  123  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.218086  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0926  integration host factor, beta subunit  64.13 
 
 
95 aa  120  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00174707  normal  0.404226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1070  integration host factor, beta subunit  64.13 
 
 
95 aa  120  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00234309  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1931  integration host factor, beta subunit  61.54 
 
 
112 aa  118  2e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0262  integration host factor beta-subunit  61.54 
 
 
112 aa  119  2e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3026  hypothetical protein  61.96 
 
 
103 aa  119  2e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2884  hypothetical protein  61.96 
 
 
103 aa  119  2e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0957  integration host factor, beta subunit  61.54 
 
 
94 aa  118  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00640345  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2797  integration host factor, beta subunit  59.78 
 
 
104 aa  116  1e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0983  integration host factor subunit beta  62.64 
 
 
107 aa  115  2e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131421  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0747  integration host factor subunit beta  61.54 
 
 
107 aa  114  4e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189639  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2256  integration host factor subunit beta  59.78 
 
 
107 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1048  integration host factor subunit beta  60.44 
 
 
107 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1007  integration host factor subunit beta  60.44 
 
 
107 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864933  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4161  integration host factor subunit beta  60.44 
 
 
107 aa  114  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0569  integration host factor subunit beta  60.44 
 
 
107 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3000  integration host factor subunit beta  61.54 
 
 
107 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125834  hitchhiker  0.00514155 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2881  integration host factor subunit beta  59.78 
 
 
107 aa  113  7e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601006  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2944  integration host factor subunit beta  59.78 
 
 
107 aa  113  7e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.846703  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0427  integration host factor subunit beta  59.78 
 
 
107 aa  113  7e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.496954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0946  integration host factor subunit beta  59.78 
 
 
107 aa  113  7e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2992  integration host factor subunit beta  59.78 
 
 
107 aa  113  7e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0202  integration host factor subunit beta  59.78 
 
 
107 aa  113  7e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2571  integration host factor subunit beta  59.78 
 
 
107 aa  113  7e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.444385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>