More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2255 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  72.19 
 
 
696 aa  1026  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1870  prolyl oligopeptidase  90.96 
 
 
697 aa  1333  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010219  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2255  prolyl oligopeptidase  100 
 
 
697 aa  1447  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.70623e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2047  prolyl oligopeptidase family protein  90.82 
 
 
697 aa  1333  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3481  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  51.69 
 
 
698 aa  657  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.452297 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3635  prolyl oligopeptidase  78.48 
 
 
697 aa  1155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2104  prolyl oligopeptidase  91.25 
 
 
697 aa  1339  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.949573 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2940  prolyl oligopeptidase  65.55 
 
 
710 aa  969  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.029506  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2229  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  91.68 
 
 
697 aa  1342  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271219  normal  0.279234 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  76.33 
 
 
695 aa  1122  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2098  prolyl oligopeptidase  96.58 
 
 
701 aa  1406  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0491197  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2372  prolyl oligopeptidase  99 
 
 
697 aa  1434  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  9.69986e-05  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2090  Prolyl oligopeptidase  99.43 
 
 
697 aa  1439  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  3.97024e-07  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10470  serine protease, S9A family peptidase  47.43 
 
 
695 aa  644  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.447718  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04132  prolyl oligopeptidase family protein  49.71 
 
 
697 aa  647  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4870  prolyl oligopeptidase  46.91 
 
 
722 aa  629  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0527  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  43.7 
 
 
712 aa  603  1e-171  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2232  prolyl oligopeptidase  47.53 
 
 
696 aa  604  1e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  4.49493e-05 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0734  Prolyl oligopeptidase  45.83 
 
 
681 aa  605  1e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1717  Prolyl oligopeptidase  44.49 
 
 
711 aa  598  1e-170  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5550  prolyl oligopeptidase  45.12 
 
 
685 aa  600  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11141  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4802  Prolyl oligopeptidase  44.28 
 
 
697 aa  597  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3948  prolyl oligopeptidase  45.81 
 
 
702 aa  598  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27550  serine protease, S9A family peptidase  45.08 
 
 
684 aa  578  1e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143413  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3695  Prolyl oligopeptidase  45.92 
 
 
711 aa  578  1e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.432018 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0018  prolyl oligopeptidase  43.42 
 
 
734 aa  578  1e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0127  prolyl oligopeptidase  44.48 
 
 
681 aa  574  1e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268487  normal  0.664809 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3675  Prolyl oligopeptidase  45.49 
 
 
676 aa  574  1e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169529  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08100  serine protease, S9A family peptidase  42.8 
 
 
718 aa  569  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.64586  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0785  prolyl oligopeptidase  43 
 
 
676 aa  572  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2406  Prolyl oligopeptidase  43.6 
 
 
741 aa  571  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0714975  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0623  prolyl oligopeptidase  44.31 
 
 
663 aa  568  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0636  prolyl oligopeptidase  44.31 
 
 
663 aa  568  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0616  prolyl oligopeptidase  44.31 
 
 
663 aa  568  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10464  peptidase  41.89 
 
 
673 aa  542  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46548  predicted protein  41.2 
 
 
793 aa  532  1e-150  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.560157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1575  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  39.3 
 
 
689 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.416  hitchhiker  0.0027772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0822  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.95 
 
 
767 aa  463  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1125  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.47 
 
 
721 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00651092  normal  0.350875 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.97 
 
 
770 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2146  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.78 
 
 
721 aa  453  1e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466085  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2164  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.93 
 
 
702 aa  453  1e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.876944  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5931  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  36.78 
 
 
721 aa  453  1e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662237  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0927  prolyl oligopeptidase family protein  37.83 
 
 
732 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1911  serine protease  37.83 
 
 
776 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1414  prolyl oligopeptidase family protein  37.83 
 
 
698 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1824  prolyl oligopeptidase family protein  37.83 
 
 
776 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0454  prolyl oligopeptidase family protein  37.83 
 
 
698 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.192276  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0193  prolyl oligopeptidase family protein  37.83 
 
 
772 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0367  prolyl oligopeptidase family protein  37.83 
 
 
782 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5455  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  37.63 
 
 
704 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2056  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.14 
 
 
703 aa  446  1e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.273173  normal  0.9211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.14 
 
 
707 aa  446  1e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2612  Prolyl oligopeptidase  38.28 
 
 
699 aa  447  1e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.270584 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1083  prolyl oligopeptidase family protein  37.68 
 
 
748 aa  442  1e-122  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.166772  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1525  prolyl oligopeptidase family protein  37.57 
 
 
694 aa  441  1e-122  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466095  normal  0.0843483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0699  putative prolyl oligopeptidase  35.28 
 
 
688 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593093  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7360  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.15 
 
 
691 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283039  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5937  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.97 
 
 
696 aa  416  1e-115  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.06347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6607  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.38 
 
 
691 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1218  Prolyl oligopeptidase  31.49 
 
 
680 aa  306  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  2.31766e-06 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1073  Prolyl oligopeptidase  30.91 
 
 
680 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594316  decreased coverage  5.14493e-06 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  30.26 
 
 
1283 aa  279  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  30.98 
 
 
701 aa  268  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  39.34 
 
 
719 aa  265  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  30.17 
 
 
724 aa  259  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  44.19 
 
 
703 aa  258  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  28.75 
 
 
682 aa  258  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  29.27 
 
 
689 aa  256  9e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2458  Prolyl oligopeptidase  29.67 
 
 
713 aa  255  2e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.768929  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  29.76 
 
 
700 aa  255  2e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  48.19 
 
 
704 aa  253  6e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  28.68 
 
 
703 aa  252  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  30.17 
 
 
688 aa  251  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  28.35 
 
 
677 aa  250  7e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  29.06 
 
 
679 aa  250  7e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  29.3 
 
 
685 aa  248  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1195  prolyl endopeptidase  36.41 
 
 
685 aa  243  7e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00494828  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  37.15 
 
 
703 aa  242  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  41.33 
 
 
688 aa  241  3e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  41.33 
 
 
688 aa  241  3e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  36.34 
 
 
726 aa  241  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  35.42 
 
 
707 aa  240  6e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  28.65 
 
 
689 aa  239  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01001  Prolyl endopeptidase  29.09 
 
 
719 aa  239  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  38.08 
 
 
745 aa  239  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  38.56 
 
 
723 aa  239  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  28.97 
 
 
719 aa  237  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  28.88 
 
 
708 aa  236  1e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02385  Prolyl endopeptidase  30.17 
 
 
719 aa  235  2e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  29.21 
 
 
685 aa  234  4e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  43.82 
 
 
695 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  37.16 
 
 
718 aa  230  7e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  44.92 
 
 
719 aa  229  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  44.02 
 
 
711 aa  229  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  29.42 
 
 
730 aa  229  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1522  prolyl oligopeptidase  38.77 
 
 
696 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6440  Prolyl oligopeptidase  29 
 
 
666 aa  227  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575381  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  41.64 
 
 
690 aa  227  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2543  prolyl oligopeptidase  42.81 
 
 
690 aa  225  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768819  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>