63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2208 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2198  sulfur relay protein TusB/DsrH  100 
 
 
93 aa  190  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.67344e-08  normal  0.0843026 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2163  DsrH family protein  100 
 
 
93 aa  190  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  8.86637e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2316  DsrH family protein  100 
 
 
93 aa  190  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.9534e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2208  DsrH family protein  100 
 
 
93 aa  190  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000178516  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2004  DsrH family protein  95.7 
 
 
93 aa  183  8e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  3.77209e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2378  hypothetical protein  93.55 
 
 
93 aa  181  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2006  DsrH family protein  91.4 
 
 
93 aa  180  7e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.039715  hitchhiker  0.000293405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1970  DsrH family protein  91.4 
 
 
93 aa  180  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.81262e-05  normal  0.848273 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2057  DsrH family protein  91.4 
 
 
93 aa  178  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276019  hitchhiker  0.000313289 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1801  hypothetical protein  59.8 
 
 
102 aa  114  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.13849  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2108  DsrH family protein  59.14 
 
 
93 aa  111  4e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000187811  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2476  sulfur relay protein TusB/DsrH  54.84 
 
 
93 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  6.56489e-05  hitchhiker  9.66631e-05 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2017  DsrH like protein  49.46 
 
 
93 aa  94.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  9.31832e-08  hitchhiker  0.000744283 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1806  DsrH like protein  52.04 
 
 
98 aa  92.8  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000305366  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2133  DsrH family protein  60.87 
 
 
71 aa  89  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.04039  normal  0.0139279 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1779  hypothetical protein  43.3 
 
 
97 aa  83.2  1e-15  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.2752  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3922  sulfur transfer complex subunit TusB  40.62 
 
 
95 aa  55.8  2e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.20645e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3679  sulfur transfer complex subunit TusB  40.62 
 
 
95 aa  55.8  2e-07  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.4763e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0274  sulfur transfer complex subunit TusB  40.62 
 
 
95 aa  55.5  3e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000269868  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3399  sulfur relay protein TusB/DsrH  41.41 
 
 
98 aa  55.1  3e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.439562 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2189  sulfur relay protein TusB/DsrH  34.31 
 
 
100 aa  53.9  7e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.62558  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1333  intracellular sulfur oxidation protein DsrH  35.35 
 
 
102 aa  52.4  2e-06  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4011  sulfur relay protein TusB/DsrH  37.5 
 
 
95 aa  51.6  3e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000192762  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1950  DsrH protein  34.02 
 
 
97 aa  49.7  1e-05  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0315  sulfur relay protein TusB/DsrH  37.5 
 
 
95 aa  49.7  1e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000131562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3831  sulfur relay protein TusB/DsrH  37.5 
 
 
95 aa  49.3  2e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3340  DsrH family protein  39.58 
 
 
99 aa  48.5  3e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171608  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1838  DsrH family protein  39.18 
 
 
98 aa  48.5  3e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000194131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3995  hypothetical protein  39.18 
 
 
98 aa  48.5  3e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00527203 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3170  DsrH like protein  38.54 
 
 
99 aa  48.5  3e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225205  normal  0.258355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2379  DsrH family protein  36.46 
 
 
99 aa  48.1  4e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764227  normal  0.0193551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30380  hypothetical protein  34.38 
 
 
101 aa  47.8  6e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2315  sulfur relay protein TusB/DsrH  30.34 
 
 
97 aa  47.4  6e-05  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2601  hypothetical protein  34.38 
 
 
101 aa  47  8e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.691095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3577  DsrH like protein  36.36 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1816  DsrH family protein  41.79 
 
 
87 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000616385  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0701  sulfur relay protein TusB/DsrH  32.94 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0938457  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2481  DsrH protein  32.65 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1965  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1762  DsrH family protein  41.79 
 
 
87 aa  46.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.50068e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0370  sulfur relay protein TusB/DsrH  32.29 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.94824e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1706  DsrH family protein  31.76 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  5.13619e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0370  sulfur transfer complex subunit TusB  32.29 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.50284e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3624  sulfur transfer complex subunit TusB  32.29 
 
 
95 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  3.15434e-09  hitchhiker  0.000889218 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1923  hypothetical protein  30.53 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.597175  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1851  sulfur relay protein TusB/DsrH  31.31 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  5.63388e-05  normal  0.139435 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4552  sulfur transfer complex subunit TusB  33.33 
 
 
95 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.46848e-08  normal  0.147371 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03194  predicted intracellular sulfur oxidation protein  31.25 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.36461e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3812  sulfur transfer complex subunit TusB  31.25 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  2.71307e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03145  hypothetical protein  31.25 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  1.56644e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3717  sulfur transfer complex subunit TusB  31.25 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.4476e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4652  sulfur transfer complex subunit TusB  31.25 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  2.3417e-09  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3441  intracellular sulfur oxidation protein of DsrH family protein  30.61 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000121818  hitchhiker  0.000104159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3539  sulfur transfer complex subunit TusB  31.25 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.07691e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3760  sulfur transfer complex subunit TusB  29.17 
 
 
95 aa  41.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  8.01826e-07  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1521  hypothetical protein  30.77 
 
 
95 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389974  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0042  DsrH protein  26.8 
 
 
97 aa  41.2  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.932533  normal  0.75194 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3600  sulfur relay protein TusB/DsrH  38.54 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2454  DsrH family protein  30.84 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  3.10745e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0134  DsrH family protein  29.41 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00043522  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0397  sulfur relay protein TusB/DsrH  32.29 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  2.47543e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0491  sulfur transfer complex subunit TusB  32.14 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.870236  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0035  sulfur relay protein TusB/DsrH  28.24 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1657  DsrH family protein  31.31 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>