54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2166 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2166  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  331  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000514786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2216  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  331  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316699  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2218  FixH family protein  96.23 
 
 
159 aa  321  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.07723e-07  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4491  hypothetical protein  95.6 
 
 
159 aa  319  9e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2205  hypothetical protein  95.6 
 
 
159 aa  319  9e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  6.48455e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1955  hypothetical protein  91.82 
 
 
159 aa  310  7e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1965  hypothetical protein  82.39 
 
 
159 aa  280  7e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0441287  hitchhiker  0.00747997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2010  hypothetical protein  82.39 
 
 
159 aa  280  7e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.7151  hitchhiker  2.18476e-08 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2111  hypothetical protein  82.39 
 
 
159 aa  278  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125675  normal  0.439118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2360  hypothetical protein  79.87 
 
 
159 aa  275  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2014  hypothetical protein  66.67 
 
 
159 aa  231  2e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0149983  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1795  hypothetical protein  64.15 
 
 
159 aa  221  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.390885  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1847  hypothetical protein  62.5 
 
 
158 aa  211  3e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.227491  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2215  hypothetical protein  61.64 
 
 
159 aa  211  4e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2421  hypothetical protein  60.38 
 
 
159 aa  210  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.9522e-08  hitchhiker  5.97978e-05 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1989  hypothetical protein  61.01 
 
 
159 aa  209  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.667905  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2218  hypothetical protein  58.49 
 
 
159 aa  202  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0257547  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003471  hypothetical protein  46.94 
 
 
158 aa  131  4e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0601301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1567  hypothetical protein  43.71 
 
 
161 aa  130  8e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1049  hypothetical protein  43.45 
 
 
158 aa  125  2e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.146816  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02299  hypothetical protein  45.58 
 
 
158 aa  125  2e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2069  hypothetical protein  36.88 
 
 
169 aa  125  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.860685  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0935  hypothetical protein  39.6 
 
 
159 aa  123  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.742864 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1991  hypothetical protein  38.78 
 
 
164 aa  123  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0637  FixH family protein  36.24 
 
 
166 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0718  hypothetical protein  32.19 
 
 
173 aa  92.8  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.388417  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0638  hypothetical protein  35.92 
 
 
175 aa  91.7  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0105694  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1282  FixH family protein  31.85 
 
 
169 aa  87.8  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1789  hypothetical protein  30.32 
 
 
171 aa  84.7  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.200799  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02059  hypothetical protein  38.46 
 
 
136 aa  84.3  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0309564  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19960  cytochrome c oxidase accessory protein CcoH  31.71 
 
 
167 aa  82.4  2e-15  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2609  hypothetical protein  31.06 
 
 
172 aa  80.5  9e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411707  normal  0.558054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3825  hypothetical protein  29.3 
 
 
175 aa  72  3e-12  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4260  hypothetical protein  29.3 
 
 
176 aa  69.7  1e-11  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1608  hypothetical protein  29.3 
 
 
176 aa  69.7  2e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148481  normal  0.0232786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1997  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  67.4  7e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.591704  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3578  hypothetical protein  32.38 
 
 
175 aa  66.6  1e-10  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1876  hypothetical protein  31.03 
 
 
185 aa  65.5  3e-10  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1817  hypothetical protein  29.31 
 
 
179 aa  64.3  6e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3782  hypothetical protein  28.38 
 
 
179 aa  63.2  1e-09  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44430  hypothetical protein  28.81 
 
 
179 aa  60.8  6e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0337511  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3420  hypothetical protein  28.45 
 
 
178 aa  60.8  7e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.300528  normal  0.0548017 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2417  hypothetical protein  27.83 
 
 
190 aa  53.9  9e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1935  hypothetical protein  36.21 
 
 
95 aa  48.1  4e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.235684  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4300  hypothetical protein  40 
 
 
87 aa  47.4  7e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.486279  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2823  hypothetical protein  43.4 
 
 
98 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.010351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2351  hypothetical protein  20.69 
 
 
168 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000235101  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2036  hypothetical protein  40 
 
 
95 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1089  hypothetical protein  39.13 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1005  hypothetical protein  39.13 
 
 
92 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1528  hypothetical protein  30.38 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1165  hypothetical protein  40.38 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1749  hypothetical protein  33.82 
 
 
195 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173592 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1154  FixH family protein  25.74 
 
 
156 aa  40.4  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0322721 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>