More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2138 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2246  Glutamate--putrescine ligase  98.65 
 
 		 444 aa  906    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000577408 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2188  glutamate--putrescine ligase  99.1 
 
 		 447 aa  909    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000050762  unclonable  0.00000655518 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4519  hypothetical protein  98.42 
 
 		 444 aa  904    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2233  glutamate--ammonia ligase  98.42 
 
 		 444 aa  904    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000137712  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2138  glutamate--putrescine ligase  100 
 
 		 444 aa  918    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000330057  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  45.64 
 
 		 444 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  47.11 
 
 		 456 aa  432  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  45.64 
 
 		 444 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5549  glutamate--ammonia ligase  45.41 
 
 		 444 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4666  Glutamate--putrescine ligase  45.39 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0350  glutamate--ammonia ligase  44.84 
 
 		 455 aa  423  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0380504  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0942  L-glutamine synthetase  45.39 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  44.62 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0538  glutamate--putrescine ligase  47.62 
 
 		 446 aa  425  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0825  glutamate--ammonia ligase  45.29 
 
 		 456 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.951182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1901  L-glutamine synthetase  44.44 
 
 		 454 aa  418  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.643842  normal  0.247036 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4259  L-glutamine synthetase  48.96 
 
 		 447 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48860  putative glutamine synthetase  47.27 
 
 		 453 aa  418  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467779  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2079  L-glutamine synthetase  46.92 
 
 		 454 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34400  glutamine synthetase catalytic domain family protein  48.49 
 
 		 446 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1455  glutamate--putrescine ligase  48.96 
 
 		 440 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  46.94 
 
 		 452 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  46.94 
 
 		 452 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  46.28 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2864  glutamate--ammonia ligase  45.37 
 
 		 459 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.149371 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  46.74 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  46.28 
 
 		 476 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0342  L-glutamine synthetase  46.94 
 
 		 452 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  44.39 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0945  glutamate--putrescine ligase  45.93 
 
 		 449 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1774  hypothetical protein  48.38 
 
 		 447 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0728  glutamine synthetase catalytic domain  43.48 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3960  glutamate--putrescine ligase  48.49 
 
 		 440 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2022  glutamine synthetase family protein  43.71 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1946  glutamine synthetase family protein  44.01 
 
 		 444 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2079  glutamate--putrescine ligase  44.39 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1060  glutamate--putrescine ligase  46.83 
 
 		 449 aa  413  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0974728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1093  glutamate--ammonia ligase  45.5 
 
 		 451 aa  413  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440027  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0636  glutamine synthetase catalytic domain  43.71 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961715  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2201  glutamate--ammonia ligase  44.16 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1739  glutamate--putrescine ligase  44.09 
 
 		 454 aa  411  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000378796 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1921  glutamine synthetase  48.49 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5309  glutamine synthetase  45.12 
 
 		 452 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  45.12 
 
 		 452 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  43.94 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3098  L-glutamine synthetase  45.27 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000533566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  43.94 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0972  glutamate--ammonia ligase  45.48 
 
 		 449 aa  409  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2919  L-glutamine synthetase  45.27 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000934315  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3001  L-glutamine synthetase  45.27 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000079724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3740  glutamate--putrescine ligase  48.15 
 
 		 447 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120298  normal  0.581989 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  43.94 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  46.03 
 
 		 452 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  46.26 
 
 		 452 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2897  glutamate--putrescine ligase  46.49 
 
 		 452 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1107  glutamate--ammonia ligase  44.82 
 
 		 451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000899819  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1268  glutamine synthetase  44.82 
 
 		 451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1130  glutamate--putrescine ligase  46.38 
 
 		 449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2644  glutamate--ammonia ligase  45.72 
 
 		 451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2788  glutamine synthetase family protein  44.47 
 
 		 490 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289948  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  44.9 
 
 		 452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1165  glutamate--putrescine ligase  44.82 
 
 		 451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1198  glutamate--putrescine ligase  44.82 
 
 		 451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000128825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2711  glutamine synthetase catalytic domain  44.47 
 
 		 444 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1828  glutamine synthetase family protein  44.47 
 
 		 456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3193  Glutamate--putrescine ligase  44.82 
 
 		 451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0866318  normal  0.0139402 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1192  L-glutamine synthetase  47.05 
 
 		 455 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0656  glutamine synthetase family protein  44.24 
 
 		 456 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  43.25 
 
 		 445 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2006  Glutamate--putrescine ligase  43.94 
 
 		 449 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.349477  normal  0.804087 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2903  glutamate--putrescine ligase  44.6 
 
 		 445 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2355  glutamine synthetase family protein  44.24 
 
 		 444 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2930  glutamine synthetase family protein  44.24 
 
 		 444 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2654  glutamine synthetase  44.24 
 
 		 444 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1669  glutamine synthetase family protein  44.24 
 
 		 444 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3011  glutamate--ammonia ligase  45.05 
 
 		 451 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.858612  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  46.26 
 
 		 452 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0280  glutamate--putrescine ligase  45.58 
 
 		 452 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3492  glutamate--ammonia ligase  47.8 
 
 		 447 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.38104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1340  Glutamate--putrescine ligase  44.49 
 
 		 464 aa  398  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3041  glutamate--ammonia ligase  44.37 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5090  glutamate--putrescine ligase  45.35 
 
 		 452 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5183  glutamine synthetase, putative  45.12 
 
 		 452 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5243  glutamate--putrescine ligase  45.12 
 
 		 452 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6343  L-glutamine synthetase  44.37 
 
 		 445 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00463  glutamine synthetase  44.22 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3032  glutamate--ammonia ligase  44.14 
 
 		 451 aa  396  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519647  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2380  glutamate--ammonia ligase  44.14 
 
 		 445 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  44.62 
 
 		 475 aa  396  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0397  Glutamate--putrescine ligase  45.39 
 
 		 478 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2994  glutamate--ammonia ligase  44.14 
 
 		 445 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4399  glutamine synthetase, putative  49.03 
 
 		 413 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1939  glutamate--putrescine ligase  46.05 
 
 		 467 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0199472  normal  0.0178394 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3013  glutamate--putrescine ligase  43.68 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.404896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1297  glutamate--putrescine ligase  44.55 
 
 		 463 aa  393  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770979  normal  0.671991 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2988  glutamate--putrescine ligase  42.99 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2828  L-glutamine synthetase  45.35 
 
 		 468 aa  391  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0295  putative glutamine synthetase  44.42 
 
 		 475 aa  390  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1121  glutamate--ammonia ligase  44.14 
 
 		 448 aa  385  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20670  putative glutamine synthetase  48.18 
 
 		 413 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>