More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2127 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1926  acyl-CoA dehydrogenase  93.41 
 
 
759 aa  1461  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.442387  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0490  acyl-CoA dehydrogenase  47.4 
 
 
949 aa  709  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3822  acyl-CoA dehydrogenase  49.34 
 
 
815 aa  728  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1260  acyl-CoA dehydrogenase  47 
 
 
858 aa  701  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.276244  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1823  acyl-CoA dehydrogenase  51.53 
 
 
814 aa  767  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1340  acyl-CoA dehydrogenase  60.62 
 
 
760 aa  947  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.920071  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1917  acyl-CoA dehydrogenase  51.52 
 
 
815 aa  757  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00575597  normal  0.572589 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1863  acyl-CoA dehydrogenase  96.44 
 
 
759 aa  1494  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1791  acyl-CoA dehydrogenase  50.93 
 
 
815 aa  770  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000904865  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2342  acyl-CoA dehydrogenase  50.93 
 
 
815 aa  759  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607929  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2019  acyl-CoA dehydrogenase  50.93 
 
 
815 aa  771  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.9403e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0253  acyl-CoA dehydrogenase  51.25 
 
 
814 aa  777  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0249  acyl-CoA dehydrogenase  51.25 
 
 
814 aa  777  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03204  acyl-CoA dehydrogenase  52.01 
 
 
814 aa  776  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02638  acyl-CoA dehydrogenase  60.35 
 
 
761 aa  937  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1490  acyl-CoA dehydrogenase  46.75 
 
 
715 aa  684  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0174  acyl-CoA dehydrogenase  48.58 
 
 
756 aa  675  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.92795 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3171  acyl-CoA dehydrogenase  51.38 
 
 
815 aa  775  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2127  acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
759 aa  1568  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00720758  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0758  acyl-CoA dehydrogenase  51.41 
 
 
814 aa  764  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3003  acyl-CoA dehydrogenase  48.09 
 
 
744 aa  674  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00231993  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2154  acyl-CoA dehydrogenase  93.41 
 
 
759 aa  1461  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.136842  normal  0.840722 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3558  acyl-CoA dehydrogenase  46.29 
 
 
778 aa  681  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27730  acyl-CoA dehydrogenase  51.4 
 
 
815 aa  760  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0291961 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1889  acyl-CoA dehydrogenase  83.33 
 
 
758 aa  1300  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.314631  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1869  acyl-CoA dehydrogenase  51.05 
 
 
815 aa  778  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.203796  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2128  acyl-CoA dehydrogenase  46.08 
 
 
774 aa  675  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0257482  normal  0.562441 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2124  acyl-CoA dehydrogenase  53.64 
 
 
824 aa  823  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.441583 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2223  acyl-CoA dehydrogenase  50.46 
 
 
815 aa  768  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00555832  normal  0.222627 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2323  acyl-CoA dehydrogenase  50.72 
 
 
815 aa  769  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.78601e-05  normal  0.626171 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1815  acyl-CoA dehydrogenase  79.58 
 
 
759 aa  1291  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0595406  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2108  acyl-CoA dehydrogenase  50.93 
 
 
815 aa  766  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  6.35776e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2051  acyl-CoA dehydrogenase  79.29 
 
 
758 aa  1275  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.217248  normal  0.456304 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2306  acyl-CoA dehydrogenase  50.72 
 
 
815 aa  770  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.82172e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2244  acyl-CoA dehydrogenase  99.87 
 
 
759 aa  1567  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4530  acyl-CoA dehydrogenase  99.87 
 
 
759 aa  1567  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3810  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.67 
 
 
833 aa  699  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.753342  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3614  acyl-CoA dehydrogenase  46.01 
 
 
815 aa  658  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0152868  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1870  acyl-CoA dehydrogenase  50.66 
 
 
815 aa  757  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.114891  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1999  acyl-CoA dehydrogenase  49.54 
 
 
815 aa  750  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0412808  decreased coverage  6.39104e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2067  acyl-CoA dehydrogenase  82.93 
 
 
758 aa  1323  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0937287  decreased coverage  6.95411e-05 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2257  acyl-CoA dehydrogenase  99.6 
 
 
759 aa  1560  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00094782 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0805  acyl-CoA dehydrogenase  51.11 
 
 
829 aa  756  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0265  acyl-CoA dehydrogenase  51.25 
 
 
814 aa  775  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.717357  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2395  acyl-CoA dehydrogenase  50 
 
 
815 aa  762  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02616  acyl-CoA dehydrogenase  51.24 
 
 
749 aa  711  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02152  acyl-CoA dehydrogenase  50.8 
 
 
820 aa  791  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0314131  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0358  acyl-CoA dehydrogenase  50.85 
 
 
814 aa  770  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.7933 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3064  acyl-CoA dehydrogenase  48.92 
 
 
825 aa  702  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221782  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2319  acyl-CoA dehydrogenase  50.86 
 
 
815 aa  770  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000853883  hitchhiker  0.00160495 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15490  acyl-CoA dehydrogenase  49.8 
 
 
815 aa  680  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003765  acyl-CoA dehydrogenase short-chain specific  60.22 
 
 
760 aa  937  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.392288  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002777  acyl-CoA dehydrogenase short-chain specific  51.45 
 
 
814 aa  775  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.383126  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3444  acyl-CoA dehydrogenase  50.73 
 
 
815 aa  779  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3297  acyl-CoA dehydrogenase  51.39 
 
 
815 aa  789  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0890  acyl-CoA dehydrogenase  52.72 
 
 
814 aa  776  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00220  hypothetical protein  51.25 
 
 
814 aa  775  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0923  acyl-CoA dehydrogenase  50.48 
 
 
812 aa  752  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0432  acyl-CoA dehydrogenase  51.04 
 
 
836 aa  771  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01663  acyl-CoA dehydrogenase  49.19 
 
 
803 aa  715  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0967153  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0417  acyl-CoA dehydrogenase  51.04 
 
 
836 aa  775  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332729  hitchhiker  0.000590412 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1468  acyl-CoA dehydrogenase  50.33 
 
 
815 aa  742  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.890646  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0687  acyl-CoA dehydrogenase  46.61 
 
 
715 aa  678  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2172  acyl-CoA dehydrogenase  99.87 
 
 
759 aa  1568  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.272343  normal  0.175191 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2067  acyl-CoA dehydrogenase  50.8 
 
 
815 aa  770  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000576989  hitchhiker  0.00617019 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2393  acyl-CoA dehydrogenase  51.18 
 
 
815 aa  771  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2338  acyl-CoA dehydrogenase  81.45 
 
 
760 aa  1275  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.797755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1234  acyl-CoA dehydrogenase  49.38 
 
 
745 aa  696  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0949  acyl-CoA dehydrogenase  52.69 
 
 
818 aa  789  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3309  acyl-CoA dehydrogenase  52.09 
 
 
815 aa  773  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3399  acyl-CoA dehydrogenase  51.25 
 
 
814 aa  776  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1676  acyl-CoA dehydrogenase  49.87 
 
 
832 aa  769  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761188  normal  0.240314 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0217  acyl-CoA dehydrogenase  51.25 
 
 
814 aa  776  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1700  acyl-CoA dehydrogenase  50 
 
 
889 aa  752  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.169091  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2604  acyl-CoA dehydrogenase  50.79 
 
 
815 aa  759  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.114401  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2542  acyl-CoA dehydrogenase  82.19 
 
 
758 aa  1332  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.204346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1504  acyl-CoA dehydrogenase  47.41 
 
 
745 aa  666  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.135782  normal  0.786071 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1503  acyl-CoA dehydrogenase  50.33 
 
 
815 aa  741  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.943527  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0233  acyl-CoA dehydrogenase  51.25 
 
 
814 aa  776  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373411  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1705  Protein of unknown function DUF1974  45.85 
 
 
834 aa  647  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2146  acyl-CoA dehydrogenase  50.86 
 
 
815 aa  771  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000466188  normal  0.548318 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2049  acyl-CoA dehydrogenase  93.54 
 
 
759 aa  1464  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156017  normal  0.197509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4184  acyl-CoA dehydrogenase  50.41 
 
 
815 aa  746  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3857  acyl-CoA dehydrogenase family protein  49.14 
 
 
815 aa  750  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.870588  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2536  acyl-CoA dehydrogenase  50.72 
 
 
815 aa  767  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2265  acyl-CoA dehydrogenase  50.33 
 
 
809 aa  780  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.105955  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2774  acyl-CoA dehydrogenase  50.39 
 
 
832 aa  774  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0195981  normal  0.587506 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1764  acyl-CoA dehydrogenase  50.2 
 
 
815 aa  768  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.69157e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2115  acyl-CoA dehydrogenase  82.53 
 
 
758 aa  1292  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000818712  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2492  acyl-CoA dehydrogenase  93.54 
 
 
759 aa  1464  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1510  acyl-CoA dehydrogenase  46.74 
 
 
815 aa  657  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0094  acyl-CoA dehydrogenase  51 
 
 
779 aa  765  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0537  acyl-CoA dehydrogenase  51.34 
 
 
835 aa  753  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0153828  normal  0.335632 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1085  acyl-CoA dehydrogenase  47.83 
 
 
756 aa  700  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1735  acyl-CoA dehydrogenase  48.92 
 
 
781 aa  742  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.445191  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1688  acyl-CoA dehydrogenase  49.03 
 
 
751 aa  681  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132368  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1690  acyl-CoA dehydrogenase  48.22 
 
 
828 aa  726  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1628  acyl-CoA dehydrogenase  49.54 
 
 
815 aa  756  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1835  acyl-CoA dehydrogenase  47.23 
 
 
994 aa  719  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1544  acyl-CoA dehydrogenase  50.99 
 
 
784 aa  803  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0853542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>