27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2089 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2136  hypothetical protein  95.54 
 
 
538 aa  1050  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2089  hypothetical protein  100 
 
 
528 aa  1091  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00551419  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0667  hypothetical protein  89.87 
 
 
533 aa  993  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1641  hypothetical protein  44.89 
 
 
523 aa  417  1e-115  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2248  hypothetical protein  38.51 
 
 
584 aa  340  3e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0729  protein of unknown function DUF935  39.84 
 
 
552 aa  313  4e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1877  hypothetical protein  29.24 
 
 
582 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3047  hypothetical protein  30.93 
 
 
517 aa  231  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88762  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3006  hypothetical protein  31.97 
 
 
517 aa  219  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3393  protein of unknown function DUF935  31.31 
 
 
543 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219922  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1912  protein of unknown function DUF935  32.52 
 
 
511 aa  203  8e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0671  protein of unknown function DUF935  29.72 
 
 
530 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1299  hypothetical protein  31.91 
 
 
543 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2101  hypothetical protein  31.91 
 
 
543 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0242078  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4502  hypothetical protein  35.73 
 
 
544 aa  192  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1968  hypothetical protein  29.9 
 
 
523 aa  187  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0763  hypothetical protein  29.35 
 
 
519 aa  172  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0674  hypothetical protein  29.35 
 
 
519 aa  172  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2680  hypothetical protein  26.52 
 
 
521 aa  159  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0433  protein of unknown function DUF935  26.17 
 
 
510 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3783  hypothetical protein  29.37 
 
 
537 aa  121  4e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1284  protein of unknown function DUF935  29.5 
 
 
524 aa  113  1e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02991e-32 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3373  hypothetical protein  23.9 
 
 
523 aa  82  2e-14  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2932  hypothetical protein  25.32 
 
 
496 aa  68.2  3e-10  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163033  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3417  Mu-like protein prophage protein gp29-like protein  20.97 
 
 
545 aa  61.2  5e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.610061  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1002  Mu-like prophage protein  24.91 
 
 
505 aa  59.3  2e-07  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291607 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0250  hypothetical protein  25.5 
 
 
456 aa  46.2  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>