More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2060 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2278  electron transport complex RsxE subunit  100 
 
 
232 aa  460  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316323  normal  0.959617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2060  electron transport complex RsxE subunit  100 
 
 
232 aa  460  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.14893e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2107  electron transport complex RsxE subunit  100 
 
 
232 aa  460  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257161  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4550  electron transport complex RsxE subunit  99.57 
 
 
232 aa  459  1e-128  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2264  electron transport complex RsxE subunit  99.57 
 
 
232 aa  459  1e-128  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  4.42718e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1845  electron transport complex RsxE subunit  96.97 
 
 
232 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  5.6167e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2173  electron transport complex RsxE subunit  95.24 
 
 
232 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.303807  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2069  electron transport complex RsxE subunit  94.81 
 
 
232 aa  440  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00102029  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1906  electron transport complex RsxE subunit  94.81 
 
 
232 aa  440  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2513  electron transport complex RsxE subunit  89.61 
 
 
232 aa  424  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2071  electron transport complex RsxE subunit  83.98 
 
 
232 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1835  electron transport complex RsxE subunit  82.76 
 
 
232 aa  387  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.521191  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2358  electron transport complex RsxE subunit  84.85 
 
 
231 aa  387  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2177  electron transport complex RsxE subunit  83.55 
 
 
231 aa  378  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.206237  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1868  electron transport complex RsxE subunit  81.82 
 
 
231 aa  377  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2039  electron transport complex RsxE subunit  80.52 
 
 
236 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2561  electron transport complex RsxE subunit  79.22 
 
 
232 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.428281  normal  0.0236645 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002944  electron transport complex protein RnfE  70.43 
 
 
230 aa  326  2e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0179212  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1867  electron transport complex RsxE subunit  70.31 
 
 
228 aa  325  4e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02969  electron transport complex RsxE subunit  69.57 
 
 
230 aa  323  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0533  electron transport complex RsxE subunit  69.26 
 
 
230 aa  323  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.6694e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2194  electron transport complex RsxE subunit  69.16 
 
 
263 aa  315  4e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0733  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  70.81 
 
 
230 aa  310  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22975  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2970  electron transport complex RsxE subunit  67.25 
 
 
232 aa  310  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02734  NADH-ubiquinone oxidoreductase  68.12 
 
 
230 aa  305  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2020  electron transport complex RsxE subunit  68.04 
 
 
235 aa  299  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2159  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  65.02 
 
 
230 aa  291  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2320  electron transport complex RsxE subunit  67.92 
 
 
235 aa  287  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2012  electron transport complex RsxE subunit  66.82 
 
 
233 aa  285  6e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00017811  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1900  electron transport complex RsxE subunit  66.82 
 
 
233 aa  284  9e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000164726  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2248  electron transport complex RsxE subunit  66.82 
 
 
233 aa  284  9e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  8.87941e-05  normal  0.482499 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2235  electron transport complex RsxE subunit  62.34 
 
 
232 aa  283  1e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  3.36445e-06 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1921  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  66.19 
 
 
231 aa  275  4e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1816  electron transport complex RsxE subunit  63.11 
 
 
228 aa  266  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0219521  decreased coverage  0.000344211 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1795  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  60.71 
 
 
230 aa  265  4e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.680327  hitchhiker  0.000244527 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1064  electron transport complex RsxE subunit  64 
 
 
218 aa  265  5e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0737938  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1564  electron transport complex RsxE subunit  62.84 
 
 
230 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.257712  normal  0.0772811 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1567  electron transport complex RsxE subunit  61.36 
 
 
231 aa  264  8e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.276457  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1720  electron transport complex RsxE subunit  62.84 
 
 
230 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208116  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1821  electron transport complex RsxE subunit  61.36 
 
 
231 aa  263  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8848  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2344  electron transport complex RsxE subunit  61.36 
 
 
231 aa  263  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00490465  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1552  electron transport complex RsxE subunit  62.84 
 
 
230 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1624  electron transport complex RsxE subunit  62.84 
 
 
230 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  normal  0.350823 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1841  electron transport complex RsxE subunit  61.36 
 
 
231 aa  263  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.17086e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2631  electron transport complex RsxE subunit  60.73 
 
 
228 aa  262  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.854749  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1888  electron transport complex RsxE subunit  62.39 
 
 
230 aa  261  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.184564  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1031  electron transport complex RsxE subunit  59.03 
 
 
243 aa  258  6e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  5.59383e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1540  electron transport complex RsxE subunit  57.39 
 
 
255 aa  257  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.174651 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01602  NADH-ubiquinone oxidoreductase  61.79 
 
 
231 aa  253  2e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00455055  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01592  hypothetical protein  61.79 
 
 
231 aa  253  2e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00529631  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1708  electron transport complex RsxE subunit  61.79 
 
 
231 aa  253  2e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0245386  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2009  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  61.79 
 
 
231 aa  253  2e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206921  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1997  electron transport complex RsxE subunit  61.79 
 
 
231 aa  253  2e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0507177  normal  0.141925 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0933  electron transport complex RsxE subunit  56.83 
 
 
238 aa  248  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18890  electron transport complex RsxE subunit  59.31 
 
 
238 aa  248  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0559311  normal  0.0454317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19220  electron transport complex RsxE subunit  57.94 
 
 
237 aa  247  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1170  electron transport complex RsxE subunit  62.16 
 
 
236 aa  245  5e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1399  electron transport complex RsxE subunit  60.58 
 
 
235 aa  243  1e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2898  electron transport complex RsxE subunit  56.42 
 
 
233 aa  241  6e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.594329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2405  electron transport complex RsxE subunit  55.79 
 
 
236 aa  234  6e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.561649  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2020  electron transport complex RsxE subunit  55.87 
 
 
225 aa  228  5e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.644587  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3237  electron transport complex RsxE subunit  51.04 
 
 
239 aa  226  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.205198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1635  electron transport complex RsxE subunit  59.31 
 
 
239 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1782  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  54.38 
 
 
231 aa  222  4e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2819  electron transport complex RsxE subunit  53.18 
 
 
228 aa  221  1e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0723  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  58.54 
 
 
214 aa  218  5e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12428  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0811  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  59.13 
 
 
228 aa  216  3e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.586167  normal  0.660499 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0288  electron transport complex RsxE subunit  53.7 
 
 
231 aa  214  7e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3197  electron transport complex RsxE subunit  52.91 
 
 
244 aa  214  1e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.113387  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3197  electron transport complex RsxE subunit  50 
 
 
244 aa  213  2e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.0099576  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3936  electron transport complex RsxE subunit  50 
 
 
244 aa  213  2e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000255424  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50930  Electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  49.55 
 
 
238 aa  201  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1158  electron transport complex RsxE subunit  46.73 
 
 
230 aa  201  1e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1490  electron transport complex RsxE subunit  47.66 
 
 
224 aa  200  2e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0685  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  46.12 
 
 
222 aa  198  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.360116  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0082  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  46.98 
 
 
216 aa  191  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0420224  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0677  electron transport complex RsxE subunit  46.01 
 
 
200 aa  187  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0701  electron transport complex RsxE subunit  46.01 
 
 
200 aa  187  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.647588  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0307  electron transport complex RsxE subunit  48.8 
 
 
196 aa  184  8e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0260  electron transport complex RsxE subunit  50.24 
 
 
202 aa  184  9e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1158  electron transport complex RsxE subunit  50 
 
 
200 aa  182  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.252127 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0519  electron transport complex RsxE subunit  48.34 
 
 
223 aa  182  5e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1241  electron transport complex RsxE subunit  47.62 
 
 
225 aa  181  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2994  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  45.54 
 
 
226 aa  181  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0345  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  47.06 
 
 
239 aa  181  9e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1084  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  46.45 
 
 
205 aa  181  9e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0652551 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0497  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  47.39 
 
 
206 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.69706e-05  hitchhiker  0.000180019 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1957  electron transport complex RsxE subunit  48.78 
 
 
239 aa  178  5e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.875572  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0390  electron transport complex RsxE subunit  45.5 
 
 
217 aa  179  5e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1319  electron transport complex RsxE subunit  44.02 
 
 
222 aa  178  6e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.175799  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2827  electron transport complex RsxE subunit  47.26 
 
 
200 aa  178  6e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1574  electron transport complex RsxE subunit  49.05 
 
 
204 aa  178  7e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0333623  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0584  electron transport complex RsxE subunit  45.02 
 
 
224 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0214  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  44.65 
 
 
253 aa  176  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  1.78696e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0696  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  46.48 
 
 
235 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.682533  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1532  electron transport complex RsxE subunit  46.73 
 
 
201 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0221423  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1313  electron transport complex RsxE subunit  46.01 
 
 
200 aa  173  2e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.860019  normal  0.240269 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0548  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  42.86 
 
 
219 aa  172  4e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  7.61425e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0985  electron transport complex RsxE subunit  48.8 
 
 
201 aa  172  5e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2433  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  43.19 
 
 
218 aa  172  6e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  1.09684e-09  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>