More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2059 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2059  endonuclease III  100 
 
 
213 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  4.03968e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2265  endonuclease III  99.53 
 
 
213 aa  439  1e-122  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  6.35696e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2106  endonuclease III  99.53 
 
 
213 aa  439  1e-122  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0792284  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4551  hypothetical protein  99.53 
 
 
213 aa  439  1e-122  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2279  endonuclease III  99.06 
 
 
213 aa  437  1e-122  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0342815  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1905  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  96.24 
 
 
213 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2070  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  95.77 
 
 
213 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.027671  normal  0.855553 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1844  endonuclease III  95.31 
 
 
213 aa  425  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  3.1535e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2514  endonuclease III  94.26 
 
 
231 aa  415  1e-115  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2174  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  95.61 
 
 
211 aa  413  1e-115  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660077  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2038  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  89.15 
 
 
212 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2562  endonuclease III  89.62 
 
 
212 aa  401  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2178  endonuclease III  88.73 
 
 
213 aa  398  1e-110  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.468625  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  87.32 
 
 
213 aa  393  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  85.45 
 
 
213 aa  391  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1869  endonuclease III  89.9 
 
 
210 aa  393  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2072  endonuclease III  86.85 
 
 
213 aa  387  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  80.66 
 
 
213 aa  364  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1901  endonuclease III  79.72 
 
 
213 aa  362  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.83349e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  80.66 
 
 
213 aa  362  2e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.13835e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2013  endonuclease III  79.72 
 
 
213 aa  362  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000346358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2247  endonuclease III  79.72 
 
 
213 aa  362  2e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  6.50328e-05  normal  0.36112 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  79.43 
 
 
211 aa  358  4e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  9.60215e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  79.43 
 
 
211 aa  358  4e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  79.43 
 
 
211 aa  358  4e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  79.43 
 
 
211 aa  358  4e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  79.43 
 
 
211 aa  358  4e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  79.43 
 
 
211 aa  358  4e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  79.43 
 
 
211 aa  358  4e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  79.43 
 
 
211 aa  358  4e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2345  endonuclease III  78.95 
 
 
211 aa  356  2e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0106344  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2234  endonuclease III  77.83 
 
 
213 aa  355  3e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  2.19145e-05 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1623  endonuclease III  78.47 
 
 
211 aa  354  6e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal  0.347988 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1551  endonuclease III  78.47 
 
 
211 aa  354  6e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1721  endonuclease III  78.47 
 
 
211 aa  354  6e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  78.47 
 
 
211 aa  354  6e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  78.95 
 
 
211 aa  353  7e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1815  endonuclease III  78.1 
 
 
211 aa  353  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  decreased coverage  0.000297282 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1563  endonuclease III  77.99 
 
 
211 aa  352  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2971  endonuclease III  77.03 
 
 
210 aa  351  4e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1889  endonuclease III  77.51 
 
 
211 aa  351  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  78.85 
 
 
211 aa  350  9e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02970  endonuclease III  79.02 
 
 
217 aa  347  7e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2160  endonuclease III  76.44 
 
 
211 aa  346  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1922  endonuclease III  74.29 
 
 
211 aa  342  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0732  endonuclease III  76.44 
 
 
211 aa  336  2e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1866  endonuclease III  75 
 
 
211 aa  333  1e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  74.52 
 
 
212 aa  333  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  72.12 
 
 
212 aa  325  2e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  71.56 
 
 
225 aa  321  4e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  72.6 
 
 
212 aa  320  8e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2193  endonuclease III  69.72 
 
 
220 aa  320  1e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2122  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  70.19 
 
 
212 aa  319  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134945  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1539  endonuclease III  73.08 
 
 
211 aa  318  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  69.71 
 
 
212 aa  315  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  69.71 
 
 
212 aa  316  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  70.67 
 
 
212 aa  315  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  69.71 
 
 
210 aa  313  1e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.73588e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  69.81 
 
 
230 aa  312  3e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  69.23 
 
 
335 aa  311  4e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  67.77 
 
 
211 aa  311  6e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  69.23 
 
 
212 aa  311  6e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  69.71 
 
 
212 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  68.75 
 
 
212 aa  309  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  67.79 
 
 
212 aa  307  1e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19210  endonuclease III/Nth  67.79 
 
 
212 aa  306  2e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  65.88 
 
 
215 aa  297  6e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  66.35 
 
 
211 aa  294  5e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  65.87 
 
 
211 aa  294  7e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0871  endonuclease III  66.83 
 
 
214 aa  293  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  66.35 
 
 
215 aa  293  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2021  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  64.45 
 
 
229 aa  293  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0936  endonuclease III  66.35 
 
 
214 aa  292  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0591838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1005  endonuclease III protein  66.35 
 
 
214 aa  292  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248668  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  66.67 
 
 
210 aa  291  5e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3311  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  66.83 
 
 
214 aa  291  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  66.82 
 
 
214 aa  290  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1235  endonuclease III  65.26 
 
 
214 aa  290  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  63.98 
 
 
236 aa  290  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  66.82 
 
 
214 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  66.35 
 
 
214 aa  289  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  66.82 
 
 
214 aa  288  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  65.88 
 
 
214 aa  288  5e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  65.4 
 
 
219 aa  288  6e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  65.4 
 
 
219 aa  288  6e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  65.88 
 
 
214 aa  287  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  65.88 
 
 
214 aa  287  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0724  endonuclease III  64.42 
 
 
213 aa  287  9e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155914  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  65.87 
 
 
214 aa  286  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  64.9 
 
 
213 aa  286  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  64.79 
 
 
214 aa  286  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  68.75 
 
 
214 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  62.5 
 
 
219 aa  284  6e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0463  endonuclease III  62.98 
 
 
226 aa  283  1e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0687351  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  66.35 
 
 
214 aa  283  2e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  66.35 
 
 
214 aa  283  2e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  66.35 
 
 
214 aa  283  2e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  66.35 
 
 
214 aa  283  2e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  66.35 
 
 
214 aa  283  2e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  66.35 
 
 
214 aa  283  2e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>