196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2040 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  79.66 
 
 		 415 aa  646    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  81.34 
 
 		 424 aa  672    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  87.71 
 
 		 423 aa  740    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  99.76 
 
 		 423 aa  836    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  87.47 
 
 		 423 aa  738    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  79.67 
 
 		 421 aa  664    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  88.89 
 
 		 423 aa  743    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  99.76 
 
 		 423 aa  836    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  99.76 
 
 		 423 aa  836    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  99.76 
 
 		 423 aa  836    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  80.48 
 
 		 421 aa  640    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 423 aa  836    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  73.04 
 
 		 415 aa  588  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  74.06 
 
 		 415 aa  587  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  67.31 
 
 		 431 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  66.83 
 
 		 431 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  66.83 
 
 		 431 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  63.72 
 
 		 435 aa  531  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  62.68 
 
 		 424 aa  521  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  64.52 
 
 		 436 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  67.99 
 
 		 407 aa  521  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  66.91 
 
 		 428 aa  521  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  62.65 
 
 		 420 aa  498  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  63.02 
 
 		 435 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  61.56 
 
 		 410 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  57.63 
 
 		 435 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  59.24 
 
 		 389 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  55.4 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  52.97 
 
 		 428 aa  432  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  52.36 
 
 		 425 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  54.79 
 
 		 437 aa  420  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  51.71 
 
 		 403 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  53.77 
 
 		 413 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  50.48 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  53.28 
 
 		 436 aa  385  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  51.8 
 
 		 412 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  49.28 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  50.49 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  45.27 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  41.75 
 
 		 471 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  41.87 
 
 		 468 aa  340  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  45.95 
 
 		 412 aa  335  9e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  46.08 
 
 		 428 aa  329  7e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  46.38 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  40.43 
 
 		 432 aa  315  7e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  43.18 
 
 		 413 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  45.84 
 
 		 429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  42.17 
 
 		 417 aa  301  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  39.96 
 
 		 458 aa  298  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  48.24 
 
 		 431 aa  296  3e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  39.22 
 
 		 417 aa  290  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  39.56 
 
 		 417 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  40 
 
 		 431 aa  282  9e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  41.55 
 
 		 439 aa  282  1e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  44.5 
 
 		 408 aa  281  1e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  44.2 
 
 		 408 aa  281  2e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  35.85 
 
 		 409 aa  267  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  48.86 
 
 		 485 aa  263  6e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  39.13 
 
 		 431 aa  263  6e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  33.8 
 
 		 417 aa  241  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  33.96 
 
 		 425 aa  241  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  34.19 
 
 		 414 aa  239  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  34.1 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  34.1 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  34.1 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  34.1 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  34.1 
 
 		 438 aa  237  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  33.87 
 
 		 438 aa  236  7e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  33.1 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  33.1 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  33.1 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  33.1 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  33.1 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  33.74 
 
 		 425 aa  233  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  34.73 
 
 		 457 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  36.87 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  36.92 
 
 		 426 aa  226  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  33.57 
 
 		 434 aa  226  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  33.91 
 
 		 411 aa  221  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  33.25 
 
 		 457 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  31.67 
 
 		 412 aa  219  7e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  33 
 
 		 457 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  33 
 
 		 457 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  33.98 
 
 		 406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  32.84 
 
 		 413 aa  216  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  35.07 
 
 		 419 aa  216  9e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  30.43 
 
 		 420 aa  213  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  30.96 
 
 		 443 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  32.84 
 
 		 399 aa  210  4e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  33.49 
 
 		 433 aa  207  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  31.53 
 
 		 434 aa  202  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  33.49 
 
 		 429 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  30.38 
 
 		 418 aa  199  9e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  31.8 
 
 		 440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  35 
 
 		 438 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  31.59 
 
 		 468 aa  196  5.000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1420  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 467 aa  196  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  35.22 
 
 		 437 aa  196  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  30.14 
 
 		 418 aa  196  7e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4565  major facilitator transporter  32.83 
 
 		 488 aa  196  8.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>