50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1981 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1981  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  891    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51853  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3724  hypothetical protein  45.5 
 
 		 418 aa  352  7e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4619  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  45.04 
 
 		 436 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000187053  hitchhiker  0.0000000628519 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1654  hypothetical protein  45.72 
 
 		 424 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1862  hypothetical protein  42.86 
 
 		 431 aa  340  4e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7439  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  42.27 
 
 		 445 aa  323  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2911  hypothetical protein  42.45 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4726  hypothetical protein  39.95 
 
 		 422 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2661  hypothetical protein  38.35 
 
 		 429 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3330  hypothetical protein  37.59 
 
 		 428 aa  262  8e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3669  putative 5-methylcytosine restriction system component  36.75 
 
 		 436 aa  247  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2471  5-methylcytosine restriction system component- like protein  33.17 
 
 		 428 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.248512 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1240  hypothetical protein  31.89 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0689849  hitchhiker  0.000177876 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3671  hypothetical protein  43.31 
 
 		 273 aa  196  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0003  hypothetical protein  31.04 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00559809  unclonable  0.0000000111615 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0135  hypothetical protein  30.28 
 
 		 443 aa  146  6e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0584774  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4531  hypothetical protein  35.77 
 
 		 267 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.814257  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0154  hypothetical protein  30 
 
 		 445 aa  141  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3309  IQ calmodulin-binding- domain protein  31.72 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1591  hypothetical protein  27.45 
 
 		 429 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0176  hypothetical protein  31.62 
 
 		 288 aa  121  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0993  hypothetical protein  28.79 
 
 		 437 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.235646  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3470  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  28.7 
 
 		 423 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00801853  normal  0.511219 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1011  5-methylcytosine restriction system component-like protein  26.3 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000144218  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0806  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  24.39 
 
 		 383 aa  86.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0894928  hitchhiker  0.000053751 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0350  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  39.2 
 
 		 687 aa  83.2  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0026  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  29.52 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.579056  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3270  hypothetical protein  22.75 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0179938  normal  0.335413 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0863  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  23.02 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1299  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  23.81 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000217939  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6960  hypothetical protein  27.11 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00920086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1703  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  23.84 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1386  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  24.04 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05460  McrBC 5-methylcytosine restriction system component  28 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2402  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  24.72 
 
 		 431 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0976  hypothetical protein  23.48 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0362174 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0253  hypothetical protein  20.5 
 
 		 498 aa  54.7  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.13037  normal  0.68079 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3197  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  24.11 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0398257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3582  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  23.53 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7821  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  27.69 
 
 		 406 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3300  5-methylcytosine restriction system component- like protein  23.11 
 
 		 398 aa  50.1  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0437  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  36.76 
 
 		 164 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  hitchhiker  0.00000000000258291 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4768  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  25.67 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.393001 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2839  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  23.53 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2030  hypothetical protein  23.28 
 
 		 542 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04175  hypothetical protein  24.41 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0952  hypothetical protein  22.95 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0227  hypothetical protein  24.5 
 
 		 514 aa  45.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0395217  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04211  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrC  24.41 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3652  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  24.25 
 
 		 348 aa  44.3  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>