More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1943 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  78.19 
 
 
467 aa  759  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  77.75 
 
 
467 aa  754  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  100 
 
 
470 aa  977  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.10873e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  97.87 
 
 
470 aa  959  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  4.19879e-05  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  78.19 
 
 
467 aa  755  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  3.19402e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  83.48 
 
 
466 aa  828  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  79.27 
 
 
467 aa  773  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  97.45 
 
 
470 aa  952  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  97.66 
 
 
470 aa  953  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  8.33376e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  63.23 
 
 
469 aa  609  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2226  para-aminobenzoate synthase, subunit I  63.66 
 
 
467 aa  603  1e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  hitchhiker  0.0081347 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1903  para-aminobenzoate synthase, subunit I  63.58 
 
 
477 aa  590  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.757454  hitchhiker  0.000298864 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2157  para-aminobenzoate synthase, subunit I  61.95 
 
 
473 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169831  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  59.42 
 
 
490 aa  579  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1913  para-aminobenzoate synthase, component I  58.07 
 
 
509 aa  572  1e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199301  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  62.07 
 
 
471 aa  569  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  57.88 
 
 
458 aa  503  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  55.83 
 
 
453 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  57.79 
 
 
457 aa  494  1e-138  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0559129 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  57.01 
 
 
452 aa  493  1e-138  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  57.3 
 
 
458 aa  488  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  57.53 
 
 
458 aa  490  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  57.3 
 
 
458 aa  488  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1902  para-aminobenzoate synthase component I  55.01 
 
 
453 aa  485  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  55.28 
 
 
480 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1376  aminodeoxychorismate synthase  55.68 
 
 
453 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.661176  normal  0.079748 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01782  para-aminobenzoate synthase component I  55.01 
 
 
453 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2073  aminodeoxychorismate synthase  55.01 
 
 
453 aa  486  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1821  para-aminobenzoate synthase, subunit I  54.87 
 
 
453 aa  485  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  55.01 
 
 
453 aa  486  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1831  para-aminobenzoate synthase, subunit I  54.87 
 
 
453 aa  485  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306293  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2381  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  57.4 
 
 
455 aa  488  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  57.31 
 
 
454 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  55.96 
 
 
456 aa  483  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1492  aminodeoxychorismate synthase subunit I  56.84 
 
 
454 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2541  aminodeoxychorismate synthase  54.79 
 
 
453 aa  483  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.169515  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  56.84 
 
 
454 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  56.61 
 
 
454 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01770  hypothetical protein  54.93 
 
 
445 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.994837  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01914  para-aminobenzoate synthase, component I  55.93 
 
 
456 aa  478  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  54.03 
 
 
456 aa  477  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2225  para-aminobenzoate synthase, subunit I  55.33 
 
 
476 aa  477  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  56.61 
 
 
454 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3614  para-aminobenzoate synthase component I  54.08 
 
 
497 aa  471  1e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1627  para-aminobenzoate synthase, subunit I  53.06 
 
 
458 aa  468  1e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.18817  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1978  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.9 
 
 
474 aa  449  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.306568  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  49.12 
 
 
460 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  48.37 
 
 
471 aa  416  1e-115  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  49.24 
 
 
468 aa  417  1e-115  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0453  para-aminobenzoate synthase, component I  48.21 
 
 
452 aa  409  1e-113  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0249447  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01948  P-aminobenzoate synthetase, component I  46.46 
 
 
476 aa  403  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0024318  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  45.53 
 
 
447 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  47.16 
 
 
447 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  45.51 
 
 
447 aa  392  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.82 
 
 
450 aa  388  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.22 
 
 
447 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  7.83335e-07 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.31 
 
 
446 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.09 
 
 
446 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  5.3464e-05 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.97 
 
 
447 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  2.36319e-11 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2208  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.87 
 
 
461 aa  376  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0392675  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  51.39 
 
 
408 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  45.11 
 
 
453 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2424  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  47.37 
 
 
448 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.95872  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2967  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.6 
 
 
474 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0339276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.71 
 
 
466 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.78 
 
 
480 aa  355  7e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  1.12385e-08 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  43.78 
 
 
462 aa  355  8e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23160  para-aminobenzoate synthase, component I  43.18 
 
 
443 aa  354  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  42.76 
 
 
430 aa  354  2e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  42.76 
 
 
430 aa  354  2e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.84 
 
 
466 aa  334  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.61 
 
 
480 aa  325  8e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  36.95 
 
 
495 aa  321  2e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2398  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.47 
 
 
457 aa  311  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1514  hypothetical protein  37.86 
 
 
440 aa  311  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1469  hypothetical protein  37.42 
 
 
440 aa  308  1e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.13 
 
 
469 aa  307  2e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.21 
 
 
474 aa  304  2e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1094  para-aminobenzoate synthase, component I  37.44 
 
 
448 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0293848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1272  para-aminobenzoate synthase, component I  37.44 
 
 
448 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  38.99 
 
 
466 aa  297  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1671  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  35.9 
 
 
444 aa  293  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1580  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.17 
 
 
449 aa  292  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00938463  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.69 
 
 
509 aa  291  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1334  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  38.84 
 
 
465 aa  288  1e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.27 
 
 
721 aa  286  7e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.05 
 
 
464 aa  280  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0076  para-aminobenzoate synthase, component I  37.64 
 
 
465 aa  279  9e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0064  para-aminobenzoate synthase component I  36.95 
 
 
465 aa  277  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0068  para-aminobenzoate synthase component I  36.95 
 
 
465 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0064  para-aminobenzoate synthase component I  36.95 
 
 
465 aa  277  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0068  para-aminobenzoate synthase component I  36.95 
 
 
465 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5240  para-aminobenzoate synthase, component I  36.49 
 
 
465 aa  277  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0080  para-aminobenzoate synthase, component I  36.49 
 
 
465 aa  276  7e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0067  para-aminobenzoate synthase component I  36.84 
 
 
480 aa  275  1e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0077  para-aminobenzoate synthase, component I  36.24 
 
 
465 aa  275  1e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000409192 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0064  anthranilate synthase  36.53 
 
 
465 aa  274  2e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1731  anthranilate synthase component I  34.53 
 
 
491 aa  275  2e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4379  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.36 
 
 
472 aa  274  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3907  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.35 
 
 
472 aa  273  7e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177197  normal  0.165975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>