174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1922 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  88.76 
 
 
498 aa  932  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  99.82 
 
 
542 aa  1118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  87.68 
 
 
544 aa  984  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  71.02 
 
 
559 aa  813  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  100 
 
 
542 aa  1119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  99.82 
 
 
542 aa  1118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  67.67 
 
 
545 aa  758  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  2.01606e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  87.71 
 
 
545 aa  978  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1691  glucan biosynthesis protein G  67.9 
 
 
540 aa  775  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.0773488 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  100 
 
 
542 aa  1119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.09795e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  87.71 
 
 
545 aa  978  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  88.07 
 
 
545 aa  980  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  50.32 
 
 
495 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  49.06 
 
 
503 aa  460  1e-128  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  49.37 
 
 
503 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  47.81 
 
 
498 aa  453  1e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  44.11 
 
 
519 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1302  glucan biosynthesis protein G  44.95 
 
 
530 aa  416  1e-115  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3126  glucan biosynthesis protein G  42.67 
 
 
525 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.213498  normal  0.0516686 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1534  glucan biosynthesis protein G  46.15 
 
 
508 aa  409  1e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3200  glucan biosynthesis protein G  45.78 
 
 
504 aa  405  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421618  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2046  glucan biosynthesis protein G  45.42 
 
 
539 aa  402  1e-110  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324147  normal  0.558823 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  44.01 
 
 
519 aa  396  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2007  glucan biosynthesis protein G  45.36 
 
 
545 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2321  glucan biosynthesis protein G  44.72 
 
 
539 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  0.314726 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  41.68 
 
 
534 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0593  glucan biosynthesis protein D  42.24 
 
 
522 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  1.24621e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2353  glucan biosynthesis protein G  42.26 
 
 
527 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0646222  hitchhiker  1.02725e-08 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2425  glucan biosynthesis protein G  42.26 
 
 
527 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0750815  hitchhiker  0.00489845 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2336  glucan biosynthesis protein G  40.77 
 
 
529 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  43.22 
 
 
514 aa  383  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2514  glucan biosynthesis protein G  42.47 
 
 
526 aa  385  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0712053  hitchhiker  2.45442e-09 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1785  glucan biosynthesis protein D  41.72 
 
 
531 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000307117  hitchhiker  1.92926e-09 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  42.68 
 
 
532 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2731  glucan biosynthesis protein G  40.88 
 
 
528 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2674  glucan biosynthesis protein D  41.72 
 
 
527 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0237308  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2597  glucan biosynthesis protein D  41.72 
 
 
529 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  6.17652e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2559  glucan biosynthesis protein G  41.72 
 
 
529 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.72513e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  43.06 
 
 
504 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  42.36 
 
 
542 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  41.82 
 
 
530 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  42.83 
 
 
597 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  41.41 
 
 
520 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  42.83 
 
 
558 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  6.29377e-06  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1804  glucan biosynthesis protein D  41.46 
 
 
536 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  41.43 
 
 
534 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  42.83 
 
 
594 aa  368  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  42.19 
 
 
568 aa  368  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  42.62 
 
 
604 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  7.32267e-06  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  40.71 
 
 
546 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  42.83 
 
 
604 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  3.74583e-05  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1314  glucan biosynthesis protein G  42.12 
 
 
532 aa  364  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327506  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1583  glucan biosynthesis protein G  42.12 
 
 
532 aa  364  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00561497 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  42.19 
 
 
608 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  2.42416e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  41.32 
 
 
525 aa  365  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  42.19 
 
 
562 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.43395e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  42.19 
 
 
562 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.8825e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  42.19 
 
 
562 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  3.23201e-05  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  42.02 
 
 
528 aa  363  5e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0710  glucan biosynthesis protein D  41.39 
 
 
530 aa  362  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  41.79 
 
 
533 aa  360  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  39.54 
 
 
588 aa  359  6e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  39.43 
 
 
511 aa  355  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  39.43 
 
 
517 aa  355  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  39.43 
 
 
511 aa  355  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  39.43 
 
 
511 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  40.79 
 
 
534 aa  355  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  39.43 
 
 
511 aa  355  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  39.43 
 
 
517 aa  355  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01045  glucan biosynthesis protein, periplasmic  39.22 
 
 
511 aa  353  3e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0678082  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  39.22 
 
 
511 aa  353  3e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  39.22 
 
 
517 aa  353  4e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  4.03052e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  40.24 
 
 
534 aa  353  6e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0377  glucan biosynthesis protein G  38.57 
 
 
642 aa  352  9e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713899  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3996  glucan biosynthesis protein G  39.84 
 
 
536 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00021174  normal  0.469553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  39.22 
 
 
533 aa  351  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  8.05878e-05  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  39.55 
 
 
517 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  40.16 
 
 
505 aa  350  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5503  glucan biosynthesis protein D  40.12 
 
 
562 aa  350  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545727  normal  0.294343 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  39.34 
 
 
517 aa  349  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  39.34 
 
 
517 aa  349  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  39.34 
 
 
517 aa  349  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  39.34 
 
 
517 aa  349  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  3.31819e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  39.34 
 
 
525 aa  349  8e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  39.34 
 
 
525 aa  349  8e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4900  glucan biosynthesis protein G  40.21 
 
 
579 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.766057 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  38.1 
 
 
530 aa  348  2e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1570  glucan biosynthesis protein G  39.51 
 
 
522 aa  347  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45510  glucan biosynthesis protein D  39.75 
 
 
517 aa  347  4e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104074  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5026  glucan biosynthesis protein G  40.21 
 
 
559 aa  347  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2828  glucan biosynthesis protein G  40.04 
 
 
522 aa  346  5e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0373  glucan biosynthesis protein G  38.45 
 
 
604 aa  346  7e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999536  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  39.6 
 
 
560 aa  346  7e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0439  glucan biosynthesis protein G  39.79 
 
 
579 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.529505  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5162  periplasmic glucan biosynthesis protein  38.16 
 
 
641 aa  343  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1824  glucan biosynthesis protein D  39.57 
 
 
547 aa  343  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.123731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2523  glucan biosynthesis protein G  39.43 
 
 
522 aa  343  5e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586165  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  38.34 
 
 
537 aa  342  8e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1604  glucan biosynthesis protein G  38.73 
 
 
522 aa  342  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1870  glucan biosynthesis protein G  38.73 
 
 
522 aa  341  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.698965 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>