293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1881 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1881  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
147 aa  303  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00734553  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1888  protein tyrosine phosphatase  95.24 
 
 
160 aa  290  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2438  protein tyrosine phosphatase  97.1 
 
 
155 aa  280  4e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.203246  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1854  protein tyrosine phosphatase  91.84 
 
 
160 aa  279  8e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1749  protein tyrosine phosphatase  85.92 
 
 
160 aa  258  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2399  protein tyrosine phosphatase  83.8 
 
 
171 aa  249  6e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2189  protein tyrosine phosphatase  82.39 
 
 
171 aa  247  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.810234  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2266  protein tyrosine phosphatase  82.39 
 
 
167 aa  245  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2208  phosphotyrosine protein phosphatase  79.58 
 
 
171 aa  239  6e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0559  phosphotyrosine protein phosphatase  60.96 
 
 
155 aa  196  7e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00747923  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  65.96 
 
 
149 aa  192  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  62.41 
 
 
158 aa  189  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1485  protein tyrosine phosphatase  65.73 
 
 
161 aa  187  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02921  hypothetical protein  60.99 
 
 
149 aa  186  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  64.08 
 
 
154 aa  184  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2028  protein tyrosine phosphatase  59.18 
 
 
160 aa  182  1e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2307  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  62.04 
 
 
161 aa  180  6e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.224234  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2509  protein tyrosine phosphatase  59.06 
 
 
162 aa  174  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  56.03 
 
 
157 aa  171  3e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  54.61 
 
 
163 aa  166  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  52.82 
 
 
155 aa  149  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  50.67 
 
 
160 aa  145  2e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  52.08 
 
 
160 aa  145  2e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  49.33 
 
 
162 aa  144  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  52.08 
 
 
160 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  52.08 
 
 
160 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  49.66 
 
 
165 aa  143  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  52.08 
 
 
160 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  51.01 
 
 
166 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  52.05 
 
 
160 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  52.41 
 
 
165 aa  141  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  50.7 
 
 
154 aa  139  1e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  51.05 
 
 
154 aa  138  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  51.01 
 
 
159 aa  137  5e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  51.03 
 
 
182 aa  135  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  51.05 
 
 
154 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  50.35 
 
 
154 aa  132  1e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  50.69 
 
 
164 aa  133  1e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  50.69 
 
 
164 aa  133  1e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  50.69 
 
 
164 aa  133  1e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  50.69 
 
 
159 aa  132  1e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  50.69 
 
 
159 aa  132  1e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  50.69 
 
 
164 aa  133  1e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  50.69 
 
 
164 aa  133  1e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  48.23 
 
 
163 aa  132  2e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  47.92 
 
 
157 aa  132  2e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  48.61 
 
 
160 aa  131  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  44.29 
 
 
155 aa  129  1e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  48.23 
 
 
161 aa  129  2e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17121  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  49.66 
 
 
155 aa  128  2e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.871196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  49.31 
 
 
163 aa  128  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  49.31 
 
 
159 aa  127  4e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  44.97 
 
 
165 aa  124  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2038  protein tyrosine phosphatase  51.24 
 
 
137 aa  123  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326657  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  43.4 
 
 
175 aa  123  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  44.67 
 
 
188 aa  122  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  44.3 
 
 
165 aa  120  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  44.97 
 
 
175 aa  119  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  44.97 
 
 
165 aa  119  2e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  44.67 
 
 
166 aa  117  4e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.33 
 
 
159 aa  117  5e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  49.65 
 
 
154 aa  117  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  45.45 
 
 
154 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  45.45 
 
 
154 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  44.76 
 
 
154 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  3.52137e-07 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  50.68 
 
 
164 aa  114  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  44.76 
 
 
154 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  43.62 
 
 
157 aa  114  4e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.62 
 
 
157 aa  114  4e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  43.57 
 
 
162 aa  114  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  47.01 
 
 
162 aa  114  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  45.21 
 
 
164 aa  114  6e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  45.99 
 
 
152 aa  113  7e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  42.36 
 
 
158 aa  112  1e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  48.23 
 
 
164 aa  112  2e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  41.5 
 
 
173 aa  112  2e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1328  protein tyrosine phosphatase  42.07 
 
 
154 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  45.75 
 
 
159 aa  111  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.18 
 
 
154 aa  111  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  42.96 
 
 
161 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  44.37 
 
 
151 aa  110  7e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1422  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
154 aa  109  1e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  43.97 
 
 
162 aa  109  1e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  44.37 
 
 
166 aa  108  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  42.66 
 
 
157 aa  107  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.96 
 
 
159 aa  107  7e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0082  phosphotyrosine protein phosphatase  39.42 
 
 
201 aa  107  7e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 
166 aa  107  7e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0083  phosphotyrosine protein phosphatase  39.42 
 
 
201 aa  107  7e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  43.94 
 
 
172 aa  107  8e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  46.62 
 
 
158 aa  106  8e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2154  protein tyrosine phosphatase  40.69 
 
 
158 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.657607  normal  0.32914 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0463  protein tyrosine phosphatase  43.15 
 
 
163 aa  105  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0095  protein tyrosine phosphatase  39.42 
 
 
173 aa  104  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  41.96 
 
 
159 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  41.26 
 
 
159 aa  103  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17781  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.36 
 
 
157 aa  103  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.214222  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2842  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.67 
 
 
186 aa  103  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.998077  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2323  protein tyrosine phosphatase  41.72 
 
 
157 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0989989  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  42.36 
 
 
164 aa  103  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>