More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1834 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  99.7 
 
 
328 aa  675  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.33826e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  99.7 
 
 
328 aa  676  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  2.88725e-07  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  99.7 
 
 
328 aa  675  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  100 
 
 
328 aa  677  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.58771e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  95.62 
 
 
331 aa  630  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  98.05 
 
 
338 aa  627  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  98.05 
 
 
330 aa  625  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  98.05 
 
 
336 aa  626  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  93.83 
 
 
336 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  91.23 
 
 
309 aa  583  1e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  3.04708e-06  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  35.48 
 
 
301 aa  185  8e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  36.43 
 
 
301 aa  184  2e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  37.01 
 
 
302 aa  184  2e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  37.01 
 
 
302 aa  184  2e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  35.84 
 
 
290 aa  183  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  39.01 
 
 
301 aa  183  4e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  5.79629e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  36.56 
 
 
302 aa  183  4e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  36.93 
 
 
299 aa  182  5e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  36.04 
 
 
301 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  37.37 
 
 
302 aa  180  3e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  36.07 
 
 
301 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  37.01 
 
 
302 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  35.82 
 
 
301 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.19851e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  35.82 
 
 
301 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.91941e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  35.82 
 
 
301 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.34298e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.82 
 
 
301 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  2.56532e-09  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  35.82 
 
 
301 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.26065e-07  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  35.46 
 
 
299 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  34.04 
 
 
301 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.47156e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  35.46 
 
 
299 aa  176  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  8.6692e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  35.46 
 
 
299 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.23784e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  34.29 
 
 
301 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  1.03664e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  35.46 
 
 
299 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  2.25359e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  36.2 
 
 
301 aa  176  6e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  2.59145e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  36.92 
 
 
301 aa  176  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  34.29 
 
 
298 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  32.63 
 
 
456 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  9.8482e-06  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  37.87 
 
 
459 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  6.50409e-07  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  34.4 
 
 
307 aa  171  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  34.16 
 
 
301 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  34.04 
 
 
301 aa  170  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  36.07 
 
 
301 aa  170  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.63 
 
 
302 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  33.81 
 
 
301 aa  169  6e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  33.81 
 
 
301 aa  169  6e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  35.84 
 
 
302 aa  169  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1643  alpha-L-glutamate ligase  34.88 
 
 
300 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.22 
 
 
300 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  35.84 
 
 
301 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.01 
 
 
411 aa  167  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  35.23 
 
 
301 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  35.23 
 
 
301 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  33.7 
 
 
286 aa  166  3e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  35.25 
 
 
301 aa  167  3e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  33.33 
 
 
301 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  1.25802e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  33.33 
 
 
301 aa  166  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5981  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.93 
 
 
301 aa  166  6e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  34.89 
 
 
305 aa  166  6e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  33.93 
 
 
302 aa  164  2e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.05 
 
 
301 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  33.78 
 
 
302 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  5.13891e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  33.09 
 
 
301 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  7.78733e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  34.16 
 
 
301 aa  164  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  37.82 
 
 
301 aa  163  4e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  33.93 
 
 
301 aa  163  4e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0655  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.22 
 
 
299 aa  163  4e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.922088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  34.17 
 
 
303 aa  162  5e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  31.53 
 
 
310 aa  162  5e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  34.3 
 
 
300 aa  162  9e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  34.3 
 
 
300 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  34.3 
 
 
300 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.155924 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  34.3 
 
 
300 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.3 
 
 
300 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  34.3 
 
 
300 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  34.3 
 
 
300 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  34.3 
 
 
300 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  35.02 
 
 
300 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  33.81 
 
 
301 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.88 
 
 
300 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  33.45 
 
 
303 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  34.3 
 
 
300 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  31.93 
 
 
458 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  32.37 
 
 
301 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0173  S6 modification enzyme RimK  33.81 
 
 
301 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.81 
 
 
301 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  34.42 
 
 
301 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.01 
 
 
300 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4964  alpha-L-glutamate ligase  33.45 
 
 
301 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000940925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  33.45 
 
 
301 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  33.57 
 
 
301 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  33.57 
 
 
301 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.45 
 
 
301 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  35.86 
 
 
471 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0273  alpha-L-glutamate ligase  33.45 
 
 
301 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0546  ribosomal protein S6 modification protein  33.57 
 
 
301 aa  156  5e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0545  alpha-L-glutamate ligase  33.21 
 
 
301 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  34.66 
 
 
300 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.73 
 
 
292 aa  153  3e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  34.66 
 
 
300 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  34.66 
 
 
300 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>