More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1794 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  88.98 
 
 
729 aa  1329  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  7.50921e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  90.57 
 
 
732 aa  1372  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  73.85 
 
 
736 aa  1117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  98.25 
 
 
743 aa  1504  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  77.21 
 
 
757 aa  1200  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  71.02 
 
 
729 aa  1090  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  73.3 
 
 
712 aa  1091  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  2.26653e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  98.25 
 
 
744 aa  1508  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  2.23864e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  73.57 
 
 
713 aa  1107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  64.58 
 
 
744 aa  959  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  89.46 
 
 
733 aa  1311  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  68.74 
 
 
730 aa  1047  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  74.04 
 
 
733 aa  1134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  100 
 
 
744 aa  1533  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  5.83553e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  78.86 
 
 
748 aa  1201  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  98.79 
 
 
743 aa  1513  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  41.2 
 
 
697 aa  511  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  39.83 
 
 
726 aa  488  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1344  TonB-dependent receptor  35.06 
 
 
687 aa  405  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341297  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3405  outer membrane protein  33.52 
 
 
714 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.411389  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02805  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 
696 aa  336  1e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00354555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 
853 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 
851 aa  227  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 
690 aa  205  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 
690 aa  205  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 
720 aa  194  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 
695 aa  186  2e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 
729 aa  181  5e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  24.86 
 
 
715 aa  179  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 
713 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 
687 aa  178  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 
728 aa  177  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 
783 aa  174  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 
732 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 
720 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 
747 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  25.97 
 
 
767 aa  167  7e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 
763 aa  166  1e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 
773 aa  166  2e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 
755 aa  165  2e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 
704 aa  164  5e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25 
 
 
761 aa  164  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 
764 aa  160  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 
765 aa  158  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 
734 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 
771 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 
803 aa  156  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25 
 
 
794 aa  154  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 
759 aa  154  6e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 
753 aa  153  9e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 
702 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  5.40128e-05  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 
773 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 
737 aa  152  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 
712 aa  152  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 
695 aa  151  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  8.98905e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 
710 aa  150  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 
641 aa  150  1e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 
762 aa  149  2e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 
686 aa  148  4e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 
732 aa  147  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 
700 aa  147  7e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.9 
 
 
755 aa  147  8e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 
741 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 
775 aa  144  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 
783 aa  144  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 
743 aa  143  1e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 
763 aa  143  1e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  1.21747e-10  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 
731 aa  142  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 
726 aa  140  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  23.64 
 
 
776 aa  140  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 
790 aa  140  8e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 
749 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  3.58025e-10  decreased coverage  1.02915e-05 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 
795 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 
723 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 
769 aa  139  3e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 
764 aa  138  3e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  3.45148e-11  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  24.61 
 
 
799 aa  138  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 
724 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 
769 aa  138  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 
792 aa  138  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  24.34 
 
 
692 aa  137  7e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 
753 aa  137  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 
778 aa  136  1e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 
790 aa  137  1e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 
733 aa  136  1e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 
670 aa  136  1e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  22.46 
 
 
761 aa  136  1e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 
751 aa  135  2e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  8.75615e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 
746 aa  136  2e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 
761 aa  135  2e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 
694 aa  135  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 
771 aa  134  7e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  24.53 
 
 
771 aa  134  8e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 
741 aa  133  1e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 
778 aa  133  1e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 
802 aa  133  2e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  23.66 
 
 
751 aa  132  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  2.21173e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 
722 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 
794 aa  131  4e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  9.82846e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 
764 aa  131  4e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>