More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1777 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1649  uracil-xanthine permease  94.71 
 
 
412 aa  739  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00322133  hitchhiker  0.000377571 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1689  uracil-xanthine permease  95.43 
 
 
412 aa  739  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  5.78916e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1836  uracil-xanthine permease  86.31 
 
 
411 aa  666  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0253304  normal  0.750298 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2443  uracil-xanthine permease  85.19 
 
 
408 aa  663  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.161391  normal  0.0740726 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1965  uracil-xanthine permease  83.17 
 
 
418 aa  658  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1784  uracil-xanthine permease  100 
 
 
416 aa  813  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.26712e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1821  uracil-xanthine permease  99.28 
 
 
416 aa  810  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  6.47194e-05  normal  0.178091 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1641  uracil-xanthine permease  94.95 
 
 
412 aa  739  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  7.40931e-05  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2879  uracil permease  94.95 
 
 
412 aa  738  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1641  uracil-xanthine permease  84.37 
 
 
407 aa  644  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  9.23826e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1777  uracil-xanthine permease  100 
 
 
416 aa  813  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.63317e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2501  uracil-xanthine permease  99.52 
 
 
416 aa  810  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.61239e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1574  uracil-xanthine permease  94.71 
 
 
412 aa  739  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000671953  normal  0.0882987 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1749  uracil-xanthine permease  85.82 
 
 
409 aa  696  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  2.46667e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2162  uracil-xanthine permease  84.3 
 
 
415 aa  665  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1918  uracil-xanthine permease  83.46 
 
 
409 aa  622  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00881195  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2388  uracil permease  72.37 
 
 
416 aa  585  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03198  hypothetical protein  72.93 
 
 
417 aa  582  1e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002783  uracil permease  74.05 
 
 
417 aa  583  1e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1749  uracil permease  73.28 
 
 
417 aa  580  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.425461  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1629  uracil-xanthine permease  71.97 
 
 
427 aa  578  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0348661 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4298  uracil-xanthine permease  72.18 
 
 
411 aa  567  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0402809 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1449  uracil-xanthine permease  65.6 
 
 
414 aa  533  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5296  uracil permease  64.01 
 
 
427 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61480  uracil permease  63.77 
 
 
427 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.202144 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0786  uracil-xanthine permease  63.59 
 
 
424 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0745  uracil-xanthine permease  64.15 
 
 
421 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0773  uracil-xanthine permease  64.15 
 
 
421 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0968  xanthine/uracil permease family protein  63.11 
 
 
425 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4444  uracil-xanthine permease  64.04 
 
 
421 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.586178  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4729  xanthine/uracil permease  63.81 
 
 
424 aa  519  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.667812  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1129  uracil transporter  64.29 
 
 
406 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0766553  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0464  uracil-xanthine permease  61.98 
 
 
425 aa  508  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.774472  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1980  uracil-xanthine permease  65.15 
 
 
418 aa  511  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472534  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0945  uracil-xanthine permease  66.92 
 
 
420 aa  509  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4318  uracil permease  62.65 
 
 
441 aa  509  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0481  uracil-xanthine permease  61.98 
 
 
425 aa  508  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6216e-14 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0932  uracil permease  61.39 
 
 
416 aa  498  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.87035  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0996  uracil-xanthine permease  62.84 
 
 
411 aa  488  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.594707  hitchhiker  0.00519474 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2088  uracil-xanthine permease  61.15 
 
 
412 aa  482  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0672  uracil-xanthine permease  60.1 
 
 
415 aa  480  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1077  uracil-xanthine permease  61.69 
 
 
425 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1967  uracil-xanthine permease  60.1 
 
 
419 aa  481  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.522211  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0212  uracil permease  61.52 
 
 
417 aa  476  1e-133  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0419  permease subfamily protein  59.2 
 
 
411 aa  462  1e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2248  uracil-xanthine permease  57.91 
 
 
421 aa  461  1e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00954559  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0593  uracil permease (Uracil transporter)  59 
 
 
412 aa  460  1e-128  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0341896  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1342  uracil permease  62.37 
 
 
413 aa  461  1e-128  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00369344  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0997  uracil-xanthine permease  58.85 
 
 
419 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1126  uracil permease  50.51 
 
 
395 aa  381  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.930887 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2371  uracil-xanthine permease  50.39 
 
 
409 aa  362  9e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  1.54937e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1091  uracil-xanthine permease  47.89 
 
 
415 aa  350  3e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.977585  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3717  uracil-xanthine permease  45.59 
 
 
430 aa  338  1e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000736051  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2539  uracil-xanthine permease  46.06 
 
 
427 aa  336  4e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.467539  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09360  uracil-xanthine permease  48.95 
 
 
433 aa  335  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0066  uracil-xanthine permease  46.56 
 
 
403 aa  335  1e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00626483  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3632  uracil permease  45.07 
 
 
438 aa  334  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00702826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3940  uracil permease  45.07 
 
 
427 aa  334  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.67046e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3904  uracil permease  45.07 
 
 
427 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5728e-09 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3989  uracil permease  44.83 
 
 
427 aa  333  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000553719  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1252  uracil permease  44.83 
 
 
427 aa  332  6e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3741  uracil permease  44.83 
 
 
438 aa  332  7e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  7.79766e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3649  uracil permease  44.83 
 
 
438 aa  332  7e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  5.13504e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4029  uracil permease  44.83 
 
 
427 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000132234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3935  uracil permease  44.83 
 
 
427 aa  332  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00303419  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1089  uracil-xanthine permease  46.56 
 
 
430 aa  329  4e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.55646e-09  hitchhiker  0.00900914 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0108  uracil-xanthine permease  45.64 
 
 
399 aa  318  1e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0107  uracil-xanthine permease  45.64 
 
 
399 aa  318  1e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.681241  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1258  uracil permease  43.63 
 
 
435 aa  317  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1283  uracil permease  43.63 
 
 
435 aa  317  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.296835  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0765  uracil permease  44.17 
 
 
430 aa  305  8e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1913  uracil-xanthine permease  46.14 
 
 
432 aa  304  2e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0606  uracil-xanthine permease  43.36 
 
 
403 aa  304  2e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  1.6937e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0054  uracil-xanthine permease  45.21 
 
 
432 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0429  uracil-xanthine permease  42.5 
 
 
447 aa  300  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.36785e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0058  uracil-xanthine permease  45.21 
 
 
432 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0070  uracil-xanthine permease  45.21 
 
 
432 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1422  uracil-xanthine permease  42.37 
 
 
436 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0087754  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1232  uracil permease  42.37 
 
 
436 aa  297  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.011581  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1043  uracil-xanthine permease  44.42 
 
 
434 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000103466  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3185  uracil transporter  40.25 
 
 
429 aa  286  3e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  38.5 
 
 
423 aa  287  3e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0056  uracil-xanthine permease  44.8 
 
 
434 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.21167 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1374  uracil-xanthine permease  41.09 
 
 
457 aa  286  5e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1131  uracil transporter  40 
 
 
429 aa  286  7e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1891  uracil-xanthine permease  43.49 
 
 
394 aa  283  4e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06450  uracil-xanthine permease  38.46 
 
 
469 aa  282  8e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.285171  normal  0.461399 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  40.1 
 
 
429 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0460  uracil-xanthine permease  39.15 
 
 
423 aa  276  5e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  1.62343e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2871  uracil transporter  38.8 
 
 
429 aa  275  1e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.930138  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2734  uracil transporter  38.66 
 
 
429 aa  275  1e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2644  uracil transporter  38.66 
 
 
429 aa  275  1e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00659887  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02351  hypothetical protein  38.55 
 
 
429 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0648684  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02389  uracil transporter  38.55 
 
 
429 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1179  uracil transporter  38.55 
 
 
429 aa  273  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0295094 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3719  uracil transporter  38.55 
 
 
429 aa  273  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.237871  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2632  uracil transporter  38.55 
 
 
429 aa  273  3e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0764486  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1172  uracil-xanthine permease  38.55 
 
 
429 aa  273  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0250381  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2780  uracil transporter  38.55 
 
 
429 aa  273  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1317  uracil transporter  38.9 
 
 
422 aa  273  4e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.980977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>